RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555562.1

FOXN3-AS1-201, FOXN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FOXN3-AS1, Length 1,077 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ALS2Q96Q42 1657 aa28.19■■■□□ 2.1
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FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CDK19Q9BWU1 502 aa28.17■■■□□ 2.1
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 A0A0G2JS52 829 aa28.16■■■□□ 2.1
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MYT1Q01538 1121 aa28.16■■■□□ 2.1
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
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FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CCDC61Q9Y6R9 512 aa28.13■■■□□ 2.09
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FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa28.12■■■□□ 2.09
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NRAPQ86VF7 1730 aa28.11■■■□□ 2.09
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NBPF8Q3BBV2 869 aa28.1■■■□□ 2.09
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PLEKHG3A1L390 1219 aa28.09■■■□□ 2.09
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NBPF1Q3BBV0 1214 aa28.08■■■□□ 2.09
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ITSN1Q15811 1721 aa28.08■■■□□ 2.09
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ACEP12821 1306 aa28.08■■■□□ 2.09
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KIAA0232Q92628 1395 aa28.06■■■□□ 2.08
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 BAG6P46379 1132 aa28.05■■■□□ 2.08
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa28.05■■■□□ 2.08
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa28.04■■■□□ 2.08
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CHRNA2Q15822 529 aa28.03■■■□□ 2.08
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NUTM2GQ5VZR2 741 aa28.03■■■□□ 2.08
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa28.01■■■□□ 2.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ABTB2Q8N961 1025 aa28■■■□□ 2.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 STRN4Q9NRL3 753 aa27.99■■■□□ 2.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP27.98■■■□□ 2.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FAM182BQ5T319 152 aa27.98■■■□□ 2.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 EVA1CP58658 441 aa27.97■■■□□ 2.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa27.96■■■□□ 2.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP27.94■■■□□ 2.06
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NLRP13Q86W25 1043 aa27.94■■■□□ 2.06
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CABP2Q9NPB3 220 aa27.94■■■□□ 2.06
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa27.94■■■□□ 2.06
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 USP19O94966 1318 aa27.92■■■□□ 2.06
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa27.92■■■□□ 2.06
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CPDO75976 1380 aa27.92■■■□□ 2.06
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FAM196AQ6ZSG2 479 aa27.92■■■□□ 2.06
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP27.91■■■□□ 2.06
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 BARGINQ6ZT62 677 aa27.91■■■□□ 2.06
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 L3MBTL2Q969R5 705 aa27.91■■■□□ 2.06
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GCP02774 474 aa27.9■■■□□ 2.06
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 USP35Q9P2H5 1018 aa27.9■■■□□ 2.06
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SSH2Q76I76 1423 aa27.89■■■□□ 2.06
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP27.88■■■□□ 2.05
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FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa27.86■■■□□ 2.05
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TRIM37O94972 964 aa27.85■■■□□ 2.05
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NRKQ7Z2Y5 1582 aa27.85■■■□□ 2.05
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP27.84■■■□□ 2.05
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NLRP6P59044 892 aa27.82■■■□□ 2.04
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SIN3AQ96ST3 1273 aa27.82■■■□□ 2.04
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 EVC2Q86UK5 1308 aa27.82■■■□□ 2.04
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CAMKK2Q96RR4 588 aa27.81■■■□□ 2.04
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 APBA3O96018 575 aa27.8■■■□□ 2.04
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 USP6P35125 1406 aa27.8■■■□□ 2.04
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LMO7Q8WWI1 1683 aa27.79■■■□□ 2.04
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 QRICH2Q9H0J4 1663 aa27.79■■■□□ 2.04
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP27.79■■■□□ 2.04
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LRP5O75197 1615 aa27.78■■■□□ 2.04
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NEUROD1Q13562 356 aa27.77■■■□□ 2.04
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP27.77■■■□□ 2.04
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PARD3Q8TEW0 1356 aa27.76■■■□□ 2.03
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP27.76■■■□□ 2.03
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 AATKQ6ZMQ8 1374 aa27.75■■■□□ 2.03
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP27.75■■■□□ 2.03
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZBTB7CA1YPR0 619 aa27.74■■■□□ 2.03
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP27.74■■■□□ 2.03
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP27.73■■■□□ 2.03
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CRB1P82279 1406 aa27.73■■■□□ 2.03
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PCGF6Q9BYE7 350 aa27.72■■■□□ 2.03
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SLIT3O75094 1523 aa27.71■■■□□ 2.03
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa27.7■■■□□ 2.03
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa27.69■■■□□ 2.02
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KCNH5Q8NCM2 988 aa27.68■■■□□ 2.02
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa27.67■■■□□ 2.02
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NBPF14Q5TI25 921 aa27.66■■■□□ 2.02
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ARHGEF25Q86VW2 580 aa27.66■■■□□ 2.02
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 AXIN2Q9Y2T1 843 aa27.66■■■□□ 2.02
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TTC21AQ8NDW8 1320 aa27.66■■■□□ 2.02
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DDB1Q16531 1140 aa27.64■■■□□ 2.02
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 WDR17Q8IZU2 1322 aa27.64■■■□□ 2.01
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP27.64■■■□□ 2.01
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PIK3C2AO00443 1686 aa27.63■■■□□ 2.01
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP27.62■■■□□ 2.01
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP27.61■■■□□ 2.01
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa27.6■■■□□ 2.01
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