RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445150.3

SRP19-202, Transcript of signal recognition particle 19, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SRP19, Length 833 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP19-202ENST00000445150 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
SRP19-202ENST00000445150 USP6P35125 1406 aa24.44■■□□□ 1.5
SRP19-202ENST00000445150 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
SRP19-202ENST00000445150 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
SRP19-202ENST00000445150 ABTB2Q8N961 1025 aa24.43■■□□□ 1.5
SRP19-202ENST00000445150 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
SRP19-202ENST00000445150 TTC21AQ8NDW8 1320 aa24.42■■□□□ 1.5
SRP19-202ENST00000445150 NLRP13Q86W25 1043 aa24.42■■□□□ 1.5
SRP19-202ENST00000445150 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
SRP19-202ENST00000445150 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa24.38■■□□□ 1.49
SRP19-202ENST00000445150 ADAMTS2O95450 1211 aa24.38■■□□□ 1.49
SRP19-202ENST00000445150 POLR3GLQ9BT43 218 aa24.38■■□□□ 1.49
SRP19-202ENST00000445150 LRP6O75581 1613 aa24.36■■□□□ 1.49
SRP19-202ENST00000445150 NGLY1Q96IV0 654 aa24.36■■□□□ 1.49
SRP19-202ENST00000445150 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa24.36■■□□□ 1.49
SRP19-202ENST00000445150 ALS2Q96Q42 1657 aa24.36■■□□□ 1.49
SRP19-202ENST00000445150 SSH2Q76I76 1423 aa24.35■■□□□ 1.49
SRP19-202ENST00000445150 NLRP6P59044 892 aa24.35■■□□□ 1.49
SRP19-202ENST00000445150 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
SRP19-202ENST00000445150 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
SRP19-202ENST00000445150 A0A1W2PP64 1363 aa24.34■■□□□ 1.49
SRP19-202ENST00000445150 PLEKHG5O94827 1062 aa24.34■■□□□ 1.49
SRP19-202ENST00000445150 CABLES1Q8TDN4 633 aa24.34■■□□□ 1.49
SRP19-202ENST00000445150 C8orf37Q96NL8 207 aa24.34■■□□□ 1.49
SRP19-202ENST00000445150 AKAP12Q02952 1782 aa24.33■■□□□ 1.49
SRP19-202ENST00000445150 CD163L1Q9NR16 1453 aa24.32■■□□□ 1.48
SRP19-202ENST00000445150 NUTM2GQ5VZR2 741 aa24.32■■□□□ 1.48
SRP19-202ENST00000445150 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP24.31■■□□□ 1.48
SRP19-202ENST00000445150 KCNH5Q8NCM2 988 aa24.29■■□□□ 1.48
SRP19-202ENST00000445150 MON2Q7Z3U7 1717 aa24.28■■□□□ 1.48
SRP19-202ENST00000445150 USP19O94966 1318 aa24.28■■□□□ 1.48
SRP19-202ENST00000445150 AFF2P51816 1311 aa24.28■■□□□ 1.48
SRP19-202ENST00000445150 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
SRP19-202ENST00000445150 GCP02774 474 aa24.26■■□□□ 1.47
SRP19-202ENST00000445150 USP31Q70CQ4 1352 aa24.26■■□□□ 1.47
SRP19-202ENST00000445150 PRDM11Q9NQV5 511 aa24.25■■□□□ 1.47
SRP19-202ENST00000445150 USP21Q9UK80 565 aa24.25■■□□□ 1.47
SRP19-202ENST00000445150 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
SRP19-202ENST00000445150 NME9Q86XW9 330 aa24.23■■□□□ 1.47
SRP19-202ENST00000445150 COG3Q96JB2 828 aa24.23■■□□□ 1.47
SRP19-202ENST00000445150 KIF7Q2M1P5 1343 aa24.23■■□□□ 1.47
SRP19-202ENST00000445150 NRKQ7Z2Y5 1582 aa24.23■■□□□ 1.47
SRP19-202ENST00000445150 FAM83GA6ND36 823 aa24.21■■□□□ 1.47
SRP19-202ENST00000445150 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
SRP19-202ENST00000445150 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
SRP19-202ENST00000445150 CPDO75976 1380 aa24.2■■□□□ 1.46
SRP19-202ENST00000445150 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
