RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550632.5

USP15-216, Transcript of ubiquitin specific peptidase 15, humanhuman

TSL 3

Gene USP15, Length 728 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15-216ENST00000550632 RGL3Q3MIN7 710 aa22.48■■□□□ 1.19
USP15-216ENST00000550632 NBPF14Q5TI25 921 aa22.48■■□□□ 1.19
USP15-216ENST00000550632 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
USP15-216ENST00000550632 NINLQ9Y2I6 1382 aa22.48■■□□□ 1.19
USP15-216ENST00000550632 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
USP15-216ENST00000550632 IFFO2Q5TF58 517 aa22.45■■□□□ 1.18
USP15-216ENST00000550632 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa22.44■■□□□ 1.18
USP15-216ENST00000550632 PRDM11Q9NQV5 511 aa22.43■■□□□ 1.18
USP15-216ENST00000550632 STRN4Q9NRL3 753 aa22.43■■□□□ 1.18
USP15-216ENST00000550632 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
USP15-216ENST00000550632 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
USP15-216ENST00000550632 USP35Q9P2H5 1018 aa22.42■■□□□ 1.18
USP15-216ENST00000550632 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
USP15-216ENST00000550632 CHRNA2Q15822 529 aa22.4■■□□□ 1.18
USP15-216ENST00000550632 ALS2Q96Q42 1657 aa22.39■■□□□ 1.18
USP15-216ENST00000550632 PDE3BQ13370 1112 aa22.38■■□□□ 1.17
USP15-216ENST00000550632 SIRT1Q96EB6 747 aa22.38■■□□□ 1.17
USP15-216ENST00000550632 PRAM1Q96QH2 718 aa22.38■■□□□ 1.17
USP15-216ENST00000550632 PIK3C2GO75747 1445 aa22.38■■□□□ 1.17
USP15-216ENST00000550632 GPRASP1Q5JY77 1395 aa22.36■■□□□ 1.17
USP15-216ENST00000550632 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa22.36■■□□□ 1.17
USP15-216ENST00000550632 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa22.35■■□□□ 1.17
USP15-216ENST00000550632 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
USP15-216ENST00000550632 C1QTNF8P60827 252 aa22.35■■□□□ 1.17
USP15-216ENST00000550632 KIAA0232Q92628 1395 aa22.35■■□□□ 1.17
USP15-216ENST00000550632 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
USP15-216ENST00000550632 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa22.34■■□□□ 1.17
USP15-216ENST00000550632 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
USP15-216ENST00000550632 NRKQ7Z2Y5 1582 aa22.33■■□□□ 1.17
USP15-216ENST00000550632 ANKARQ7Z5J8 1434 aa22.33■■□□□ 1.17
USP15-216ENST00000550632 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
USP15-216ENST00000550632 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
USP15-216ENST00000550632 CFAP70Q5T0N1 1121 aa22.31■■□□□ 1.16
USP15-216ENST00000550632 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
USP15-216ENST00000550632 PRR36Q9H6K5 1346 aa22.31■■□□□ 1.16
USP15-216ENST00000550632 ZBTB7AO95365 584 aa22.3■■□□□ 1.16
USP15-216ENST00000550632 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
USP15-216ENST00000550632 POGKQ9P215 609 aa22.3■■□□□ 1.16
USP15-216ENST00000550632 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
USP15-216ENST00000550632 EVA1CP58658 441 aa22.29■■□□□ 1.16
USP15-216ENST00000550632 BARGINQ6ZT62 677 aa22.29■■□□□ 1.16
USP15-216ENST00000550632 MYOM1P52179 1685 aa22.28■■□□□ 1.16
USP15-216ENST00000550632 UTRNP46939 3433 aa22.28■■□□□ 1.16
USP15-216ENST00000550632 NUTM2GQ5VZR2 741 aa22.27■■□□□ 1.16
USP15-216ENST00000550632 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
USP15-216ENST00000550632 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
USP15-216ENST00000550632 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
USP15-216ENST00000550632 SSH2Q76I76 1423 aa22.26■■□□□ 1.15
