RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489475.5

HOXB3-210, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,845 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-210ENST00000489475 INSRP06213 1382 aa35.87■■■■□ 3.33
HOXB3-210ENST00000489475 COG3Q96JB2 828 aa35.85■■■■□ 3.33
HOXB3-210ENST00000489475 CFAP53Q96M91 514 aa35.85■■■■□ 3.33
HOXB3-210ENST00000489475 PHF8Q9UPP1 1060 aa35.85■■■■□ 3.33
HOXB3-210ENST00000489475 ZBED9Q6R2W3 1325 aa35.83■■■■□ 3.33
HOXB3-210ENST00000489475 SSH2Q76I76 1423 aa35.83■■■■□ 3.33
HOXB3-210ENST00000489475 TTC21AQ8NDW8 1320 aa35.83■■■■□ 3.33
HOXB3-210ENST00000489475 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP35.83■■■■□ 3.33
HOXB3-210ENST00000489475 ADAMTS8Q9UP79 889 aa35.82■■■■□ 3.32
HOXB3-210ENST00000489475 DMRT2Q9Y5R5 561 aa35.82■■■■□ 3.32
HOXB3-210ENST00000489475 ESCO1Q5FWF5 840 aa35.81■■■■□ 3.32
HOXB3-210ENST00000489475 ZRANB1Q9UGI0 708 aa35.8■■■■□ 3.32
HOXB3-210ENST00000489475 ATF3P18847 181 aa35.78■■■■□ 3.32
HOXB3-210ENST00000489475 DCCP43146 1447 aa35.78■■■■□ 3.32
HOXB3-210ENST00000489475 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP35.77■■■■□ 3.32
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP35.75■■■■□ 3.31
HOXB3-210ENST00000489475 MSH6P52701 1360 aa35.72■■■■□ 3.31
HOXB3-210ENST00000489475 AATKQ6ZMQ8 1374 aa35.72■■■■□ 3.31
HOXB3-210ENST00000489475 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa35.71■■■■□ 3.31
HOXB3-210ENST00000489475 OVOS2Q6IE36 1432 aa35.71■■■■□ 3.31
HOXB3-210ENST00000489475 C1orf167Q5SNV9 1468 aa35.71■■■■□ 3.31
HOXB3-210ENST00000489475 ORAI2Q96SN7 254 aa35.71■■■■□ 3.31
HOXB3-210ENST00000489475 CADPS2Q86UW7 1296 aa35.7■■■■□ 3.31
HOXB3-210ENST00000489475 POLKQ9UBT6 870 aa35.69■■■■□ 3.3
HOXB3-210ENST00000489475 LRRC7Q96NW7 1537 aa35.68■■■■□ 3.3
HOXB3-210ENST00000489475 PSME1Q06323 249 aa35.68■■■■□ 3.3
HOXB3-210ENST00000489475 SHPRHQ149N8 1683 aa35.68■■■■□ 3.3
HOXB3-210ENST00000489475 FBLN1P23142 703 aa35.67■■■■□ 3.3
HOXB3-210ENST00000489475 USP31Q70CQ4 1352 aa35.66■■■■□ 3.3
HOXB3-210ENST00000489475 MST1RQ04912 1400 aa35.66■■■■□ 3.3
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HOXB3-210ENST00000489475 PNPLA6Q8IY17 1366 aa35.65■■■■□ 3.3
HOXB3-210ENST00000489475 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa35.64■■■■□ 3.3
HOXB3-210ENST00000489475 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP35.64■■■■□ 3.3
HOXB3-210ENST00000489475 NUDCQ9Y266 331 aa35.64■■■■□ 3.3
HOXB3-210ENST00000489475 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP35.64■■■■□ 3.3
HOXB3-210ENST00000489475 PIK3C2AO00443 1686 aa35.62■■■■□ 3.29
HOXB3-210ENST00000489475 KIF1AQ12756 1690 aa35.62■■■■□ 3.29
HOXB3-210ENST00000489475 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP35.62■■■■□ 3.29
HOXB3-210ENST00000489475 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP35.62■■■■□ 3.29
HOXB3-210ENST00000489475 FOXO3O43524 673 aa35.61■■■■□ 3.29
HOXB3-210ENST00000489475 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa35.61■■■■□ 3.29
HOXB3-210ENST00000489475 NLRP6P59044 892 aa35.6■■■■□ 3.29
HOXB3-210ENST00000489475 ABTB2Q8N961 1025 aa35.6■■■■□ 3.29
HOXB3-210ENST00000489475 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP35.59■■■■□ 3.29
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HOXB3-210ENST00000489475 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP35.58■■■■□ 3.29
HOXB3-210ENST00000489475 CCDC146Q8IYE0 955 aa35.57■■■■□ 3.29