SRP19-202ENST00000445150 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
SRP19-202ENST00000445150 ABCA3Q99758 1704 aa24.19■■□□□ 1.46
SRP19-202ENST00000445150 PIK3C2AO00443 1686 aa24.19■■□□□ 1.46
SRP19-202ENST00000445150 UNC5CLQ8IV45 518 aa24.19■■□□□ 1.46
SRP19-202ENST00000445150 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
SRP19-202ENST00000445150 PANK3Q9H999 370 aa24.19■■□□□ 1.46
SRP19-202ENST00000445150 KIAA0232Q92628 1395 aa24.18■■□□□ 1.46
SRP19-202ENST00000445150 CGNL1Q0VF96 1302 aa24.18■■□□□ 1.46
SRP19-202ENST00000445150 NSD3Q9BZ95 1437 aa24.18■■□□□ 1.46
SRP19-202ENST00000445150 CCDC7Q96M83 1385 aa24.17■■□□□ 1.46
SRP19-202ENST00000445150 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
SRP19-202ENST00000445150 SLIT3O75094 1523 aa24.17■■□□□ 1.46
SRP19-202ENST00000445150 CARD14Q9BXL6 1004 aa24.17■■□□□ 1.46
SRP19-202ENST00000445150 MYOM1P52179 1685 aa24.17■■□□□ 1.46
SRP19-202ENST00000445150 SLIT2O94813 1529 aa24.16■■□□□ 1.46
SRP19-202ENST00000445150 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa24.16■■□□□ 1.46
SRP19-202ENST00000445150 FYB1O15117 783 aa24.16■■□□□ 1.46
SRP19-202ENST00000445150 RXRBP28702 533 aa24.15■■□□□ 1.46
SRP19-202ENST00000445150 POTEAQ6S8J7 498 aa24.15■■□□□ 1.46
SRP19-202ENST00000445150 BTG4Q9NY30 223 aa24.15■■□□□ 1.46
SRP19-202ENST00000445150 ZRANB1Q9UGI0 708 aa24.15■■□□□ 1.46
SRP19-202ENST00000445150 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.46
SRP19-202ENST00000445150 KNSTRNQ9Y448 316 aa24.14■■□□□ 1.45
SRP19-202ENST00000445150 WASHC2AQ641Q2 1341 aa24.13■■□□□ 1.45
SRP19-202ENST00000445150 EVA1CP58658 441 aa24.13■■□□□ 1.45
SRP19-202ENST00000445150 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
SRP19-202ENST00000445150 GGNBP2Q9H3C7 697 aa24.13■■□□□ 1.45
SRP19-202ENST00000445150 BCL9LQ86UU0 1499 aa24.13■■□□□ 1.45
SRP19-202ENST00000445150 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa24.12■■□□□ 1.45
SRP19-202ENST00000445150 OVOS2Q6IE36 1432 aa24.12■■□□□ 1.45
SRP19-202ENST00000445150 ZBTB7CA1YPR0 619 aa24.12■■□□□ 1.45
SRP19-202ENST00000445150 SOX12O15370 315 aa24.12■■□□□ 1.45
SRP19-202ENST00000445150 CHRNA2Q15822 529 aa24.12■■□□□ 1.45
SRP19-202ENST00000445150 ARHGEF25Q86VW2 580 aa24.12■■□□□ 1.45
SRP19-202ENST00000445150 AATKQ6ZMQ8 1374 aa24.12■■□□□ 1.45
SRP19-202ENST00000445150 USP54Q70EL1 1684 aa24.11■■□□□ 1.45
SRP19-202ENST00000445150 VPS72Q15906 364 aa24.1■■□□□ 1.45
SRP19-202ENST00000445150 NWD2Q9ULI1 1742 aa24.1■■□□□ 1.45
SRP19-202ENST00000445150 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
SRP19-202ENST00000445150 ATRNO75882 1429 aa24.09■■□□□ 1.45
SRP19-202ENST00000445150 NSD2O96028 1365 aa24.08■■□□□ 1.45
SRP19-202ENST00000445150 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
SRP19-202ENST00000445150 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
SRP19-202ENST00000445150 PLCH1Q4KWH8 1693 aa24.05■■□□□ 1.44
SRP19-202ENST00000445150 STRN4Q9NRL3 753 aa24.05■■□□□ 1.44
SRP19-202ENST00000445150 NFAT5O94916 1531 aa24.05■■□□□ 1.44
SRP19-202ENST00000445150 ABCC6O95255 1503 aa24.03■■□□□ 1.44
SRP19-202ENST00000445150 KIF20BQ96Q89 1820 aa24.03■■□□□ 1.44
SRP19-202ENST00000445150 AMPHP49418 695 aa24.02■■□□□ 1.44
SRP19-202ENST00000445150 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
SRP19-202ENST00000445150 MORC1Q86VD1 984 aa24■■□□□ 1.43
SRP19-202ENST00000445150 IP6K1Q92551 441 aa24■■□□□ 1.43
SRP19-202ENST00000445150 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms