RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548046.5

SLC25A3-209, Transcript of solute carrier family 25 member 3, humanhuman

TSL 4

Gene SLC25A3, Length 550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A3-209ENST00000548046 EP400Q96L91 3159 aa20.39■□□□□ 0.85
SLC25A3-209ENST00000548046 A0A0G2JS52 829 aa20.39■□□□□ 0.85
SLC25A3-209ENST00000548046 MYT1Q01538 1121 aa20.39■□□□□ 0.85
SLC25A3-209ENST00000548046 NBPF8Q3BBV2 869 aa20.39■□□□□ 0.85
SLC25A3-209ENST00000548046 ATP7BP35670 1465 aa20.38■□□□□ 0.85
SLC25A3-209ENST00000548046 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
SLC25A3-209ENST00000548046 ITSN1Q15811 1721 aa20.38■□□□□ 0.85
SLC25A3-209ENST00000548046 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
SLC25A3-209ENST00000548046 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
SLC25A3-209ENST00000548046 ALS2Q96Q42 1657 aa20.37■□□□□ 0.85
SLC25A3-209ENST00000548046 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
SLC25A3-209ENST00000548046 PLCH1Q4KWH8 1693 aa20.36■□□□□ 0.85
SLC25A3-209ENST00000548046 ACEP12821 1306 aa20.36■□□□□ 0.85
SLC25A3-209ENST00000548046 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
SLC25A3-209ENST00000548046 NBPF1Q3BBV0 1214 aa20.36■□□□□ 0.85
SLC25A3-209ENST00000548046 ABCA3Q99758 1704 aa20.36■□□□□ 0.85
SLC25A3-209ENST00000548046 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
SLC25A3-209ENST00000548046 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
SLC25A3-209ENST00000548046 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa20.34■□□□□ 0.85
SLC25A3-209ENST00000548046 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa20.34■□□□□ 0.85
SLC25A3-209ENST00000548046 ABTB2Q8N961 1025 aa20.34■□□□□ 0.85
SLC25A3-209ENST00000548046 NLRP13Q86W25 1043 aa20.32■□□□□ 0.84
SLC25A3-209ENST00000548046 BAG6P46379 1132 aa20.31■□□□□ 0.84
SLC25A3-209ENST00000548046 EVA1CP58658 441 aa20.31■□□□□ 0.84
SLC25A3-209ENST00000548046 L3MBTL2Q969R5 705 aa20.31■□□□□ 0.84
SLC25A3-209ENST00000548046 KIAA0232Q92628 1395 aa20.31■□□□□ 0.84
SLC25A3-209ENST00000548046 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
SLC25A3-209ENST00000548046 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa20.27■□□□□ 0.84
SLC25A3-209ENST00000548046 EVC2Q86UK5 1308 aa20.27■□□□□ 0.84
SLC25A3-209ENST00000548046 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa20.27■□□□□ 0.84
SLC25A3-209ENST00000548046 NUTM2GQ5VZR2 741 aa20.27■□□□□ 0.84
SLC25A3-209ENST00000548046 DEFB132Q7Z7B7 95 aa20.27■□□□□ 0.84
SLC25A3-209ENST00000548046 CABP2Q9NPB3 220 aa20.27■□□□□ 0.84
SLC25A3-209ENST00000548046 BRWD3Q6RI45 1802 aa20.27■□□□□ 0.84
SLC25A3-209ENST00000548046 NRAPQ86VF7 1730 aa20.27■□□□□ 0.83
SLC25A3-209ENST00000548046 CPDO75976 1380 aa20.26■□□□□ 0.83
SLC25A3-209ENST00000548046 CHRNA2Q15822 529 aa20.26■□□□□ 0.83
SLC25A3-209ENST00000548046 STRN4Q9NRL3 753 aa20.26■□□□□ 0.83
SLC25A3-209ENST00000548046 BARGINQ6ZT62 677 aa20.25■□□□□ 0.83
SLC25A3-209ENST00000548046 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
SLC25A3-209ENST00000548046 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa20.24■□□□□ 0.83
SLC25A3-209ENST00000548046 GCP02774 474 aa20.24■□□□□ 0.83
SLC25A3-209ENST00000548046 FAM196AQ6ZSG2 479 aa20.24■□□□□ 0.83
SLC25A3-209ENST00000548046 CABP1Q9NZU7 370 aa20.24■□□□□ 0.83
SLC25A3-209ENST00000548046 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
SLC25A3-209ENST00000548046 USP19O94966 1318 aa20.24■□□□□ 0.83
SLC25A3-209ENST00000548046 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
SLC25A3-209ENST00000548046 NEUROD1Q13562 356 aa20.23■□□□□ 0.83
SLC25A3-209ENST00000548046 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa20.22■□□□□ 0.83
