RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515319.6

ZBED1-205, Transcript of zinc finger BED-type containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene ZBED1, Length 905 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1-205ENST00000515319 NBPF14Q5TI25 921 aa23.33■■□□□ 1.33
ZBED1-205ENST00000515319 SIRT1Q96EB6 747 aa23.33■■□□□ 1.33
ZBED1-205ENST00000515319 ALS2Q96Q42 1657 aa23.32■■□□□ 1.32
ZBED1-205ENST00000515319 PIK3C2GO75747 1445 aa23.32■■□□□ 1.32
ZBED1-205ENST00000515319 SPON1Q9HCB6 807 aa23.31■■□□□ 1.32
ZBED1-205ENST00000515319 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP23.3■■□□□ 1.32
ZBED1-205ENST00000515319 NINLQ9Y2I6 1382 aa23.29■■□□□ 1.32
ZBED1-205ENST00000515319 PRDM11Q9NQV5 511 aa23.29■■□□□ 1.32
ZBED1-205ENST00000515319 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa23.28■■□□□ 1.32
ZBED1-205ENST00000515319 GPRASP1Q5JY77 1395 aa23.27■■□□□ 1.32
ZBED1-205ENST00000515319 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa23.27■■□□□ 1.32
ZBED1-205ENST00000515319 ANKARQ7Z5J8 1434 aa23.27■■□□□ 1.32
ZBED1-205ENST00000515319 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
ZBED1-205ENST00000515319 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa23.27■■□□□ 1.32
ZBED1-205ENST00000515319 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa23.27■■□□□ 1.32
ZBED1-205ENST00000515319 KCNQ2O43526 872 aa23.26■■□□□ 1.31
ZBED1-205ENST00000515319 PRAM1Q96QH2 718 aa23.25■■□□□ 1.31
ZBED1-205ENST00000515319 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
ZBED1-205ENST00000515319 STRN4Q9NRL3 753 aa23.23■■□□□ 1.31
ZBED1-205ENST00000515319 PDE3BQ13370 1112 aa23.22■■□□□ 1.31
ZBED1-205ENST00000515319 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
ZBED1-205ENST00000515319 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
ZBED1-205ENST00000515319 POGKQ9P215 609 aa23.21■■□□□ 1.31
ZBED1-205ENST00000515319 USP35Q9P2H5 1018 aa23.21■■□□□ 1.31
ZBED1-205ENST00000515319 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
ZBED1-205ENST00000515319 KIAA0232Q92628 1395 aa23.19■■□□□ 1.3
ZBED1-205ENST00000515319 CHRNA2Q15822 529 aa23.19■■□□□ 1.3
ZBED1-205ENST00000515319 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa23.17■■□□□ 1.3
ZBED1-205ENST00000515319 CFAP70Q5T0N1 1121 aa23.17■■□□□ 1.3
ZBED1-205ENST00000515319 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
ZBED1-205ENST00000515319 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
ZBED1-205ENST00000515319 DLC1Q96QB1 1528 aa23.15■■□□□ 1.3
ZBED1-205ENST00000515319 BARGINQ6ZT62 677 aa23.15■■□□□ 1.3
ZBED1-205ENST00000515319 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
ZBED1-205ENST00000515319 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
ZBED1-205ENST00000515319 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.3
ZBED1-205ENST00000515319 EVA1CP58658 441 aa23.14■■□□□ 1.29
ZBED1-205ENST00000515319 NRKQ7Z2Y5 1582 aa23.13■■□□□ 1.29
ZBED1-205ENST00000515319 TULP4Q9NRJ4 1543 aa23.13■■□□□ 1.29
ZBED1-205ENST00000515319 PRR36Q9H6K5 1346 aa23.12■■□□□ 1.29
ZBED1-205ENST00000515319 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
ZBED1-205ENST00000515319 SSH2Q76I76 1423 aa23.11■■□□□ 1.29
ZBED1-205ENST00000515319 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
ZBED1-205ENST00000515319 CHD4Q14839 1912 aa23.1■■□□□ 1.29
ZBED1-205ENST00000515319 CASZ1Q86V15 1759 aa23.09■■□□□ 1.29
ZBED1-205ENST00000515319 IFFO2Q5TF58 517 aa23.09■■□□□ 1.29
ZBED1-205ENST00000515319 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
ZBED1-205ENST00000515319 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa23.09■■□□□ 1.29
