RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516122.1

RNU6-871P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 871, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-871P, Length 100 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-871P-201ENST00000516122 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
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RNU6-871P-201ENST00000516122 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP2.92□□□□□ -1.94
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RNU6-871P-201ENST00000516122 BCRP11274 1271 aa2.89□□□□□ -1.95
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RNU6-871P-201ENST00000516122 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
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RNU6-871P-201ENST00000516122 ACDQ96AP0 544 aa2.88□□□□□ -1.95
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RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP2.86□□□□□ -1.95
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RNU6-871P-201ENST00000516122 EHBP1Q8NDI1 1231 aa2.86□□□□□ -1.95
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RNU6-871P-201ENST00000516122 MEIOBQ8N635 442 aa2.84□□□□□ -1.95
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RNU6-871P-201ENST00000516122 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP2.82□□□□□ -1.96
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RNU6-871P-201ENST00000516122 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-871P-201ENST00000516122 VARSP26640 1264 aaKnown RBP2.71□□□□□ -1.98
RNU6-871P-201ENST00000516122 DGKGP49619 791 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-871P-201ENST00000516122 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP2.71□□□□□ -1.98
RNU6-871P-201ENST00000516122 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP2.71□□□□□ -1.98
RNU6-871P-201ENST00000516122 C8AP07357 584 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-871P-201ENST00000516122 GRM5P41594 1212 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-871P-201ENST00000516122 GCGRP47871 477 aa2.7□□□□□ -1.98
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