SLC25A3-209ENST00000548046 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa20.22■□□□□ 0.83
SLC25A3-209ENST00000548046 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
SLC25A3-209ENST00000548046 PDE3BQ13370 1112 aa20.21■□□□□ 0.83
SLC25A3-209ENST00000548046 TCP11L2Q8N4U5 519 aa20.21■□□□□ 0.83
SLC25A3-209ENST00000548046 SIN3AQ96ST3 1273 aa20.21■□□□□ 0.83
SLC25A3-209ENST00000548046 NLRP6P59044 892 aa20.2■□□□□ 0.82
SLC25A3-209ENST00000548046 USP35Q9P2H5 1018 aa20.19■□□□□ 0.82
SLC25A3-209ENST00000548046 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
SLC25A3-209ENST00000548046 SSH2Q76I76 1423 aa20.19■□□□□ 0.82
SLC25A3-209ENST00000548046 USP6P35125 1406 aa20.18■□□□□ 0.82
SLC25A3-209ENST00000548046 KCNH5Q8NCM2 988 aa20.17■□□□□ 0.82
SLC25A3-209ENST00000548046 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa20.16■□□□□ 0.82
SLC25A3-209ENST00000548046 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
SLC25A3-209ENST00000548046 DISP2A7MBM2 1401 aa20.16■□□□□ 0.82
SLC25A3-209ENST00000548046 QRICH2Q9H0J4 1663 aa20.16■□□□□ 0.82
SLC25A3-209ENST00000548046 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
SLC25A3-209ENST00000548046 AATKQ6ZMQ8 1374 aa20.14■□□□□ 0.81
SLC25A3-209ENST00000548046 PARD3Q8TEW0 1356 aa20.14■□□□□ 0.81
SLC25A3-209ENST00000548046 TTC21AQ8NDW8 1320 aa20.14■□□□□ 0.81
SLC25A3-209ENST00000548046 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa20.13■□□□□ 0.81
SLC25A3-209ENST00000548046 NRKQ7Z2Y5 1582 aa20.13■□□□□ 0.81
SLC25A3-209ENST00000548046 FAM182BQ5T319 152 aa20.13■□□□□ 0.81
SLC25A3-209ENST00000548046 RGPD1P0DJD0 1748 aa20.13■□□□□ 0.81
SLC25A3-209ENST00000548046 SLC24A1O60721 1099 aa20.12■□□□□ 0.81
SLC25A3-209ENST00000548046 TRIM37O94972 964 aa20.12■□□□□ 0.81
SLC25A3-209ENST00000548046 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa20.12■□□□□ 0.81
SLC25A3-209ENST00000548046 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
SLC25A3-209ENST00000548046 CRB1P82279 1406 aa20.1■□□□□ 0.81
SLC25A3-209ENST00000548046 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa20.1■□□□□ 0.81
SLC25A3-209ENST00000548046 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa20.1■□□□□ 0.81
SLC25A3-209ENST00000548046 APBA3O96018 575 aa20.1■□□□□ 0.81
SLC25A3-209ENST00000548046 CARD11Q9BXL7 1154 aa20.1■□□□□ 0.81
SLC25A3-209ENST00000548046 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
SLC25A3-209ENST00000548046 ZBTB7CA1YPR0 619 aa20.09■□□□□ 0.81
SLC25A3-209ENST00000548046 LMO7Q8WWI1 1683 aa20.08■□□□□ 0.81
SLC25A3-209ENST00000548046 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa20.08■□□□□ 0.81
SLC25A3-209ENST00000548046 CAMKK2Q96RR4 588 aa20.08■□□□□ 0.81
SLC25A3-209ENST00000548046 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
SLC25A3-209ENST00000548046 NBPF14Q5TI25 921 aa20.07■□□□□ 0.8
SLC25A3-209ENST00000548046 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
SLC25A3-209ENST00000548046 TONSLQ96HA7 1378 aa20.07■□□□□ 0.8
SLC25A3-209ENST00000548046 SLIT3O75094 1523 aa20.07■□□□□ 0.8
SLC25A3-209ENST00000548046 ARHGEF25Q86VW2 580 aa20.06■□□□□ 0.8
SLC25A3-209ENST00000548046 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
SLC25A3-209ENST00000548046 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
SLC25A3-209ENST00000548046 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
SLC25A3-209ENST00000548046 DDB1Q16531 1140 aa20.05■□□□□ 0.8
SLC25A3-209ENST00000548046 WDR17Q8IZU2 1322 aa20.04■□□□□ 0.8
SLC25A3-209ENST00000548046 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
SLC25A3-209ENST00000548046 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa20.03■□□□□ 0.8
SLC25A3-209ENST00000548046 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 153.3 ms