RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487034.5

RPL13-208, Transcript of ribosomal protein L13, human

TSL 1 (best)

Gene RPL13, Length 615 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPL13-208	ENST00000487034	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		32.2	■■■□□ 2.75
RPL13-208	ENST00000487034	COL14A1	Q05707	1796 aa	Known RBP	32.2	■■■□□ 2.75
RPL13-208	ENST00000487034	PLEKHG5	O94827	1062 aa		32.2	■■■□□ 2.75
RPL13-208	ENST00000487034	NEUROD1	Q13562	356 aa		32.2	■■■□□ 2.75
RPL13-208	ENST00000487034	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	32.18	■■■□□ 2.74
RPL13-208	ENST00000487034	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		32.18	■■■□□ 2.74
RPL13-208	ENST00000487034	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	32.18	■■■□□ 2.74
RPL13-208	ENST00000487034	FAM83G	A6ND36	823 aa		32.17	■■■□□ 2.74
RPL13-208	ENST00000487034	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	32.17	■■■□□ 2.74
RPL13-208	ENST00000487034	VPS72	Q15906	364 aa		32.14	■■■□□ 2.74
RPL13-208	ENST00000487034	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		32.13	■■■□□ 2.73
RPL13-208	ENST00000487034	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		32.13	■■■□□ 2.73
RPL13-208	ENST00000487034	ACE	P12821	1306 aa		32.12	■■■□□ 2.73
RPL13-208	ENST00000487034	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		32.11	■■■□□ 2.73
RPL13-208	ENST00000487034	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		32.09	■■■□□ 2.73
RPL13-208	ENST00000487034	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		32.08	■■■□□ 2.73
RPL13-208	ENST00000487034	PAK3	O75914	559 aa	Predicted RBP	32.07	■■■□□ 2.72
RPL13-208	ENST00000487034	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		32.07	■■■□□ 2.72
RPL13-208	ENST00000487034	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	32.06	■■■□□ 2.72
RPL13-208	ENST00000487034	CABP2	Q9NPB3	220 aa		32.05	■■■□□ 2.72
RPL13-208	ENST00000487034	ONECUT3	O60422	494 aa	Predicted RBP	32.04	■■■□□ 2.72
RPL13-208	ENST00000487034	BTG4	Q9NY30	223 aa		32.03	■■■□□ 2.72
RPL13-208	ENST00000487034	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	32.02	■■■□□ 2.72
RPL13-208	ENST00000487034	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		32.02	■■■□□ 2.72
RPL13-208	ENST00000487034	KIAA0232	Q92628	1395 aa		32.02	■■■□□ 2.72
RPL13-208	ENST00000487034	TONSL	Q96HA7	1378 aa		32.02	■■■□□ 2.72
RPL13-208	ENST00000487034	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		32.02	■■■□□ 2.72
RPL13-208	ENST00000487034	USP19	O94966	1318 aa		32.01	■■■□□ 2.72
RPL13-208	ENST00000487034	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		32.01	■■■□□ 2.71
RPL13-208	ENST00000487034	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		32	■■■□□ 2.71
RPL13-208	ENST00000487034	USP6	P35125	1406 aa		31.99	■■■□□ 2.71
RPL13-208	ENST00000487034	SSH2	Q76I76	1423 aa		31.99	■■■□□ 2.71
RPL13-208	ENST00000487034	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		31.98	■■■□□ 2.71
RPL13-208	ENST00000487034	PIK3C2A	O00443	1686 aa		31.97	■■■□□ 2.71
RPL13-208	ENST00000487034	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	31.96	■■■□□ 2.71
RPL13-208	ENST00000487034	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		31.96	■■■□□ 2.71
RPL13-208	ENST00000487034	AKAP12	Q02952	1782 aa		31.95	■■■□□ 2.71
RPL13-208	ENST00000487034	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		31.95	■■■□□ 2.7
RPL13-208	ENST00000487034	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		31.95	■■■□□ 2.7
RPL13-208	ENST00000487034	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	31.94	■■■□□ 2.7
RPL13-208	ENST00000487034	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	31.94	■■■□□ 2.7
RPL13-208	ENST00000487034	SLIT3	O75094	1523 aa		31.93	■■■□□ 2.7
RPL13-208	ENST00000487034	CPD	O75976	1380 aa		31.93	■■■□□ 2.7
RPL13-208	ENST00000487034	SBNO2	Q9Y2G9	1366 aa		31.93	■■■□□ 2.7
RPL13-208	ENST00000487034	CHRNA2	Q15822	529 aa		31.92	■■■□□ 2.7
RPL13-208	ENST00000487034	CABP1	Q9NZU7	370 aa		31.92	■■■□□ 2.7
RPL13-208	ENST00000487034	EVC2	Q86UK5	1308 aa		31.92	■■■□□ 2.7
RPL13-208	ENST00000487034	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		31.92	■■■□□ 2.7
