RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596282.5

ZNF548-205, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

TSL 5

Gene ZNF548, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-205ENST00000596282 PRDM11Q9NQV5 511 aa16.11■□□□□ 0.17
ZNF548-205ENST00000596282 BRWD3Q6RI45 1802 aa16.1■□□□□ 0.17
ZNF548-205ENST00000596282 CDK19Q9BWU1 502 aa16.1■□□□□ 0.17
ZNF548-205ENST00000596282 ALS2Q96Q42 1657 aa16.1■□□□□ 0.17
ZNF548-205ENST00000596282 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
ZNF548-205ENST00000596282 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
ZNF548-205ENST00000596282 ATP7BP35670 1465 aa16.08■□□□□ 0.16
ZNF548-205ENST00000596282 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa16.07■□□□□ 0.16
ZNF548-205ENST00000596282 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
ZNF548-205ENST00000596282 DEFB132Q7Z7B7 95 aa16.06■□□□□ 0.16
ZNF548-205ENST00000596282 CCDC61Q9Y6R9 512 aa16.06■□□□□ 0.16
ZNF548-205ENST00000596282 NRAPQ86VF7 1730 aa16.05■□□□□ 0.16
ZNF548-205ENST00000596282 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
ZNF548-205ENST00000596282 NUTM2GQ5VZR2 741 aa16.05■□□□□ 0.16
ZNF548-205ENST00000596282 STRN4Q9NRL3 753 aa16.05■□□□□ 0.16
ZNF548-205ENST00000596282 ACEP12821 1306 aa16.04■□□□□ 0.16
ZNF548-205ENST00000596282 BAG6P46379 1132 aa16.04■□□□□ 0.16
ZNF548-205ENST00000596282 KIAA0232Q92628 1395 aa16.03■□□□□ 0.16
ZNF548-205ENST00000596282 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
ZNF548-205ENST00000596282 EVA1CP58658 441 aa16.03■□□□□ 0.16
ZNF548-205ENST00000596282 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
ZNF548-205ENST00000596282 CHRNA2Q15822 529 aa16.03■□□□□ 0.16
ZNF548-205ENST00000596282 NBPF1Q3BBV0 1214 aa16.03■□□□□ 0.16
ZNF548-205ENST00000596282 ABTB2Q8N961 1025 aa16.03■□□□□ 0.16
ZNF548-205ENST00000596282 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa16.02■□□□□ 0.16
ZNF548-205ENST00000596282 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa16.02■□□□□ 0.16
ZNF548-205ENST00000596282 NBPF8Q3BBV2 869 aa16.02■□□□□ 0.16
ZNF548-205ENST00000596282 EP400Q96L91 3159 aa16.01■□□□□ 0.15
ZNF548-205ENST00000596282 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa16.01■□□□□ 0.15
ZNF548-205ENST00000596282 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa16.01■□□□□ 0.15
ZNF548-205ENST00000596282 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
ZNF548-205ENST00000596282 USP35Q9P2H5 1018 aa16■□□□□ 0.15
ZNF548-205ENST00000596282 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa16■□□□□ 0.15
ZNF548-205ENST00000596282 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
ZNF548-205ENST00000596282 PLEKHG3A1L390 1219 aa15.99■□□□□ 0.15
ZNF548-205ENST00000596282 CABP2Q9NPB3 220 aa15.99■□□□□ 0.15
ZNF548-205ENST00000596282 ZBTB7CA1YPR0 619 aa15.98■□□□□ 0.15
ZNF548-205ENST00000596282 FAM182BQ5T319 152 aa15.98■□□□□ 0.15
ZNF548-205ENST00000596282 NLRP13Q86W25 1043 aa15.98■□□□□ 0.15
ZNF548-205ENST00000596282 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa15.97■□□□□ 0.15
ZNF548-205ENST00000596282 NEUROD1Q13562 356 aa15.97■□□□□ 0.15
ZNF548-205ENST00000596282 QRICH2Q9H0J4 1663 aa15.97■□□□□ 0.15
ZNF548-205ENST00000596282 RGPD1P0DJD0 1748 aa15.96■□□□□ 0.15
ZNF548-205ENST00000596282 L3MBTL2Q969R5 705 aa15.95■□□□□ 0.14
ZNF548-205ENST00000596282 EVC2Q86UK5 1308 aa15.94■□□□□ 0.14
ZNF548-205ENST00000596282 PDE3BQ13370 1112 aa15.94■□□□□ 0.14
ZNF548-205ENST00000596282 NRKQ7Z2Y5 1582 aa15.94■□□□□ 0.14
ZNF548-205ENST00000596282 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa15.94■□□□□ 0.14
ZNF548-205ENST00000596282 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
