RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560971.1

GCSHP2-201, Transcript of glycine cleavage system protein H pseudogene 2, humanhuman

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Gene GCSHP2, Length 527 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP2-201ENST00000560971 ATAD2Q6PL18 1390 aa26.22■■□□□ 1.79
GCSHP2-201ENST00000560971 NUTM2GQ5VZR2 741 aa26.22■■□□□ 1.79
GCSHP2-201ENST00000560971 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
GCSHP2-201ENST00000560971 USP21Q9UK80 565 aa26.2■■□□□ 1.78
GCSHP2-201ENST00000560971 ABCA3Q99758 1704 aa26.19■■□□□ 1.78
GCSHP2-201ENST00000560971 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
GCSHP2-201ENST00000560971 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
GCSHP2-201ENST00000560971 SOCS7O14512 581 aa26.18■■□□□ 1.78
GCSHP2-201ENST00000560971 USP6P35125 1406 aa26.18■■□□□ 1.78
GCSHP2-201ENST00000560971 ABTB2Q8N961 1025 aa26.17■■□□□ 1.78
GCSHP2-201ENST00000560971 TMC1Q8TDI8 760 aa26.16■■□□□ 1.78
GCSHP2-201ENST00000560971 RXRBP28702 533 aa26.15■■□□□ 1.78
GCSHP2-201ENST00000560971 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
GCSHP2-201ENST00000560971 BCL9LQ86UU0 1499 aa26.14■■□□□ 1.78
GCSHP2-201ENST00000560971 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.77
GCSHP2-201ENST00000560971 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
GCSHP2-201ENST00000560971 FAM83GA6ND36 823 aa26.13■■□□□ 1.77
GCSHP2-201ENST00000560971 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
GCSHP2-201ENST00000560971 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa26.13■■□□□ 1.77
GCSHP2-201ENST00000560971 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa26.13■■□□□ 1.77
GCSHP2-201ENST00000560971 SSH2Q76I76 1423 aa26.13■■□□□ 1.77
GCSHP2-201ENST00000560971 SLC24A1O60721 1099 aa26.12■■□□□ 1.77
GCSHP2-201ENST00000560971 SLIT2O94813 1529 aa26.11■■□□□ 1.77
GCSHP2-201ENST00000560971 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
GCSHP2-201ENST00000560971 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
GCSHP2-201ENST00000560971 TMF1P82094 1093 aa26.1■■□□□ 1.77
GCSHP2-201ENST00000560971 CD163L1Q9NR16 1453 aa26.1■■□□□ 1.77
GCSHP2-201ENST00000560971 AKAP12Q02952 1782 aa26.1■■□□□ 1.77
GCSHP2-201ENST00000560971 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
GCSHP2-201ENST00000560971 UNC5CLQ8IV45 518 aa26.09■■□□□ 1.77
GCSHP2-201ENST00000560971 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa26.09■■□□□ 1.77
GCSHP2-201ENST00000560971 ATRNO75882 1429 aa26.08■■□□□ 1.77
GCSHP2-201ENST00000560971 NLRP13Q86W25 1043 aa26.08■■□□□ 1.77
GCSHP2-201ENST00000560971 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
GCSHP2-201ENST00000560971 NLRP6P59044 892 aa26.07■■□□□ 1.76
GCSHP2-201ENST00000560971 USP19O94966 1318 aa26.07■■□□□ 1.76
GCSHP2-201ENST00000560971 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
GCSHP2-201ENST00000560971 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
GCSHP2-201ENST00000560971 PRDM11Q9NQV5 511 aa26.05■■□□□ 1.76
GCSHP2-201ENST00000560971 PLCH1Q4KWH8 1693 aa26.05■■□□□ 1.76
GCSHP2-201ENST00000560971 KIAA0232Q92628 1395 aa26.05■■□□□ 1.76
GCSHP2-201ENST00000560971 PIK3C2AO00443 1686 aa26.04■■□□□ 1.76
GCSHP2-201ENST00000560971 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP26.04■■□□□ 1.76
GCSHP2-201ENST00000560971 BTG4Q9NY30 223 aa26.04■■□□□ 1.76
GCSHP2-201ENST00000560971 GCP02774 474 aa26.03■■□□□ 1.76
GCSHP2-201ENST00000560971 CHRNA2Q15822 529 aa26.03■■□□□ 1.76
GCSHP2-201ENST00000560971 TERF2IPQ9NYB0 399 aa26.03■■□□□ 1.76
GCSHP2-201ENST00000560971 A0A1W2PP64 1363 aa26.03■■□□□ 1.76
