RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567434.5

CCNDBP1-211, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene CCNDBP1, Length 713 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-211ENST00000567434 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa24.33■■□□□ 1.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 ACEP12821 1306 aa24.33■■□□□ 1.48
CCNDBP1-211ENST00000567434 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
CCNDBP1-211ENST00000567434 BCL9LQ86UU0 1499 aa24.32■■□□□ 1.48
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLIT2O94813 1529 aa24.32■■□□□ 1.48
CCNDBP1-211ENST00000567434 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
CCNDBP1-211ENST00000567434 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
CCNDBP1-211ENST00000567434 CABLES1Q8TDN4 633 aa24.31■■□□□ 1.48
CCNDBP1-211ENST00000567434 CABP2Q9NPB3 220 aa24.31■■□□□ 1.48
CCNDBP1-211ENST00000567434 NWD2Q9ULI1 1742 aa24.27■■□□□ 1.48
CCNDBP1-211ENST00000567434 UNC5CLQ8IV45 518 aa24.27■■□□□ 1.48
CCNDBP1-211ENST00000567434 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa24.27■■□□□ 1.48
CCNDBP1-211ENST00000567434 ATAD2Q6PL18 1390 aa24.27■■□□□ 1.48
CCNDBP1-211ENST00000567434 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa24.27■■□□□ 1.48
CCNDBP1-211ENST00000567434 PCGF6Q9BYE7 350 aa24.26■■□□□ 1.47
CCNDBP1-211ENST00000567434 PLCH1Q4KWH8 1693 aa24.24■■□□□ 1.47
CCNDBP1-211ENST00000567434 PLEKHG5O94827 1062 aa24.23■■□□□ 1.47
CCNDBP1-211ENST00000567434 CABP1Q9NZU7 370 aa24.23■■□□□ 1.47
CCNDBP1-211ENST00000567434 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
CCNDBP1-211ENST00000567434 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
CCNDBP1-211ENST00000567434 USP6P35125 1406 aa24.21■■□□□ 1.47
CCNDBP1-211ENST00000567434 FAM83GA6ND36 823 aa24.2■■□□□ 1.46
CCNDBP1-211ENST00000567434 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
CCNDBP1-211ENST00000567434 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa24.2■■□□□ 1.46
CCNDBP1-211ENST00000567434 EP400Q96L91 3159 aa24.19■■□□□ 1.46
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLC24A1O60721 1099 aa24.19■■□□□ 1.46
CCNDBP1-211ENST00000567434 ABTB2Q8N961 1025 aa24.19■■□□□ 1.46
CCNDBP1-211ENST00000567434 VPS72Q15906 364 aa24.18■■□□□ 1.46
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
CCNDBP1-211ENST00000567434 USP19O94966 1318 aa24.16■■□□□ 1.46
CCNDBP1-211ENST00000567434 NLRP13Q86W25 1043 aa24.16■■□□□ 1.46
CCNDBP1-211ENST00000567434 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
CCNDBP1-211ENST00000567434 PRDM11Q9NQV5 511 aa24.16■■□□□ 1.46
CCNDBP1-211ENST00000567434 GLI3P10071 1580 aa24.16■■□□□ 1.46
CCNDBP1-211ENST00000567434 SSH2Q76I76 1423 aa24.15■■□□□ 1.46
CCNDBP1-211ENST00000567434 NRAPQ86VF7 1730 aa24.15■■□□□ 1.46
CCNDBP1-211ENST00000567434 BTG4Q9NY30 223 aa24.14■■□□□ 1.45
CCNDBP1-211ENST00000567434 AKAP12Q02952 1782 aa24.14■■□□□ 1.45
CCNDBP1-211ENST00000567434 NRKQ7Z2Y5 1582 aa24.13■■□□□ 1.45
CCNDBP1-211ENST00000567434 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
CCNDBP1-211ENST00000567434 NUTM2GQ5VZR2 741 aa24.13■■□□□ 1.45
CCNDBP1-211ENST00000567434 KIAA0232Q92628 1395 aa24.13■■□□□ 1.45
CCNDBP1-211ENST00000567434 CPDO75976 1380 aa24.11■■□□□ 1.45
CCNDBP1-211ENST00000567434 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa24.1■■□□□ 1.45
CCNDBP1-211ENST00000567434 CCDC125Q86Z20 511 aa24.1■■□□□ 1.45
CCNDBP1-211ENST00000567434 TTC21AQ8NDW8 1320 aa24.1■■□□□ 1.45
CCNDBP1-211ENST00000567434 TESK2Q96S53 571 aa24.09■■□□□ 1.45
CCNDBP1-211ENST00000567434 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
