RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443528.5

ACTB-206, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 4

Gene ACTB, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-206ENST00000443528 NGLY1Q96IV0 654 aa22.11■■□□□ 1.13
ACTB-206ENST00000443528 USP6P35125 1406 aa22.11■■□□□ 1.13
ACTB-206ENST00000443528 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
ACTB-206ENST00000443528 ABCA3Q99758 1704 aa22.09■■□□□ 1.13
ACTB-206ENST00000443528 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
ACTB-206ENST00000443528 SSH2Q76I76 1423 aa22.09■■□□□ 1.13
ACTB-206ENST00000443528 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
ACTB-206ENST00000443528 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
ACTB-206ENST00000443528 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
ACTB-206ENST00000443528 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
ACTB-206ENST00000443528 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
ACTB-206ENST00000443528 TMF1P82094 1093 aa22.07■■□□□ 1.12
ACTB-206ENST00000443528 NUTM2GQ5VZR2 741 aa22.07■■□□□ 1.12
ACTB-206ENST00000443528 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa22.07■■□□□ 1.12
ACTB-206ENST00000443528 CD163L1Q9NR16 1453 aa22.07■■□□□ 1.12
ACTB-206ENST00000443528 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa22.06■■□□□ 1.12
ACTB-206ENST00000443528 ABTB2Q8N961 1025 aa22.06■■□□□ 1.12
ACTB-206ENST00000443528 TMC1Q8TDI8 760 aa22.06■■□□□ 1.12
ACTB-206ENST00000443528 AKAP12Q02952 1782 aa22.04■■□□□ 1.12
ACTB-206ENST00000443528 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
ACTB-206ENST00000443528 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
ACTB-206ENST00000443528 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP22.03■■□□□ 1.12
ACTB-206ENST00000443528 USP21Q9UK80 565 aa22.03■■□□□ 1.12
ACTB-206ENST00000443528 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa22.03■■□□□ 1.12
ACTB-206ENST00000443528 BCL9LQ86UU0 1499 aa22.03■■□□□ 1.12
ACTB-206ENST00000443528 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
ACTB-206ENST00000443528 USP19O94966 1318 aa22.02■■□□□ 1.12
ACTB-206ENST00000443528 SLIT2O94813 1529 aa22.01■■□□□ 1.11
ACTB-206ENST00000443528 FAM83GA6ND36 823 aa22.01■■□□□ 1.11
ACTB-206ENST00000443528 NRKQ7Z2Y5 1582 aa22■■□□□ 1.11
ACTB-206ENST00000443528 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
ACTB-206ENST00000443528 NLRP13Q86W25 1043 aa22■■□□□ 1.11
ACTB-206ENST00000443528 A0A1W2PP64 1363 aa21.99■■□□□ 1.11
ACTB-206ENST00000443528 NINLQ9Y2I6 1382 aa21.99■■□□□ 1.11
ACTB-206ENST00000443528 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
ACTB-206ENST00000443528 MON2Q7Z3U7 1717 aa21.99■■□□□ 1.11
ACTB-206ENST00000443528 PIK3C2AO00443 1686 aa21.98■■□□□ 1.11
ACTB-206ENST00000443528 NLRP6P59044 892 aa21.98■■□□□ 1.11
ACTB-206ENST00000443528 CDCA8Q53HL2 280 aa21.98■■□□□ 1.11
ACTB-206ENST00000443528 TERF2IPQ9NYB0 399 aa21.98■■□□□ 1.11
ACTB-206ENST00000443528 TTC21AQ8NDW8 1320 aa21.98■■□□□ 1.11
ACTB-206ENST00000443528 ATRNO75882 1429 aa21.97■■□□□ 1.11
ACTB-206ENST00000443528 RXRBP28702 533 aa21.97■■□□□ 1.11
ACTB-206ENST00000443528 UNC5CLQ8IV45 518 aa21.96■■□□□ 1.11
ACTB-206ENST00000443528 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
ACTB-206ENST00000443528 GCP02774 474 aa21.95■■□□□ 1.1
ACTB-206ENST00000443528 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
ACTB-206ENST00000443528 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP21.95■■□□□ 1.1
