RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000457718.5

TNS3-208, Transcript of tensin 3, human

TSL 5

Gene TNS3, Length 3,836 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TNS3-208	ENST00000457718	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
TNS3-208	ENST00000457718	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TNS3-208	ENST00000457718	RRAGD	Q9NQL2	400 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
TNS3-208	ENST00000457718	ZFP91-CNTF	A0A0A6YYC7	529 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
TNS3-208	ENST00000457718	NEK4	P51957	841 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TNS3-208	ENST00000457718	IDI1	Q13907	227 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TNS3-208	ENST00000457718	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TNS3-208	ENST00000457718	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
TNS3-208	ENST00000457718	PBRM1	Q86U86	1689 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TNS3-208	ENST00000457718	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
TNS3-208	ENST00000457718	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TNS3-208	ENST00000457718	R3HCC1	Q9Y3T6	440 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
TNS3-208	ENST00000457718	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
TNS3-208	ENST00000457718	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TNS3-208	ENST00000457718	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
TNS3-208	ENST00000457718	ZNF521	Q96K83	1311 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TNS3-208	ENST00000457718	MCM10	Q7L590	875 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TNS3-208	ENST00000457718	NME9	Q86XW9	330 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TNS3-208	ENST00000457718	TSPYL6	Q8N831	410 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TNS3-208	ENST00000457718	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
TNS3-208	ENST00000457718	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
TNS3-208	ENST00000457718	FGD1	P98174	961 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TNS3-208	ENST00000457718	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TNS3-208	ENST00000457718	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TNS3-208	ENST00000457718	PLA2R1	Q13018	1463 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TNS3-208	ENST00000457718	SLC4A2	P04920	1241 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TNS3-208	ENST00000457718	PTMS	P20962	102 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TNS3-208	ENST00000457718	PIK3C2G	O75747	1445 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TNS3-208	ENST00000457718	REC8	O95072	547 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TNS3-208	ENST00000457718	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
TNS3-208	ENST00000457718	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TNS3-208	ENST00000457718	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
TNS3-208	ENST00000457718	GCC1	Q96CN9	775 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TNS3-208	ENST00000457718	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
TNS3-208	ENST00000457718	GOLGA6L4	A6NEF3	574 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TNS3-208	ENST00000457718	FYB1	O15117	783 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TNS3-208	ENST00000457718	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
TNS3-208	ENST00000457718	ZRANB1	Q9UGI0	708 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TNS3-208	ENST00000457718	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TNS3-208	ENST00000457718	KRT24	Q2M2I5	525 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TNS3-208	ENST00000457718		F6X3S4	739 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TNS3-208	ENST00000457718	DRC7	Q8IY82	874 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TNS3-208	ENST00000457718	NUCB2	P80303	420 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TNS3-208	ENST00000457718	NFE2L2	Q16236	605 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TNS3-208	ENST00000457718	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TNS3-208	ENST00000457718	NUP160	Q12769	1436 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TNS3-208	ENST00000457718	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
TNS3-208	ENST00000457718	FCHSD2	O94868	740 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TNS3-208	ENST00000457718	CFAP44	Q96MT7	982 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TNS3-208	ENST00000457718	UPF3B	Q9BZI7	483 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
TNS3-208	ENST00000457718	CCDC27	Q2M243	656 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TNS3-208	ENST00000457718	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TNS3-208	ENST00000457718	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
TNS3-208	ENST00000457718	CEP170	Q5SW79	1584 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TNS3-208	ENST00000457718	ADGRL1	O94910	1474 aa		13.33	□□□□□ -0.27
TNS3-208	ENST00000457718	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		13.33	□□□□□ -0.27
TNS3-208	ENST00000457718	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		13.33	□□□□□ -0.27
TNS3-208	ENST00000457718	LARP6	Q9BRS8	491 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.27
TNS3-208	ENST00000457718	IL1RAPL2	Q9NP60	686 aa		13.33	□□□□□ -0.27
TNS3-208	ENST00000457718	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
TNS3-208	ENST00000457718	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TNS3-208	ENST00000457718	PLCH2	O75038	1416 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TNS3-208	ENST00000457718	NUCB1	Q02818	461 aa		13.32	□□□□□ -0.28
TNS3-208	ENST00000457718	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		13.32	□□□□□ -0.28
TNS3-208	ENST00000457718	MBIP	Q9NS73	344 aa		13.32	□□□□□ -0.28
TNS3-208	ENST00000457718	RBM27	Q9P2N5	1060 aa	Known RBP	13.32	□□□□□ -0.28
TNS3-208	ENST00000457718		A0A0G2JS52	829 aa		13.32	□□□□□ -0.28
TNS3-208	ENST00000457718	RABEP1	Q15276	862 aa		13.32	□□□□□ -0.28
TNS3-208	ENST00000457718	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		13.32	□□□□□ -0.28
TNS3-208	ENST00000457718	USP19	O94966	1318 aa		13.32	□□□□□ -0.28
TNS3-208	ENST00000457718	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		13.32	□□□□□ -0.28
TNS3-208	ENST00000457718	GDPD2	Q9HCC8	539 aa		13.32	□□□□□ -0.28
TNS3-208	ENST00000457718	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		13.31	□□□□□ -0.28
TNS3-208	ENST00000457718	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	13.31	□□□□□ -0.28
TNS3-208	ENST00000457718	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		13.31	□□□□□ -0.28
TNS3-208	ENST00000457718	FANCA	O15360	1455 aa		13.31	□□□□□ -0.28
TNS3-208	ENST00000457718	SYAP1	Q96A49	352 aa	Predicted RBP	13.31	□□□□□ -0.28
TNS3-208	ENST00000457718	SYCE3	A1L190	88 aa		13.31	□□□□□ -0.28
TNS3-208	ENST00000457718	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		13.31	□□□□□ -0.28
TNS3-208	ENST00000457718	VPS37C	A5D8V6	355 aa	Predicted RBP	13.3	□□□□□ -0.28
TNS3-208	ENST00000457718	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	13.3	□□□□□ -0.28
TNS3-208	ENST00000457718	DTNB	O60941	627 aa		13.3	□□□□□ -0.28
TNS3-208	ENST00000457718	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		13.3	□□□□□ -0.28
TNS3-208	ENST00000457718	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	13.29	□□□□□ -0.28
TNS3-208	ENST00000457718	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		13.29	□□□□□ -0.28
TNS3-208	ENST00000457718	SMC5	Q8IY18	1101 aa		13.29	□□□□□ -0.28
TNS3-208	ENST00000457718	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
TNS3-208	ENST00000457718	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
TNS3-208	ENST00000457718	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		13.28	□□□□□ -0.28
TNS3-208	ENST00000457718	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		13.28	□□□□□ -0.28
TNS3-208	ENST00000457718	BAG4	O95429	457 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
TNS3-208	ENST00000457718	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	13.28	□□□□□ -0.28
TNS3-208	ENST00000457718	CHAMP1	Q96JM3	812 aa		13.28	□□□□□ -0.28
TNS3-208	ENST00000457718	FIBP	O43427	364 aa		13.28	□□□□□ -0.28
TNS3-208	ENST00000457718	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
TNS3-208	ENST00000457718	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		13.27	□□□□□ -0.28
TNS3-208	ENST00000457718	FOSB	P53539	338 aa		13.27	□□□□□ -0.29
TNS3-208	ENST00000457718	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		13.27	□□□□□ -0.29
TNS3-208	ENST00000457718	MEIS3	Q99687	375 aa		13.27	□□□□□ -0.29
TNS3-208	ENST00000457718	CIZ1	Q9ULV3	898 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.29

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