USP15-216ENST00000550632 CASZ1Q86V15 1759 aa22.26■■□□□ 1.15
USP15-216ENST00000550632 PTGER2P43116 358 aa22.25■■□□□ 1.15
USP15-216ENST00000550632 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
USP15-216ENST00000550632 TCP11L2Q8N4U5 519 aa22.23■■□□□ 1.15
USP15-216ENST00000550632 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
USP15-216ENST00000550632 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
USP15-216ENST00000550632 PTF1AQ7RTS3 328 aa22.22■■□□□ 1.15
USP15-216ENST00000550632 SYT17Q9BSW7 474 aa22.22■■□□□ 1.15
USP15-216ENST00000550632 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
USP15-216ENST00000550632 TULP4Q9NRJ4 1543 aa22.19■■□□□ 1.14
USP15-216ENST00000550632 CHD4Q14839 1912 aa22.18■■□□□ 1.14
USP15-216ENST00000550632 DLC1Q96QB1 1528 aa22.18■■□□□ 1.14
USP15-216ENST00000550632 TRAK1Q9UPV9 953 aa22.18■■□□□ 1.14
USP15-216ENST00000550632 PLSCR1O15162 318 aa22.17■■□□□ 1.14
USP15-216ENST00000550632 WASLO00401 505 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
USP15-216ENST00000550632 PROM2Q8N271 834 aa22.16■■□□□ 1.14
USP15-216ENST00000550632 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
USP15-216ENST00000550632 PEAK1Q9H792 1746 aa22.14■■□□□ 1.13
USP15-216ENST00000550632 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa22.14■■□□□ 1.13
USP15-216ENST00000550632 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa22.14■■□□□ 1.13
USP15-216ENST00000550632 OVOS2Q6IE36 1432 aa22.14■■□□□ 1.13
USP15-216ENST00000550632 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
USP15-216ENST00000550632 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa22.13■■□□□ 1.13
USP15-216ENST00000550632 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
USP15-216ENST00000550632 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
USP15-216ENST00000550632 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
USP15-216ENST00000550632 SBF2Q86WG5 1849 aa22.12■■□□□ 1.13
USP15-216ENST00000550632 LMO7Q8WWI1 1683 aa22.11■■□□□ 1.13
USP15-216ENST00000550632 MPHOSPH9Q99550 1183 aa22.1■■□□□ 1.13
USP15-216ENST00000550632 STK32BQ9NY57 414 aa22.1■■□□□ 1.13
USP15-216ENST00000550632 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
USP15-216ENST00000550632 ATP7BP35670 1465 aa22.09■■□□□ 1.13
USP15-216ENST00000550632 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
USP15-216ENST00000550632 SGIP1Q9BQI5 828 aa22.08■■□□□ 1.13
USP15-216ENST00000550632 ADGRB1O14514 1584 aa22.08■■□□□ 1.12
USP15-216ENST00000550632 CEP350Q5VT06 3117 aa22.07■■□□□ 1.12
USP15-216ENST00000550632 ZBTB7CA1YPR0 619 aa22.07■■□□□ 1.12
USP15-216ENST00000550632 SLC15A2Q16348 729 aa22.07■■□□□ 1.12
USP15-216ENST00000550632 MTFR1LQ9H019 292 aa22.07■■□□□ 1.12
USP15-216ENST00000550632 DDB1Q16531 1140 aa22.06■■□□□ 1.12
USP15-216ENST00000550632 GPR162Q16538 588 aa22.06■■□□□ 1.12
USP15-216ENST00000550632 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
USP15-216ENST00000550632 LRRC37A3O60309 1634 aa22.06■■□□□ 1.12
USP15-216ENST00000550632 CPDO75976 1380 aa22.05■■□□□ 1.12
USP15-216ENST00000550632 TXNRD1Q16881 649 aa22.05■■□□□ 1.12
USP15-216ENST00000550632 ABTB2Q8N961 1025 aa22.05■■□□□ 1.12
USP15-216ENST00000550632 ARXQ96QS3 562 aa22.04■■□□□ 1.12
USP15-216ENST00000550632 CRB1P82279 1406 aa22.04■■□□□ 1.12
USP15-216ENST00000550632 ITSN1Q15811 1721 aa22.03■■□□□ 1.12
USP15-216ENST00000550632 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
USP15-216ENST00000550632 ACEP12821 1306 aa22.03■■□□□ 1.12
USP15-216ENST00000550632 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
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