RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503362.1

SPCS3-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS3, Length 4,571 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS3-201ENST00000503362 CHMP4AQ9BY43 222 aa16.27■□□□□ 0.2
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SPCS3-201ENST00000503362 KIAA2012Q0VF49 1180 aa16.26■□□□□ 0.19
SPCS3-201ENST00000503362 CD109Q6YHK3 1445 aa16.26■□□□□ 0.19
SPCS3-201ENST00000503362 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa16.25■□□□□ 0.19
SPCS3-201ENST00000503362 KDM2BQ8NHM5 1336 aa16.25■□□□□ 0.19
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SPCS3-201ENST00000503362 SLC4A2P04920 1241 aa16.24■□□□□ 0.19
SPCS3-201ENST00000503362 DCTN1Q14203 1278 aa16.24■□□□□ 0.19
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SPCS3-201ENST00000503362 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa16.23■□□□□ 0.19
SPCS3-201ENST00000503362 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
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SPCS3-201ENST00000503362 BCORL1Q5H9F3 1711 aa16.16■□□□□ 0.18
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SPCS3-201ENST00000503362 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
SPCS3-201ENST00000503362 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
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SPCS3-201ENST00000503362 C1orf141Q5JVX7 400 aa16.15■□□□□ 0.18
SPCS3-201ENST00000503362 CCDC30Q5VVM6 783 aa16.15■□□□□ 0.18
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SPCS3-201ENST00000503362 ERC2O15083 957 aa16.14■□□□□ 0.17
SPCS3-201ENST00000503362 SLC26A8Q96RN1 970 aa16.13■□□□□ 0.17
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SPCS3-201ENST00000503362 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
SPCS3-201ENST00000503362 CCT4P50991 539 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
SPCS3-201ENST00000503362 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa16.12■□□□□ 0.17
SPCS3-201ENST00000503362 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa16.12■□□□□ 0.17
SPCS3-201ENST00000503362 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa16.11■□□□□ 0.17
SPCS3-201ENST00000503362 ABCA8O94911 1581 aa16.11■□□□□ 0.17
SPCS3-201ENST00000503362 ASXL2Q76L83 1435 aa16.11■□□□□ 0.17
SPCS3-201ENST00000503362 NUCB1Q02818 461 aa16.11■□□□□ 0.17
SPCS3-201ENST00000503362 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
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