CCNDBP1-211ENST00000567434 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
CCNDBP1-211ENST00000567434 PIK3C2AO00443 1686 aa24.08■■□□□ 1.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa24.08■■□□□ 1.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 USP47Q96K76 1375 aa24.07■■□□□ 1.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 NINLQ9Y2I6 1382 aa24.07■■□□□ 1.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLIT3O75094 1523 aa24.07■■□□□ 1.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 GCP02774 474 aa24.07■■□□□ 1.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 NLRP6P59044 892 aa24.07■■□□□ 1.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZRANB1Q9UGI0 708 aa24.07■■□□□ 1.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 MON2Q7Z3U7 1717 aa24.07■■□□□ 1.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 CD163L1Q9NR16 1453 aa24.03■■□□□ 1.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 CHRNA2Q15822 529 aa24.03■■□□□ 1.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 TERF2IPQ9NYB0 399 aa24.03■■□□□ 1.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa24.03■■□□□ 1.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa24.03■■□□□ 1.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 LMO7Q8WWI1 1683 aa24.02■■□□□ 1.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 SEPT12Q8IYM1 358 aa24.02■■□□□ 1.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 TMC1Q8TDI8 760 aa24.02■■□□□ 1.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 KCNH5Q8NCM2 988 aa24.01■■□□□ 1.43
CCNDBP1-211ENST00000567434 TMF1P82094 1093 aa24■■□□□ 1.43
CCNDBP1-211ENST00000567434 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa23.99■■□□□ 1.43
CCNDBP1-211ENST00000567434 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa23.99■■□□□ 1.43
CCNDBP1-211ENST00000567434 AATKQ6ZMQ8 1374 aa23.98■■□□□ 1.43
CCNDBP1-211ENST00000567434 USP54Q70EL1 1684 aa23.98■■□□□ 1.43
CCNDBP1-211ENST00000567434 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
CCNDBP1-211ENST00000567434 EVA1CP58658 441 aa23.97■■□□□ 1.43
CCNDBP1-211ENST00000567434 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
CCNDBP1-211ENST00000567434 CDCA8Q53HL2 280 aa23.97■■□□□ 1.43
CCNDBP1-211ENST00000567434 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa23.97■■□□□ 1.43
CCNDBP1-211ENST00000567434 BRWD3Q6RI45 1802 aa23.97■■□□□ 1.43
CCNDBP1-211ENST00000567434 USP31Q70CQ4 1352 aa23.97■■□□□ 1.43
CCNDBP1-211ENST00000567434 A0A1W2PP64 1363 aa23.96■■□□□ 1.43
CCNDBP1-211ENST00000567434 STRN4Q9NRL3 753 aa23.96■■□□□ 1.43
CCNDBP1-211ENST00000567434 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa23.95■■□□□ 1.42
CCNDBP1-211ENST00000567434 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
CCNDBP1-211ENST00000567434 A0A0G2JS52 829 aa23.94■■□□□ 1.42
CCNDBP1-211ENST00000567434 MYT1Q01538 1121 aa23.94■■□□□ 1.42
CCNDBP1-211ENST00000567434 KRT27Q7Z3Y8 459 aa23.94■■□□□ 1.42
CCNDBP1-211ENST00000567434 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP23.93■■□□□ 1.42
CCNDBP1-211ENST00000567434 ABCC6O95255 1503 aa23.93■■□□□ 1.42
CCNDBP1-211ENST00000567434 ARHGEF25Q86VW2 580 aa23.92■■□□□ 1.42
CCNDBP1-211ENST00000567434 NFAT5O94916 1531 aa23.92■■□□□ 1.42
CCNDBP1-211ENST00000567434 BARGINQ6ZT62 677 aa23.91■■□□□ 1.42
CCNDBP1-211ENST00000567434 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa23.91■■□□□ 1.42
CCNDBP1-211ENST00000567434 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
CCNDBP1-211ENST00000567434 COL18A1P39060 1754 aa23.9■■□□□ 1.42
CCNDBP1-211ENST00000567434 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42 ms