ACTB-206ENST00000443528 KIAA0232Q92628 1395 aa21.95■■□□□ 1.1
ACTB-206ENST00000443528 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
ACTB-206ENST00000443528 PLCH1Q4KWH8 1693 aa21.95■■□□□ 1.1
ACTB-206ENST00000443528 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
ACTB-206ENST00000443528 SLIT3O75094 1523 aa21.93■■□□□ 1.1
ACTB-206ENST00000443528 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
ACTB-206ENST00000443528 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa21.93■■□□□ 1.1
ACTB-206ENST00000443528 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
ACTB-206ENST00000443528 PRDM11Q9NQV5 511 aa21.93■■□□□ 1.1
ACTB-206ENST00000443528 SOCS7O14512 581 aa21.92■■□□□ 1.1
ACTB-206ENST00000443528 CHRNA2Q15822 529 aa21.92■■□□□ 1.1
ACTB-206ENST00000443528 BTG4Q9NY30 223 aa21.92■■□□□ 1.1
ACTB-206ENST00000443528 ZRANB1Q9UGI0 708 aa21.92■■□□□ 1.1
ACTB-206ENST00000443528 NWD2Q9ULI1 1742 aa21.92■■□□□ 1.1
ACTB-206ENST00000443528 CPDO75976 1380 aa21.91■■□□□ 1.1
ACTB-206ENST00000443528 NME9Q86XW9 330 aa21.91■■□□□ 1.1
ACTB-206ENST00000443528 USP31Q70CQ4 1352 aa21.9■■□□□ 1.1
ACTB-206ENST00000443528 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
ACTB-206ENST00000443528 MYOM1P52179 1685 aa21.89■■□□□ 1.1
ACTB-206ENST00000443528 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
ACTB-206ENST00000443528 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
ACTB-206ENST00000443528 VPS72Q15906 364 aa21.88■■□□□ 1.09
ACTB-206ENST00000443528 NRAPQ86VF7 1730 aa21.88■■□□□ 1.09
ACTB-206ENST00000443528 RGS12O14924 1447 aa21.87■■□□□ 1.09
ACTB-206ENST00000443528 GLI3P10071 1580 aa21.86■■□□□ 1.09
ACTB-206ENST00000443528 USP54Q70EL1 1684 aa21.85■■□□□ 1.09
ACTB-206ENST00000443528 KCNH5Q8NCM2 988 aa21.85■■□□□ 1.09
ACTB-206ENST00000443528 POLR3GLQ9BT43 218 aa21.84■■□□□ 1.09
ACTB-206ENST00000443528 CARD14Q9BXL6 1004 aa21.84■■□□□ 1.09
ACTB-206ENST00000443528 LMO7Q8WWI1 1683 aa21.84■■□□□ 1.09
ACTB-206ENST00000443528 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa21.84■■□□□ 1.09
ACTB-206ENST00000443528 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa21.83■■□□□ 1.09
ACTB-206ENST00000443528 OVOS2Q6IE36 1432 aa21.83■■□□□ 1.09
ACTB-206ENST00000443528 SOX12O15370 315 aa21.83■■□□□ 1.09
ACTB-206ENST00000443528 ARHGEF25Q86VW2 580 aa21.83■■□□□ 1.09
ACTB-206ENST00000443528 NFAT5O94916 1531 aa21.83■■□□□ 1.09
ACTB-206ENST00000443528 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
ACTB-206ENST00000443528 AATKQ6ZMQ8 1374 aa21.82■■□□□ 1.08
ACTB-206ENST00000443528 ZBTB7CA1YPR0 619 aa21.81■■□□□ 1.08
ACTB-206ENST00000443528 FYB1O15117 783 aa21.8■■□□□ 1.08
ACTB-206ENST00000443528 STRN4Q9NRL3 753 aa21.8■■□□□ 1.08
ACTB-206ENST00000443528 COL18A1P39060 1754 aa21.79■■□□□ 1.08
ACTB-206ENST00000443528 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa21.79■■□□□ 1.08
ACTB-206ENST00000443528 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa21.79■■□□□ 1.08
ACTB-206ENST00000443528 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
ACTB-206ENST00000443528 AXIN2Q9Y2T1 843 aa21.78■■□□□ 1.08
ACTB-206ENST00000443528 NSD3Q9BZ95 1437 aa21.78■■□□□ 1.08
ACTB-206ENST00000443528 EVA1CP58658 441 aa21.77■■□□□ 1.08
ACTB-206ENST00000443528 COG3Q96JB2 828 aa21.77■■□□□ 1.08
ACTB-206ENST00000443528 GGNBP2Q9H3C7 697 aa21.77■■□□□ 1.08
ACTB-206ENST00000443528 KIF7Q2M1P5 1343 aa21.77■■□□□ 1.07
ACTB-206ENST00000443528 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.07
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