RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531995.1

PUF60-218, Transcript of poly(U) binding splicing factor 60, humanhuman

TSL 3

Gene PUF60, Length 631 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60-218ENST00000531995 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa26.68■■□□□ 1.86
PUF60-218ENST00000531995 GPRASP1Q5JY77 1395 aa26.68■■□□□ 1.86
PUF60-218ENST00000531995 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
PUF60-218ENST00000531995 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa26.67■■□□□ 1.86
PUF60-218ENST00000531995 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
PUF60-218ENST00000531995 WASLO00401 505 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
PUF60-218ENST00000531995 NBPF1Q3BBV0 1214 aa26.66■■□□□ 1.86
PUF60-218ENST00000531995 VPS72Q15906 364 aa26.65■■□□□ 1.86
PUF60-218ENST00000531995 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa26.64■■□□□ 1.86
PUF60-218ENST00000531995 SEPT12Q8IYM1 358 aa26.62■■□□□ 1.85
PUF60-218ENST00000531995 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
PUF60-218ENST00000531995 FAM83GA6ND36 823 aa26.61■■□□□ 1.85
PUF60-218ENST00000531995 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
PUF60-218ENST00000531995 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa26.6■■□□□ 1.85
PUF60-218ENST00000531995 A0A0G2JS52 829 aa26.58■■□□□ 1.85
PUF60-218ENST00000531995 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
PUF60-218ENST00000531995 MYT1Q01538 1121 aa26.58■■□□□ 1.85
PUF60-218ENST00000531995 CCDC125Q86Z20 511 aa26.57■■□□□ 1.84
PUF60-218ENST00000531995 BTG4Q9NY30 223 aa26.57■■□□□ 1.84
PUF60-218ENST00000531995 ZRANB1Q9UGI0 708 aa26.56■■□□□ 1.84
PUF60-218ENST00000531995 QRICH2Q9H0J4 1663 aa26.55■■□□□ 1.84
PUF60-218ENST00000531995 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
PUF60-218ENST00000531995 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa26.54■■□□□ 1.84
PUF60-218ENST00000531995 NRKQ7Z2Y5 1582 aa26.53■■□□□ 1.84
PUF60-218ENST00000531995 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
PUF60-218ENST00000531995 KRT27Q7Z3Y8 459 aa26.52■■□□□ 1.84
PUF60-218ENST00000531995 DEFB132Q7Z7B7 95 aa26.52■■□□□ 1.84
PUF60-218ENST00000531995 CDK19Q9BWU1 502 aa26.5■■□□□ 1.83
PUF60-218ENST00000531995 RGPD1P0DJD0 1748 aa26.49■■□□□ 1.83
PUF60-218ENST00000531995 PRDM11Q9NQV5 511 aa26.49■■□□□ 1.83
PUF60-218ENST00000531995 KIAA0232Q92628 1395 aa26.48■■□□□ 1.83
PUF60-218ENST00000531995 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
PUF60-218ENST00000531995 NUTM2GQ5VZR2 741 aa26.48■■□□□ 1.83
PUF60-218ENST00000531995 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
PUF60-218ENST00000531995 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
PUF60-218ENST00000531995 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
PUF60-218ENST00000531995 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
PUF60-218ENST00000531995 ACEP12821 1306 aa26.44■■□□□ 1.82
PUF60-218ENST00000531995 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa26.44■■□□□ 1.82
PUF60-218ENST00000531995 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa26.44■■□□□ 1.82
PUF60-218ENST00000531995 CHRNA2Q15822 529 aa26.44■■□□□ 1.82
PUF60-218ENST00000531995 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa26.42■■□□□ 1.82
PUF60-218ENST00000531995 FAM182BQ5T319 152 aa26.42■■□□□ 1.82
PUF60-218ENST00000531995 LMO7Q8WWI1 1683 aa26.41■■□□□ 1.82
PUF60-218ENST00000531995 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
PUF60-218ENST00000531995 STRN4Q9NRL3 753 aa26.4■■□□□ 1.82
PUF60-218ENST00000531995 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