HOXB3-210ENST00000489475 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP35.56■■■■□ 3.28
HOXB3-210ENST00000489475 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP35.56■■■■□ 3.284e-6■■■■□ 20.8
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HOXB3-210ENST00000489475 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP35.53■■■■□ 3.28
HOXB3-210ENST00000489475 NUTM2GQ5VZR2 741 aa35.53■■■■□ 3.28
HOXB3-210ENST00000489475 USP54Q70EL1 1684 aa35.52■■■■□ 3.28
HOXB3-210ENST00000489475 SOX12O15370 315 aa35.51■■■■□ 3.28
HOXB3-210ENST00000489475 KRT28Q7Z3Y7 464 aa35.51■■■■□ 3.28
HOXB3-210ENST00000489475 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP35.5■■■■□ 3.27
HOXB3-210ENST00000489475 RUNDC1Q96C34 613 aa35.49■■■■□ 3.27
HOXB3-210ENST00000489475 APAF1O14727 1248 aa35.48■■■■□ 3.27
HOXB3-210ENST00000489475 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP35.45■■■■□ 3.27
HOXB3-210ENST00000489475 PDE3BQ13370 1112 aa35.45■■■■□ 3.27
HOXB3-210ENST00000489475 NGEFQ8N5V2 710 aa35.45■■■■□ 3.27
HOXB3-210ENST00000489475 MAP3K19Q56UN5 1328 aa35.44■■■■□ 3.26
HOXB3-210ENST00000489475 NPHP3Q7Z494 1330 aa35.44■■■■□ 3.26
HOXB3-210ENST00000489475 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP35.43■■■■□ 3.26
HOXB3-210ENST00000489475 SLAIN2Q9P270 581 aa35.43■■■■□ 3.26
HOXB3-210ENST00000489475 IL13P35225 146 aa35.42■■■■□ 3.26
HOXB3-210ENST00000489475 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa35.41■■■■□ 3.26
HOXB3-210ENST00000489475 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP35.41■■■■□ 3.26
HOXB3-210ENST00000489475 SBNO1A3KN83 1393 aa35.4■■■■□ 3.26
HOXB3-210ENST00000489475 LMOD2Q6P5Q4 547 aa35.39■■■■□ 3.26
HOXB3-210ENST00000489475 AMPHP49418 695 aa35.38■■■■□ 3.25
HOXB3-210ENST00000489475 BRINP3Q76B58 766 aa35.38■■■■□ 3.25
HOXB3-210ENST00000489475 FLT4P35916 1363 aa35.38■■■■□ 3.25
HOXB3-210ENST00000489475 PEAK1Q9H792 1746 aa35.38■■■■□ 3.25
HOXB3-210ENST00000489475 FCHSD2O94868 740 aa35.36■■■■□ 3.25
HOXB3-210ENST00000489475 TCP11L2Q8N4U5 519 aa35.36■■■■□ 3.25
HOXB3-210ENST00000489475 KCNH5Q8NCM2 988 aa35.36■■■■□ 3.25
HOXB3-210ENST00000489475 KIF24Q5T7B8 1368 aa35.36■■■■□ 3.25
HOXB3-210ENST00000489475 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP35.36■■■■□ 3.25
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HOXB3-210ENST00000489475 IQSEC2Q5JU85 1478 aa35.34■■■■□ 3.25
HOXB3-210ENST00000489475 PLEKHF1Q96S99 279 aa35.34■■■■□ 3.25
HOXB3-210ENST00000489475 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP35.33■■■■□ 3.25
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF521Q96K83 1311 aa35.33■■■■□ 3.25
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HOXB3-210ENST00000489475 ALS2Q96Q42 1657 aa35.3■■■■□ 3.24
HOXB3-210ENST00000489475 NFAT5O94916 1531 aa35.3■■■■□ 3.24
HOXB3-210ENST00000489475 RSPH6AQ9H0K4 717 aa35.29■■■■□ 3.24
HOXB3-210ENST00000489475 PXDNQ92626 1479 aa35.29■■■■□ 3.24
HOXB3-210ENST00000489475 CDCA7LQ96GN5 454 aa35.29■■■■□ 3.24
HOXB3-210ENST00000489475 USP19O94966 1318 aa35.29■■■■□ 3.24
HOXB3-210ENST00000489475 NEFMP07197 916 aa35.28■■■■□ 3.24
HOXB3-210ENST00000489475 SLIT3O75094 1523 aa35.27■■■■□ 3.24
HOXB3-210ENST00000489475 HMOX1P09601 288 aa35.27■■■■□ 3.24
HOXB3-210ENST00000489475 GOLGA2Q08379 1002 aa35.27■■■■□ 3.24
HOXB3-210ENST00000489475 NEUROD2Q15784 382 aa35.27■■■■□ 3.24
HOXB3-210ENST00000489475 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP35.27■■■■□ 3.24
HOXB3-210ENST00000489475 LTBP4Q8N2S1 1624 aa35.27■■■■□ 3.24
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