RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513165.1

HOXC-AS3-202, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 533 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FAM83GA6ND36 823 aa24.07■■□□□ 1.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CABP2Q9NPB3 220 aa24.05■■□□□ 1.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 VPS72Q15906 364 aa24.04■■□□□ 1.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa24.04■■□□□ 1.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ABCA3Q99758 1704 aa24.04■■□□□ 1.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 EVC2Q86UK5 1308 aa24.03■■□□□ 1.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TONSLQ96HA7 1378 aa24.02■■□□□ 1.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 QRICH2Q9H0J4 1663 aa24.02■■□□□ 1.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ATAD2Q6PL18 1390 aa24.01■■□□□ 1.43
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NWD2Q9ULI1 1742 aa24.01■■□□□ 1.43
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa24.01■■□□□ 1.43
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RALGAPBQ86X10 1494 aa24■■□□□ 1.43
HOXC-AS3-202ENST00000513165 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CABP1Q9NZU7 370 aa23.99■■□□□ 1.43
HOXC-AS3-202ENST00000513165 BTG4Q9NY30 223 aa23.98■■□□□ 1.43
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PLCH1Q4KWH8 1693 aa23.97■■□□□ 1.43
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ABTB2Q8N961 1025 aa23.97■■□□□ 1.43
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GLI3P10071 1580 aa23.96■■□□□ 1.43
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CARD11Q9BXL7 1154 aa23.96■■□□□ 1.43
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PRDM11Q9NQV5 511 aa23.95■■□□□ 1.42
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
HOXC-AS3-202ENST00000513165 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa23.95■■□□□ 1.42
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NUTM2GQ5VZR2 741 aa23.93■■□□□ 1.42
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NLRP13Q86W25 1043 aa23.93■■□□□ 1.42
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa23.92■■□□□ 1.42
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CCDC125Q86Z20 511 aa23.92■■□□□ 1.42
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SEPT12Q8IYM1 358 aa23.92■■□□□ 1.42
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KIAA0232Q92628 1395 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXC-AS3-202ENST00000513165 USP6P35125 1406 aa23.9■■□□□ 1.42
HOXC-AS3-202ENST00000513165 USP19O94966 1318 aa23.89■■□□□ 1.42
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.41
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NRAPQ86VF7 1730 aa23.87■■□□□ 1.41
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa23.87■■□□□ 1.41
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa23.87■■□□□ 1.41
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GCP02774 474 aa23.87■■□□□ 1.41
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SSH2Q76I76 1423 aa23.86■■□□□ 1.41
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CHRNA2Q15822 529 aa23.86■■□□□ 1.41
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CPDO75976 1380 aa23.86■■□□□ 1.41
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NLRP6P59044 892 aa23.84■■□□□ 1.41
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.41
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KRT27Q7Z3Y8 459 aa23.83■■□□□ 1.41
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.41
HOXC-AS3-202ENST00000513165 EP400Q96L91 3159 aa23.83■■□□□ 1.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SLC24A1O60721 1099 aa23.82■■□□□ 1.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP23.81■■□□□ 1.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa23.81■■□□□ 1.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa23.81■■□□□ 1.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 BRWD3Q6RI45 1802 aa23.8■■□□□ 1.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 EVA1CP58658 441 aa23.8■■□□□ 1.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NRKQ7Z2Y5 1582 aa23.8■■□□□ 1.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 STRN4Q9NRL3 753 aa23.8■■□□□ 1.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa23.8■■□□□ 1.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TTC21AQ8NDW8 1320 aa23.8■■□□□ 1.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 A0A0G2JS52 829 aa23.79■■□□□ 1.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MYT1Q01538 1121 aa23.79■■□□□ 1.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CLSPNQ9HAW4 1339 aa23.78■■□□□ 1.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa23.76■■□□□ 1.39
HOXC-AS3-202ENST00000513165 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa23.75■■□□□ 1.39
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KCNH5Q8NCM2 988 aa23.75■■□□□ 1.39
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TESK2Q96S53 571 aa23.75■■□□□ 1.39
HOXC-AS3-202ENST00000513165 AKAP12Q02952 1782 aa23.75■■□□□ 1.39
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SLIT3O75094 1523 aa23.74■■□□□ 1.39
HOXC-AS3-202ENST00000513165 BARGINQ6ZT62 677 aa23.74■■□□□ 1.39
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TMC1Q8TDI8 760 aa23.73■■□□□ 1.39
HOXC-AS3-202ENST00000513165 AATKQ6ZMQ8 1374 aa23.73■■□□□ 1.39
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LMO7Q8WWI1 1683 aa23.73■■□□□ 1.39
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PCGF6Q9BYE7 350 aa23.72■■□□□ 1.39
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa23.72■■□□□ 1.39
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PIK3C2AO00443 1686 aa23.72■■□□□ 1.39
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TERF2IPQ9NYB0 399 aa23.71■■□□□ 1.39
HOXC-AS3-202ENST00000513165 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TCP11L2Q8N4U5 519 aa23.7■■□□□ 1.38
HOXC-AS3-202ENST00000513165 USP35Q9P2H5 1018 aa23.7■■□□□ 1.38
HOXC-AS3-202ENST00000513165 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa23.7■■□□□ 1.38
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CD163L1Q9NR16 1453 aa23.69■■□□□ 1.38
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ARHGEF25Q86VW2 580 aa23.69■■□□□ 1.38
HOXC-AS3-202ENST00000513165 USP31Q70CQ4 1352 aa23.68■■□□□ 1.38
HOXC-AS3-202ENST00000513165 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZBTB7CA1YPR0 619 aa23.67■■□□□ 1.38
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP23.67■■□□□ 1.38
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MON2Q7Z3U7 1717 aa23.67■■□□□ 1.38
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NINLQ9Y2I6 1382 aa23.66■■□□□ 1.38
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZRANB1Q9UGI0 708 aa23.66■■□□□ 1.38
HOXC-AS3-202ENST00000513165 AXIN2Q9Y2T1 843 aa23.65■■□□□ 1.38
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CRB1P82279 1406 aa23.65■■□□□ 1.38
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DEFB132Q7Z7B7 95 aa23.64■■□□□ 1.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TMF1P82094 1093 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FAM182BQ5T319 152 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FAM196AQ6ZSG2 479 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 USP47Q96K76 1375 aa23.63■■□□□ 1.37
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