GCSHP2-201ENST00000560971 NRKQ7Z2Y5 1582 aa26.03■■□□□ 1.76
GCSHP2-201ENST00000560971 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
GCSHP2-201ENST00000560971 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP26.02■■□□□ 1.76
GCSHP2-201ENST00000560971 TTC21AQ8NDW8 1320 aa26.02■■□□□ 1.76
GCSHP2-201ENST00000560971 MON2Q7Z3U7 1717 aa26.02■■□□□ 1.76
GCSHP2-201ENST00000560971 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
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GCSHP2-201ENST00000560971 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
GCSHP2-201ENST00000560971 RGS12O14924 1447 aa26■■□□□ 1.75
GCSHP2-201ENST00000560971 NINLQ9Y2I6 1382 aa26■■□□□ 1.75
GCSHP2-201ENST00000560971 NWD2Q9ULI1 1742 aa26■■□□□ 1.75
GCSHP2-201ENST00000560971 CDCA8Q53HL2 280 aa25.99■■□□□ 1.75
GCSHP2-201ENST00000560971 ZRANB1Q9UGI0 708 aa25.99■■□□□ 1.75
GCSHP2-201ENST00000560971 VPS72Q15906 364 aa25.98■■□□□ 1.75
GCSHP2-201ENST00000560971 NME9Q86XW9 330 aa25.98■■□□□ 1.75
GCSHP2-201ENST00000560971 SLIT3O75094 1523 aa25.97■■□□□ 1.75
GCSHP2-201ENST00000560971 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
GCSHP2-201ENST00000560971 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
GCSHP2-201ENST00000560971 CPDO75976 1380 aa25.95■■□□□ 1.75
GCSHP2-201ENST00000560971 NRAPQ86VF7 1730 aa25.95■■□□□ 1.74
GCSHP2-201ENST00000560971 GLI3P10071 1580 aa25.95■■□□□ 1.74
GCSHP2-201ENST00000560971 ZBTB7CA1YPR0 619 aa25.94■■□□□ 1.74
GCSHP2-201ENST00000560971 SOX12O15370 315 aa25.94■■□□□ 1.74
GCSHP2-201ENST00000560971 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa25.93■■□□□ 1.74
GCSHP2-201ENST00000560971 STRN4Q9NRL3 753 aa25.91■■□□□ 1.74
GCSHP2-201ENST00000560971 USP31Q70CQ4 1352 aa25.91■■□□□ 1.74
GCSHP2-201ENST00000560971 POLR3GLQ9BT43 218 aa25.9■■□□□ 1.74
GCSHP2-201ENST00000560971 KCNH5Q8NCM2 988 aa25.89■■□□□ 1.74
GCSHP2-201ENST00000560971 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa25.89■■□□□ 1.73
GCSHP2-201ENST00000560971 LMO7Q8WWI1 1683 aa25.87■■□□□ 1.73
GCSHP2-201ENST00000560971 EVA1CP58658 441 aa25.87■■□□□ 1.73
GCSHP2-201ENST00000560971 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa25.87■■□□□ 1.73
GCSHP2-201ENST00000560971 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa25.87■■□□□ 1.73
GCSHP2-201ENST00000560971 MYOM1P52179 1685 aa25.87■■□□□ 1.73
GCSHP2-201ENST00000560971 ARHGEF25Q86VW2 580 aa25.86■■□□□ 1.73
GCSHP2-201ENST00000560971 AATKQ6ZMQ8 1374 aa25.85■■□□□ 1.73
GCSHP2-201ENST00000560971 NFAT5O94916 1531 aa25.85■■□□□ 1.73
GCSHP2-201ENST00000560971 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
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GCSHP2-201ENST00000560971 CARD14Q9BXL6 1004 aa25.84■■□□□ 1.73
GCSHP2-201ENST00000560971 USP54Q70EL1 1684 aa25.83■■□□□ 1.73
GCSHP2-201ENST00000560971 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa25.83■■□□□ 1.73
GCSHP2-201ENST00000560971 OVOS2Q6IE36 1432 aa25.83■■□□□ 1.73
GCSHP2-201ENST00000560971 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
GCSHP2-201ENST00000560971 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
GCSHP2-201ENST00000560971 SEPT12Q8IYM1 358 aa25.83■■□□□ 1.73
GCSHP2-201ENST00000560971 AXIN2Q9Y2T1 843 aa25.83■■□□□ 1.73
GCSHP2-201ENST00000560971 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa25.82■■□□□ 1.72
GCSHP2-201ENST00000560971 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
GCSHP2-201ENST00000560971 COL18A1P39060 1754 aa25.8■■□□□ 1.72
GCSHP2-201ENST00000560971 FYB1O15117 783 aa25.8■■□□□ 1.72
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