RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588315.5

SLC25A39-210, Transcript of solute carrier family 25 member 39, humanhuman

TSL 2

Gene SLC25A39, Length 1,409 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A39-210ENST00000588315 NINLQ9Y2I6 1382 aa28.53■■■□□ 2.16
SLC25A39-210ENST00000588315 CABLES1Q8TDN4 633 aa28.52■■■□□ 2.16
SLC25A39-210ENST00000588315 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP28.51■■■□□ 2.15
SLC25A39-210ENST00000588315 ALS2Q96Q42 1657 aa28.5■■■□□ 2.15
SLC25A39-210ENST00000588315 ARHGEF10O15013 1369 aa28.5■■■□□ 2.15
SLC25A39-210ENST00000588315 ACEP12821 1306 aa28.49■■■□□ 2.15
SLC25A39-210ENST00000588315 LMOD2Q6P5Q4 547 aa28.49■■■□□ 2.15
SLC25A39-210ENST00000588315 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP28.48■■■□□ 2.15
SLC25A39-210ENST00000588315 CABP1Q9NZU7 370 aa28.48■■■□□ 2.15
SLC25A39-210ENST00000588315 PLEKHG5O94827 1062 aa28.47■■■□□ 2.15
SLC25A39-210ENST00000588315 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP28.47■■■□□ 2.15
SLC25A39-210ENST00000588315 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP28.46■■■□□ 2.15
SLC25A39-210ENST00000588315 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.15
SLC25A39-210ENST00000588315 ABCA3Q99758 1704 aa28.45■■■□□ 2.14
SLC25A39-210ENST00000588315 AKAP12Q02952 1782 aa28.45■■■□□ 2.14
SLC25A39-210ENST00000588315 USP21Q9UK80 565 aa28.44■■■□□ 2.14
SLC25A39-210ENST00000588315 BCL9LQ86UU0 1499 aa28.44■■■□□ 2.14
SLC25A39-210ENST00000588315 CD163L1Q9NR16 1453 aa28.44■■■□□ 2.14
SLC25A39-210ENST00000588315 USP6P35125 1406 aa28.44■■■□□ 2.14
SLC25A39-210ENST00000588315 RXRBP28702 533 aa28.43■■■□□ 2.14
SLC25A39-210ENST00000588315 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP28.42■■■□□ 2.14
SLC25A39-210ENST00000588315 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP28.41■■■□□ 2.14
SLC25A39-210ENST00000588315 MYOM1P52179 1685 aa28.41■■■□□ 2.14
SLC25A39-210ENST00000588315 MON2Q7Z3U7 1717 aa28.4■■■□□ 2.14
SLC25A39-210ENST00000588315 SSH2Q76I76 1423 aa28.4■■■□□ 2.14
SLC25A39-210ENST00000588315 NRKQ7Z2Y5 1582 aa28.4■■■□□ 2.14
SLC25A39-210ENST00000588315 SLIT2O94813 1529 aa28.4■■■□□ 2.14
SLC25A39-210ENST00000588315 ATRNO75882 1429 aa28.39■■■□□ 2.13
SLC25A39-210ENST00000588315 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa28.38■■■□□ 2.13
SLC25A39-210ENST00000588315 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa28.37■■■□□ 2.13
SLC25A39-210ENST00000588315 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP28.36■■■□□ 2.13
SLC25A39-210ENST00000588315 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
SLC25A39-210ENST00000588315 TMC1Q8TDI8 760 aa28.36■■■□□ 2.13
SLC25A39-210ENST00000588315 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP28.36■■■□□ 2.13
SLC25A39-210ENST00000588315 A0A1W2PP64 1363 aa28.36■■■□□ 2.13
SLC25A39-210ENST00000588315 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa28.36■■■□□ 2.13
SLC25A39-210ENST00000588315 TERF2IPQ9NYB0 399 aa28.35■■■□□ 2.13
SLC25A39-210ENST00000588315 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
SLC25A39-210ENST00000588315 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
SLC25A39-210ENST00000588315 FAM83GA6ND36 823 aa28.34■■■□□ 2.13
SLC25A39-210ENST00000588315 NUTM2GQ5VZR2 741 aa28.34■■■□□ 2.13
SLC25A39-210ENST00000588315 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
SLC25A39-210ENST00000588315 RGS12O14924 1447 aa28.33■■■□□ 2.13
SLC25A39-210ENST00000588315 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
SLC25A39-210ENST00000588315 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP28.32■■■□□ 2.12
SLC25A39-210ENST00000588315 UNC5CLQ8IV45 518 aa28.31■■■□□ 2.12
SLC25A39-210ENST00000588315 KIF7Q2M1P5 1343 aa28.3■■■□□ 2.12
