RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480273.5

RTEL1-TNFRSF6B-201, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 2

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 5,751 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OLFM4Q6UX06 510 aa20.65■□□□□ 0.9
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TRIM5Q9C035 493 aa20.65■□□□□ 0.9
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa20.64■□□□□ 0.9
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 AMOTL1Q8IY63 956 aa20.64■□□□□ 0.9
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HFM1A2PYH4 1435 aa20.64■□□□□ 0.89
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ERICH2A1L162 156 aa20.63■□□□□ 0.89
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP20.63■□□□□ 0.89
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NINLQ9Y2I6 1382 aa20.62■□□□□ 0.89
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RAD21O60216 631 aa20.62■□□□□ 0.89
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CDR1P51861 262 aa20.62■□□□□ 0.89
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SDF4Q9BRK5 362 aa20.62■□□□□ 0.89
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SLC52A1Q9NWF4 448 aa20.62■□□□□ 0.89
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 AKNAQ7Z591 1439 aa20.61■□□□□ 0.89
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NEK4P51957 841 aa20.6■□□□□ 0.89
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 POGZQ7Z3K3 1410 aa20.6■□□□□ 0.89
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CNTROBQ8N137 903 aa20.6■□□□□ 0.89
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RABEP1Q15276 862 aa20.59■□□□□ 0.89
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GGNBP2Q9H3C7 697 aa20.59■□□□□ 0.89
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NBPF1Q3BBV0 1214 aa20.59■□□□□ 0.89
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PKNOX2Q96KN3 472 aa20.59■□□□□ 0.89
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PRAM1Q96QH2 718 aa20.58■□□□□ 0.89
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SMC2O95347 1197 aa20.58■□□□□ 0.89
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CAGE1Q8TC20 777 aa20.58■□□□□ 0.88
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TTLL5Q6EMB2 1281 aa20.57■□□□□ 0.88
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa20.57■□□□□ 0.88
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CCDC141Q6ZP82 1450 aa20.57■□□□□ 0.88
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SPC24Q8NBT2 197 aa20.57■□□□□ 0.88
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NEUROD6Q96NK8 337 aa20.57■□□□□ 0.88
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TCP11L2Q8N4U5 519 aa20.56■□□□□ 0.88
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GRPEL1Q9HAV7 217 aa20.56■□□□□ 0.88
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MCM2P49736 904 aa20.56■□□□□ 0.88
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 WASHC4Q2M389 1173 aa20.55■□□□□ 0.88
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KIF14Q15058 1648 aa20.55■□□□□ 0.88
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ADGRL1O94910 1474 aa20.55■□□□□ 0.88
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PPP2R1AP30153 589 aa20.55■□□□□ 0.88
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 VPS37DQ86XT2 251 aa20.55■□□□□ 0.88
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 C1orf115Q9H7X2 142 aa20.55■□□□□ 0.88
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa20.54■□□□□ 0.88
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ESCO1Q5FWF5 840 aa20.54■□□□□ 0.88
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FSD1Q9BTV5 496 aa20.54■□□□□ 0.88
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KINO60870 393 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NLRP6P59044 892 aa20.53■□□□□ 0.88
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 H0YHG0 523 aa20.53■□□□□ 0.88
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KDM4AO75164 1064 aa20.53■□□□□ 0.88
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PDE3AQ14432 1141 aa20.53■□□□□ 0.88
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TRIM34Q9BYJ4 488 aa20.53■□□□□ 0.88
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CALRP27797 417 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MTHFSP49914 203 aa20.53■□□□□ 0.88
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SLC26A8Q96RN1 970 aa20.53■□□□□ 0.88
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 BCAR3O75815 825 aa20.53■□□□□ 0.88
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RIC3Q7Z5B4 369 aa20.53■□□□□ 0.88
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GCC1Q96CN9 775 aa20.52■□□□□ 0.88
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CCP110O43303 1012 aa20.52■□□□□ 0.88
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.87
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ANKLE2Q86XL3 938 aa20.52■□□□□ 0.87
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FMNL2Q96PY5 1086 aa20.51■□□□□ 0.87
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ERBINQ96RT1 1412 aa20.51■□□□□ 0.87
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 BRMS1Q9HCU9 246 aa20.5■□□□□ 0.87
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP20.5■□□□□ 0.879e-6■□□□□ 11.1
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 UQCRHLA0A096LP55 91 aa20.49■□□□□ 0.87
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SURF6O75683 361 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 UQCRHP07919 91 aa20.49■□□□□ 0.87
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PDCP20941 246 aa20.49■□□□□ 0.87
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MPNDQ8N594 471 aa20.49■□□□□ 0.87
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GNAI3P08754 354 aa20.49■□□□□ 0.87
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NBPF8Q3BBV2 869 aa20.48■□□□□ 0.87
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GPRASP1Q5JY77 1395 aa20.48■□□□□ 0.87
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LEKR1Q6ZMV7 388 aa20.48■□□□□ 0.87
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ABTB2Q8N961 1025 aa20.48■□□□□ 0.87
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NAIPQ13075 1403 aa20.47■□□□□ 0.87
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DCTN1Q14203 1278 aa20.47■□□□□ 0.87
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OFD1O75665 1012 aa20.47■□□□□ 0.87
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CCDC192P0DO97 292 aa20.47■□□□□ 0.87
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