ZNF548-205ENST00000596282 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
ZNF548-205ENST00000596282 NLRP6P59044 892 aa15.93■□□□□ 0.14
ZNF548-205ENST00000596282 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
ZNF548-205ENST00000596282 FAM196AQ6ZSG2 479 aa15.93■□□□□ 0.14
ZNF548-205ENST00000596282 CABP1Q9NZU7 370 aa15.93■□□□□ 0.14
ZNF548-205ENST00000596282 SSH2Q76I76 1423 aa15.93■□□□□ 0.14
ZNF548-205ENST00000596282 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
ZNF548-205ENST00000596282 SIN3AQ96ST3 1273 aa15.92■□□□□ 0.14
ZNF548-205ENST00000596282 USP19O94966 1318 aa15.92■□□□□ 0.14
ZNF548-205ENST00000596282 CPDO75976 1380 aa15.91■□□□□ 0.14
ZNF548-205ENST00000596282 GCP02774 474 aa15.91■□□□□ 0.14
ZNF548-205ENST00000596282 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
ZNF548-205ENST00000596282 TCP11L2Q8N4U5 519 aa15.91■□□□□ 0.14
ZNF548-205ENST00000596282 TRIM37O94972 964 aa15.9■□□□□ 0.14
ZNF548-205ENST00000596282 BARGINQ6ZT62 677 aa15.9■□□□□ 0.14
ZNF548-205ENST00000596282 USP6P35125 1406 aa15.9■□□□□ 0.14
ZNF548-205ENST00000596282 APBA3O96018 575 aa15.89■□□□□ 0.13
ZNF548-205ENST00000596282 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa15.89■□□□□ 0.13
ZNF548-205ENST00000596282 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa15.89■□□□□ 0.13
ZNF548-205ENST00000596282 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
ZNF548-205ENST00000596282 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa15.88■□□□□ 0.13
ZNF548-205ENST00000596282 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
ZNF548-205ENST00000596282 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
ZNF548-205ENST00000596282 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
ZNF548-205ENST00000596282 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
ZNF548-205ENST00000596282 LMO7Q8WWI1 1683 aa15.86■□□□□ 0.13
ZNF548-205ENST00000596282 SOX12O15370 315 aa15.85■□□□□ 0.13
ZNF548-205ENST00000596282 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa15.85■□□□□ 0.13
ZNF548-205ENST00000596282 DISP2A7MBM2 1401 aa15.85■□□□□ 0.13
ZNF548-205ENST00000596282 CRB1P82279 1406 aa15.85■□□□□ 0.13
ZNF548-205ENST00000596282 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
ZNF548-205ENST00000596282 LRP5O75197 1615 aa15.84■□□□□ 0.13
ZNF548-205ENST00000596282 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa15.84■□□□□ 0.13
ZNF548-205ENST00000596282 KCNH5Q8NCM2 988 aa15.84■□□□□ 0.13
ZNF548-205ENST00000596282 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.12
ZNF548-205ENST00000596282 AATKQ6ZMQ8 1374 aa15.83■□□□□ 0.12
ZNF548-205ENST00000596282 PARD3Q8TEW0 1356 aa15.83■□□□□ 0.12
ZNF548-205ENST00000596282 NBPF14Q5TI25 921 aa15.82■□□□□ 0.12
ZNF548-205ENST00000596282 CARD11Q9BXL7 1154 aa15.82■□□□□ 0.12
ZNF548-205ENST00000596282 SLIT3O75094 1523 aa15.82■□□□□ 0.12
ZNF548-205ENST00000596282 PIK3C2AO00443 1686 aa15.81■□□□□ 0.12
ZNF548-205ENST00000596282 DDB1Q16531 1140 aa15.81■□□□□ 0.12
ZNF548-205ENST00000596282 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa15.81■□□□□ 0.12
ZNF548-205ENST00000596282 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP15.81■□□□□ 0.12
ZNF548-205ENST00000596282 TTC21AQ8NDW8 1320 aa15.81■□□□□ 0.12
ZNF548-205ENST00000596282 TONSLQ96HA7 1378 aa15.81■□□□□ 0.12
ZNF548-205ENST00000596282 CAMKK2Q96RR4 588 aa15.81■□□□□ 0.12
ZNF548-205ENST00000596282 TMC1Q8TDI8 760 aa15.8■□□□□ 0.12
ZNF548-205ENST00000596282 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
ZNF548-205ENST00000596282 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa15.79■□□□□ 0.12
ZNF548-205ENST00000596282 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.3 ms