ZBED1-205ENST00000515319 TCP11L2Q8N4U5 519 aa23.08■■□□□ 1.29
ZBED1-205ENST00000515319 MYOM1P52179 1685 aa23.07■■□□□ 1.28
ZBED1-205ENST00000515319 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
ZBED1-205ENST00000515319 ITSN1Q15811 1721 aa23.07■■□□□ 1.28
ZBED1-205ENST00000515319 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
ZBED1-205ENST00000515319 UTRNP46939 3433 aa23.05■■□□□ 1.28
ZBED1-205ENST00000515319 WASLO00401 505 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
ZBED1-205ENST00000515319 C1QTNF8P60827 252 aa23.05■■□□□ 1.28
ZBED1-205ENST00000515319 NUTM2GQ5VZR2 741 aa23.05■■□□□ 1.28
ZBED1-205ENST00000515319 TRAK1Q9UPV9 953 aa23.05■■□□□ 1.28
ZBED1-205ENST00000515319 ATP7BP35670 1465 aa23.05■■□□□ 1.28
ZBED1-205ENST00000515319 SBF2Q86WG5 1849 aa23.04■■□□□ 1.28
ZBED1-205ENST00000515319 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
ZBED1-205ENST00000515319 MPHOSPH9Q99550 1183 aa23.04■■□□□ 1.28
ZBED1-205ENST00000515319 ZBTB7AO95365 584 aa23.03■■□□□ 1.28
ZBED1-205ENST00000515319 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
ZBED1-205ENST00000515319 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
ZBED1-205ENST00000515319 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa23.01■■□□□ 1.27
ZBED1-205ENST00000515319 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa23.01■■□□□ 1.27
ZBED1-205ENST00000515319 OVOS2Q6IE36 1432 aa23.01■■□□□ 1.27
ZBED1-205ENST00000515319 PLSCR1O15162 318 aa23.01■■□□□ 1.27
ZBED1-205ENST00000515319 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
ZBED1-205ENST00000515319 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
ZBED1-205ENST00000515319 ADGRB1O14514 1584 aa23■■□□□ 1.27
ZBED1-205ENST00000515319 LMO7Q8WWI1 1683 aa23■■□□□ 1.27
ZBED1-205ENST00000515319 PEAK1Q9H792 1746 aa22.99■■□□□ 1.27
ZBED1-205ENST00000515319 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
ZBED1-205ENST00000515319 PTGER2P43116 358 aa22.98■■□□□ 1.27
ZBED1-205ENST00000515319 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
ZBED1-205ENST00000515319 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
ZBED1-205ENST00000515319 SYT17Q9BSW7 474 aa22.96■■□□□ 1.27
ZBED1-205ENST00000515319 CPDO75976 1380 aa22.95■■□□□ 1.26
ZBED1-205ENST00000515319 LRRC37A3O60309 1634 aa22.93■■□□□ 1.26
ZBED1-205ENST00000515319 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
ZBED1-205ENST00000515319 ABTB2Q8N961 1025 aa22.92■■□□□ 1.26
ZBED1-205ENST00000515319 STK32BQ9NY57 414 aa22.92■■□□□ 1.26
ZBED1-205ENST00000515319 DDB1Q16531 1140 aa22.91■■□□□ 1.26
ZBED1-205ENST00000515319 CRB1P82279 1406 aa22.91■■□□□ 1.26
ZBED1-205ENST00000515319 PTF1AQ7RTS3 328 aa22.9■■□□□ 1.26
ZBED1-205ENST00000515319 PROM2Q8N271 834 aa22.9■■□□□ 1.26
ZBED1-205ENST00000515319 ACEP12821 1306 aa22.89■■□□□ 1.26
ZBED1-205ENST00000515319 AKAP12Q02952 1782 aa22.89■■□□□ 1.25
ZBED1-205ENST00000515319 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
ZBED1-205ENST00000515319 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa22.88■■□□□ 1.25
ZBED1-205ENST00000515319 MTFR1LQ9H019 292 aa22.88■■□□□ 1.25
ZBED1-205ENST00000515319 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
ZBED1-205ENST00000515319 USP19O94966 1318 aa22.87■■□□□ 1.25
ZBED1-205ENST00000515319 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
ZBED1-205ENST00000515319 ZBTB7CA1YPR0 619 aa22.86■■□□□ 1.25
ZBED1-205ENST00000515319 SLC15A2Q16348 729 aa22.86■■□□□ 1.25
ZBED1-205ENST00000515319 WNK3Q9BYP7 1800 aa22.85■■□□□ 1.25
ZBED1-205ENST00000515319 GCP02774 474 aa22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.1 ms