SLC25A39-210ENST00000588315 TTC21AQ8NDW8 1320 aa28.3■■■□□ 2.12
SLC25A39-210ENST00000588315 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
SLC25A39-210ENST00000588315 PLCH1Q4KWH8 1693 aa28.29■■■□□ 2.12
SLC25A39-210ENST00000588315 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa28.27■■■□□ 2.12
SLC25A39-210ENST00000588315 ABTB2Q8N961 1025 aa28.27■■■□□ 2.12
SLC25A39-210ENST00000588315 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
SLC25A39-210ENST00000588315 PIK3C2AO00443 1686 aa28.26■■■□□ 2.12
SLC25A39-210ENST00000588315 CCDC7Q96M83 1385 aa28.26■■■□□ 2.11
SLC25A39-210ENST00000588315 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.11
SLC25A39-210ENST00000588315 USP54Q70EL1 1684 aa28.25■■■□□ 2.11
SLC25A39-210ENST00000588315 USP19O94966 1318 aa28.25■■■□□ 2.11
SLC25A39-210ENST00000588315 NWD2Q9ULI1 1742 aa28.25■■■□□ 2.11
SLC25A39-210ENST00000588315 GLI3P10071 1580 aa28.23■■■□□ 2.11
SLC25A39-210ENST00000588315 KIAA0232Q92628 1395 aa28.23■■■□□ 2.11
SLC25A39-210ENST00000588315 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
SLC25A39-210ENST00000588315 WASHC2AQ641Q2 1341 aa28.21■■■□□ 2.11
SLC25A39-210ENST00000588315 BTG4Q9NY30 223 aa28.21■■■□□ 2.11
SLC25A39-210ENST00000588315 NRAPQ86VF7 1730 aa28.21■■■□□ 2.11
SLC25A39-210ENST00000588315 VPS72Q15906 364 aa28.2■■■□□ 2.11
SLC25A39-210ENST00000588315 POLR3GLQ9BT43 218 aa28.2■■■□□ 2.11
SLC25A39-210ENST00000588315 USP31Q70CQ4 1352 aa28.2■■■□□ 2.1
SLC25A39-210ENST00000588315 SLIT3O75094 1523 aa28.19■■■□□ 2.1
SLC25A39-210ENST00000588315 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
SLC25A39-210ENST00000588315 PRDM11Q9NQV5 511 aa28.19■■■□□ 2.1
SLC25A39-210ENST00000588315 CHRNA2Q15822 529 aa28.18■■■□□ 2.1
SLC25A39-210ENST00000588315 NLRP13Q86W25 1043 aa28.18■■■□□ 2.1
SLC25A39-210ENST00000588315 NSD3Q9BZ95 1437 aa28.16■■■□□ 2.1
SLC25A39-210ENST00000588315 GCP02774 474 aa28.16■■■□□ 2.1
SLC25A39-210ENST00000588315 NLRP6P59044 892 aa28.16■■■□□ 2.1
SLC25A39-210ENST00000588315 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa28.16■■■□□ 2.1
SLC25A39-210ENST00000588315 OVOS2Q6IE36 1432 aa28.16■■■□□ 2.1
SLC25A39-210ENST00000588315 CPDO75976 1380 aa28.14■■■□□ 2.1
SLC25A39-210ENST00000588315 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP28.14■■■□□ 2.1
SLC25A39-210ENST00000588315 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP28.14■■■□□ 2.13e-6■□□□□ 8.7
SLC25A39-210ENST00000588315 CARD14Q9BXL6 1004 aa28.14■■■□□ 2.1
SLC25A39-210ENST00000588315 NME9Q86XW9 330 aa28.11■■■□□ 2.09
SLC25A39-210ENST00000588315 PANK3Q9H999 370 aa28.1■■■□□ 2.09
SLC25A39-210ENST00000588315 KIF20BQ96Q89 1820 aa28.1■■■□□ 2.09
SLC25A39-210ENST00000588315 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
SLC25A39-210ENST00000588315 LMO7Q8WWI1 1683 aa28.09■■■□□ 2.09
SLC25A39-210ENST00000588315 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa28.09■■■□□ 2.09
SLC25A39-210ENST00000588315 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
SLC25A39-210ENST00000588315 ZRANB1Q9UGI0 708 aa28.09■■■□□ 2.09
SLC25A39-210ENST00000588315 NFAT5O94916 1531 aa28.07■■■□□ 2.08
SLC25A39-210ENST00000588315 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa28.07■■■□□ 2.08
SLC25A39-210ENST00000588315 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa28.07■■■□□ 2.08
SLC25A39-210ENST00000588315 EP400Q96L91 3159 aa28.06■■■□□ 2.08
SLC25A39-210ENST00000588315 CGNL1Q0VF96 1302 aa28.06■■■□□ 2.08
SLC25A39-210ENST00000588315 FYB1O15117 783 aa28.06■■■□□ 2.08
SLC25A39-210ENST00000588315 KCNH5Q8NCM2 988 aa28.06■■■□□ 2.08
SLC25A39-210ENST00000588315 SEPT12Q8IYM1 358 aa28.05■■■□□ 2.08
SLC25A39-210ENST00000588315 NSD2O96028 1365 aa28.04■■■□□ 2.08
SLC25A39-210ENST00000588315 STRN4Q9NRL3 753 aa28.03■■■□□ 2.08
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