PUF60-218ENST00000531995 CARD11Q9BXL7 1154 aa26.39■■□□□ 1.82
PUF60-218ENST00000531995 CCDC61Q9Y6R9 512 aa26.39■■□□□ 1.82
PUF60-218ENST00000531995 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
PUF60-218ENST00000531995 CABP2Q9NPB3 220 aa26.36■■□□□ 1.81
PUF60-218ENST00000531995 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa26.36■■□□□ 1.81
PUF60-218ENST00000531995 LRP5O75197 1615 aa26.36■■□□□ 1.81
PUF60-218ENST00000531995 PLEKHG3A1L390 1219 aa26.35■■□□□ 1.81
PUF60-218ENST00000531995 SSH2Q76I76 1423 aa26.35■■□□□ 1.81
PUF60-218ENST00000531995 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa26.34■■□□□ 1.81
PUF60-218ENST00000531995 BAG6P46379 1132 aa26.34■■□□□ 1.81
PUF60-218ENST00000531995 ABTB2Q8N961 1025 aa26.34■■□□□ 1.81
PUF60-218ENST00000531995 USP35Q9P2H5 1018 aa26.33■■□□□ 1.81
PUF60-218ENST00000531995 PIK3C2AO00443 1686 aa26.33■■□□□ 1.81
PUF60-218ENST00000531995 USP19O94966 1318 aa26.33■■□□□ 1.81
PUF60-218ENST00000531995 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
PUF60-218ENST00000531995 USP6P35125 1406 aa26.29■■□□□ 1.8
PUF60-218ENST00000531995 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP26.28■■□□□ 1.8
PUF60-218ENST00000531995 CPDO75976 1380 aa26.28■■□□□ 1.8
PUF60-218ENST00000531995 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
PUF60-218ENST00000531995 AKAP12Q02952 1782 aa26.27■■□□□ 1.8
PUF60-218ENST00000531995 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
PUF60-218ENST00000531995 SLIT3O75094 1523 aa26.26■■□□□ 1.79
PUF60-218ENST00000531995 DISP2A7MBM2 1401 aa26.26■■□□□ 1.79
PUF60-218ENST00000531995 EVA1CP58658 441 aa26.25■■□□□ 1.79
PUF60-218ENST00000531995 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
PUF60-218ENST00000531995 WNK3Q9BYP7 1800 aa26.25■■□□□ 1.79
PUF60-218ENST00000531995 ZBTB7CA1YPR0 619 aa26.24■■□□□ 1.79
PUF60-218ENST00000531995 RREB1Q92766 1687 aa26.24■■□□□ 1.79
PUF60-218ENST00000531995 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa26.23■■□□□ 1.79
PUF60-218ENST00000531995 LRRC37A3O60309 1634 aa26.22■■□□□ 1.79
PUF60-218ENST00000531995 NLRP13Q86W25 1043 aa26.22■■□□□ 1.79
PUF60-218ENST00000531995 CABP1Q9NZU7 370 aa26.22■■□□□ 1.79
PUF60-218ENST00000531995 USP47Q96K76 1375 aa26.21■■□□□ 1.79
PUF60-218ENST00000531995 TRIM37O94972 964 aa26.21■■□□□ 1.79
PUF60-218ENST00000531995 TESK2Q96S53 571 aa26.21■■□□□ 1.79
PUF60-218ENST00000531995 NUP188Q5SRE5 1749 aa26.21■■□□□ 1.79
PUF60-218ENST00000531995 GCP02774 474 aa26.2■■□□□ 1.78
PUF60-218ENST00000531995 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa26.2■■□□□ 1.78
PUF60-218ENST00000531995 BARGINQ6ZT62 677 aa26.19■■□□□ 1.78
PUF60-218ENST00000531995 COL18A1P39060 1754 aa26.19■■□□□ 1.78
PUF60-218ENST00000531995 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
PUF60-218ENST00000531995 EVC2Q86UK5 1308 aa26.18■■□□□ 1.78
PUF60-218ENST00000531995 RGPD5Q99666 1765 aa26.18■■□□□ 1.78
PUF60-218ENST00000531995 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
PUF60-218ENST00000531995 TCP11L2Q8N4U5 519 aa26.18■■□□□ 1.78
PUF60-218ENST00000531995 FAM196AQ6ZSG2 479 aa26.17■■□□□ 1.78
PUF60-218ENST00000531995 MON2Q7Z3U7 1717 aa26.17■■□□□ 1.78
PUF60-218ENST00000531995 NLRP6P59044 892 aa26.16■■□□□ 1.78
PUF60-218ENST00000531995 CRB1P82279 1406 aa26.15■■□□□ 1.78
PUF60-218ENST00000531995 PDE3BQ13370 1112 aa26.15■■□□□ 1.78
PUF60-218ENST00000531995 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
PUF60-218ENST00000531995 PEAK1Q9H792 1746 aa26.14■■□□□ 1.78
PUF60-218ENST00000531995 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
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