RPL13-208	ENST00000487034	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	31.92	■■■□□ 2.7
RPL13-208	ENST00000487034	FAM98C	Q17RN3	349 aa	Known RBP	31.89	■■■□□ 2.7
RPL13-208	ENST00000487034	ABTB2	Q8N961	1025 aa		31.89	■■■□□ 2.7
RPL13-208	ENST00000487034	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	31.88	■■■□□ 2.69
RPL13-208	ENST00000487034	CCDC125	Q86Z20	511 aa		31.88	■■■□□ 2.69
RPL13-208	ENST00000487034	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		31.86	■■■□□ 2.69
RPL13-208	ENST00000487034	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		31.85	■■■□□ 2.69
RPL13-208	ENST00000487034	MON2	Q7Z3U7	1717 aa		31.85	■■■□□ 2.69
RPL13-208	ENST00000487034	CPSF1	Q10570	1443 aa	Known RBP	31.84	■■■□□ 2.69
RPL13-208	ENST00000487034	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		31.82	■■■□□ 2.68
RPL13-208	ENST00000487034	COL18A1	P39060	1754 aa		31.81	■■■□□ 2.68
RPL13-208	ENST00000487034	GC	P02774	474 aa		31.81	■■■□□ 2.68
RPL13-208	ENST00000487034	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	31.8	■■■□□ 2.68
RPL13-208	ENST00000487034	CD163L1	Q9NR16	1453 aa		31.8	■■■□□ 2.68
RPL13-208	ENST00000487034	NLRP13	Q86W25	1043 aa		31.8	■■■□□ 2.68
RPL13-208	ENST00000487034	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		31.78	■■■□□ 2.68
RPL13-208	ENST00000487034	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	31.78	■■■□□ 2.68
RPL13-208	ENST00000487034	STRN4	Q9NRL3	753 aa		31.77	■■■□□ 2.68
RPL13-208	ENST00000487034	USP54	Q70EL1	1684 aa		31.76	■■■□□ 2.68
RPL13-208	ENST00000487034	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		31.75	■■■□□ 2.67
RPL13-208	ENST00000487034		A0A0G2JS52	829 aa		31.75	■■■□□ 2.67
RPL13-208	ENST00000487034	MYT1	Q01538	1121 aa		31.75	■■■□□ 2.67
RPL13-208	ENST00000487034	NFAT5	O94916	1531 aa		31.75	■■■□□ 2.67
RPL13-208	ENST00000487034	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		31.74	■■■□□ 2.67
RPL13-208	ENST00000487034	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		31.74	■■■□□ 2.67
RPL13-208	ENST00000487034	LARP1	Q6PKG0	1096 aa	Known RBP	31.73	■■■□□ 2.67
RPL13-208	ENST00000487034	NLRP6	P59044	892 aa		31.72	■■■□□ 2.67
RPL13-208	ENST00000487034	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		31.71	■■■□□ 2.67
RPL13-208	ENST00000487034	FAM182B	Q5T319	152 aa		31.71	■■■□□ 2.67
RPL13-208	ENST00000487034	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	31.7	■■■□□ 2.67
RPL13-208	ENST00000487034	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		31.69	■■■□□ 2.66
RPL13-208	ENST00000487034	ZNF692	Q9BU19	519 aa	Predicted RBP	31.68	■■■□□ 2.66
RPL13-208	ENST00000487034	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		31.68	■■■□□ 2.66
RPL13-208	ENST00000487034	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		31.68	■■■□□ 2.66
RPL13-208	ENST00000487034	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	31.68	■■■□□ 2.66
RPL13-208	ENST00000487034	DISP2	A7MBM2	1401 aa		31.66	■■■□□ 2.66
RPL13-208	ENST00000487034	TESK2	Q96S53	571 aa		31.65	■■■□□ 2.66
RPL13-208	ENST00000487034	USP35	Q9P2H5	1018 aa		31.65	■■■□□ 2.66
RPL13-208	ENST00000487034	CRB1	P82279	1406 aa		31.65	■■■□□ 2.66
RPL13-208	ENST00000487034	RGPD5	Q99666	1765 aa		31.64	■■■□□ 2.66
RPL13-208	ENST00000487034	LRRC37A3	O60309	1634 aa		31.64	■■■□□ 2.65
RPL13-208	ENST00000487034	EVA1C	P58658	441 aa		31.63	■■■□□ 2.65
RPL13-208	ENST00000487034	ZRANB1	Q9UGI0	708 aa		31.63	■■■□□ 2.65
RPL13-208	ENST00000487034	ABCC6	O95255	1503 aa		31.62	■■■□□ 2.65
RPL13-208	ENST00000487034	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		31.62	■■■□□ 2.65
RPL13-208	ENST00000487034	USP31	Q70CQ4	1352 aa		31.61	■■■□□ 2.65
RPL13-208	ENST00000487034	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		31.61	■■■□□ 2.65
RPL13-208	ENST00000487034	PEAK1	Q9H792	1746 aa		31.61	■■■□□ 2.65
RPL13-208	ENST00000487034	AXIN2	Q9Y2T1	843 aa		31.6	■■■□□ 2.65
RPL13-208	ENST00000487034		A0A1W2PP64	1363 aa		31.59	■■■□□ 2.65
RPL13-208	ENST00000487034	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	31.59	■■■□□ 2.65
RPL13-208	ENST00000487034	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	31.58	■■■□□ 2.65

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