RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534348.5

NEDD8-MDP1-202, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene NEDD8-MDP1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PRDM11Q9NQV5 511 aa15.57■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa15.57■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa15.57■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RREB1Q92766 1687 aa15.57■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP15.56■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CHRNA2Q15822 529 aa15.55■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NRXN1Q9ULB1 1477 aa15.54■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NRKQ7Z2Y5 1582 aa15.53■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RGL3Q3MIN7 710 aa15.53■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TECPR2O15040 1411 aa15.52■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ABCC11Q96J66 1382 aa15.52■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SYT17Q9BSW7 474 aa15.52■□□□□ 0.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 EVA1CP58658 441 aa15.51■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PTGER2P43116 358 aa15.5■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PPLO60437 1756 aa15.49■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KIAA0232Q92628 1395 aa15.49■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MYOM1P52179 1685 aa15.48■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GPRASP1Q5JY77 1395 aa15.48■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IFT172Q9UG01 1749 aa15.47■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PRAM1Q96QH2 718 aa15.46■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NUTM2GQ5VZR2 741 aa15.45■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BARGINQ6ZT62 677 aa15.45■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GPR162Q16538 588 aa15.44■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PTF1AQ7RTS3 328 aa15.44■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CHD4Q14839 1912 aa15.43■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TCP11L2Q8N4U5 519 aa15.43■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 POGKQ9P215 609 aa15.43■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KNDC1Q76NI1 1749 aa15.43■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CASZ1Q86V15 1759 aa15.42■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SIRT1Q96EB6 747 aa15.42■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ALS2Q96Q42 1657 aa15.41■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PLSCR1O15162 318 aa15.41■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KLHL34Q8N239 644 aa15.41■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PROM2Q8N271 834 aa15.41■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 STK32BQ9NY57 414 aa15.4■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SSH2Q76I76 1423 aa15.4■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ARXQ96QS3 562 aa15.39■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PRR36Q9H6K5 1346 aa15.39■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ANKARQ7Z5J8 1434 aa15.38■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CFAP70Q5T0N1 1121 aa15.38■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MTFR1LQ9H019 292 aa15.38■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PIK3C2GO75747 1445 aa15.37■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DLC1Q96QB1 1528 aa15.37■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa15.36■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC15A2Q16348 729 aa15.36■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SGIP1Q9BQI5 828 aa15.36■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa15.36■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa15.35■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa15.35■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OVOS2Q6IE36 1432 aa15.35■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZBTB7CA1YPR0 619 aa15.34■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TXNRD1Q16881 649 aa15.34■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DDB1Q16531 1140 aa15.33■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TRAK1Q9UPV9 953 aa15.32■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa15.31■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 WASLO00401 505 aaPredicted RBP15.3■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CAPN15O75808 1086 aa15.29■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SHANK3Q9BYB0 1731 aa15.29■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HSPA6P17066 643 aa15.28■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ABTB2Q8N961 1025 aa15.28■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa15.28■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PEAK1Q9H792 1746 aa15.28■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP15.27■□□□□ 0.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TULP4Q9NRJ4 1543 aa15.27■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SBF2Q86WG5 1849 aa15.27■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ATP7BP35670 1465 aa15.26■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MAP3K5Q99683 1374 aa15.25■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa15.25■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NLGN2Q8NFZ4 835 aa15.25■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.5 ms