RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470089.5

FBXO18-208, Transcript of F-box DNA helicase 1, humanhuman

TSL 5

Gene FBXO18, Length 979 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO18-208ENST00000470089 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP41.54■■■■■ 4.24
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FBXO18-208ENST00000470089 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa41.47■■■■■ 4.23
FBXO18-208ENST00000470089 BCL9LQ86UU0 1499 aa41.47■■■■■ 4.23
FBXO18-208ENST00000470089 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa41.45■■■■■ 4.23
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FBXO18-208ENST00000470089 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP41.44■■■■■ 4.22
FBXO18-208ENST00000470089 SLIT2O94813 1529 aa41.42■■■■■ 4.22
FBXO18-208ENST00000470089 ATRNO75882 1429 aa41.42■■■■■ 4.22
FBXO18-208ENST00000470089 PLCH1Q4KWH8 1693 aa41.42■■■■■ 4.22
FBXO18-208ENST00000470089 ATAD2Q6PL18 1390 aa41.39■■■■■ 4.22
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FBXO18-208ENST00000470089 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa41.38■■■■■ 4.21
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FBXO18-208ENST00000470089 USP6P35125 1406 aa41.37■■■■■ 4.21
FBXO18-208ENST00000470089 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP41.37■■■■■ 4.21
FBXO18-208ENST00000470089 ABTB2Q8N961 1025 aa41.37■■■■■ 4.21
FBXO18-208ENST00000470089 FAM83GA6ND36 823 aa41.35■■■■■ 4.21
FBXO18-208ENST00000470089 UNC5CLQ8IV45 518 aa41.35■■■■■ 4.21
FBXO18-208ENST00000470089 AKAP12Q02952 1782 aa41.35■■■■■ 4.21
FBXO18-208ENST00000470089 RGS12O14924 1447 aa41.35■■■■■ 4.21
FBXO18-208ENST00000470089 NWD2Q9ULI1 1742 aa41.34■■■■■ 4.21
FBXO18-208ENST00000470089 USP47Q96K76 1375 aa41.31■■■■■ 4.2
FBXO18-208ENST00000470089 TESK2Q96S53 571 aa41.31■■■■■ 4.2
FBXO18-208ENST00000470089 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP41.3■■■■■ 4.2
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FBXO18-208ENST00000470089 TMC1Q8TDI8 760 aa41.24■■■■■ 4.19
FBXO18-208ENST00000470089 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP41.24■■■■■ 4.19
FBXO18-208ENST00000470089 PRDM11Q9NQV5 511 aa41.24■■■■■ 4.19
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FBXO18-208ENST00000470089 NRAPQ86VF7 1730 aa41.24■■■■■ 4.19
FBXO18-208ENST00000470089 KIAA0232Q92628 1395 aa41.24■■■■■ 4.19
FBXO18-208ENST00000470089 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP41.23■■■■■ 4.19
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FBXO18-208ENST00000470089 BTG4Q9NY30 223 aa41.23■■■■■ 4.19
FBXO18-208ENST00000470089 PIK3C2AO00443 1686 aa41.23■■■■■ 4.19
FBXO18-208ENST00000470089 USP19O94966 1318 aa41.22■■■■■ 4.19
FBXO18-208ENST00000470089 GLI3P10071 1580 aa41.21■■■■■ 4.19
FBXO18-208ENST00000470089 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP41.21■■■■■ 4.19
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FBXO18-208ENST00000470089 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa41.19■■■■■ 4.19
FBXO18-208ENST00000470089 NLRP6P59044 892 aa41.19■■■■■ 4.18
FBXO18-208ENST00000470089 CHRNA2Q15822 529 aa41.19■■■■■ 4.18
FBXO18-208ENST00000470089 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa41.19■■■■■ 4.18
FBXO18-208ENST00000470089 VPS72Q15906 364 aa41.18■■■■■ 4.18
FBXO18-208ENST00000470089 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP41.18■■■■■ 4.18
FBXO18-208ENST00000470089 CD163L1Q9NR16 1453 aa41.17■■■■■ 4.18
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FBXO18-208ENST00000470089 TMF1P82094 1093 aa41.1■■■■■ 4.17
FBXO18-208ENST00000470089 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP41.1■■■■■ 4.17
FBXO18-208ENST00000470089 SLIT3O75094 1523 aa41.09■■■■■ 4.17
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FBXO18-208ENST00000470089 TERF2IPQ9NYB0 399 aa41.05■■■■■ 4.16
FBXO18-208ENST00000470089 ZBTB7CA1YPR0 619 aa41.04■■■■■ 4.16
FBXO18-208ENST00000470089 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP41.04■■■■■ 4.16
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FBXO18-208ENST00000470089 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa40.97■■■■■ 4.15
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FBXO18-208ENST00000470089 USP54Q70EL1 1684 aa40.91■■■■■ 4.14
FBXO18-208ENST00000470089 USP31Q70CQ4 1352 aa40.91■■■■■ 4.14
FBXO18-208ENST00000470089 COL18A1P39060 1754 aa40.89■■■■■ 4.14
FBXO18-208ENST00000470089 NFAT5O94916 1531 aa40.89■■■■■ 4.14
FBXO18-208ENST00000470089 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa40.89■■■■■ 4.14
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FBXO18-208ENST00000470089 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa40.88■■■■■ 4.14
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FBXO18-208ENST00000470089 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP40.87■■■■■ 4.13
FBXO18-208ENST00000470089 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP40.87■■■■■ 4.13
FBXO18-208ENST00000470089 ARHGEF25Q86VW2 580 aa40.86■■■■■ 4.13
FBXO18-208ENST00000470089 USP35Q9P2H5 1018 aa40.86■■■■■ 4.13
FBXO18-208ENST00000470089 MYOM1P52179 1685 aa40.85■■■■■ 4.13
FBXO18-208ENST00000470089 EP400Q96L91 3159 aa40.84■■■■■ 4.13
FBXO18-208ENST00000470089 RGPD5Q99666 1765 aa40.84■■■■■ 4.13
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