RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441908.6

PQLC3-204, Transcript of PQ loop repeat containing 3, human

TSL 2 BASIC

Gene PQLC3, Length 1,784 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PQLC3-204	ENST00000441908	ZNF692	Q9BU19	519 aa	Predicted RBP	33.92	■■■■□ 3.02
PQLC3-204	ENST00000441908	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		33.91	■■■■□ 3.02
PQLC3-204	ENST00000441908	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		33.9	■■■■□ 3.02
PQLC3-204	ENST00000441908	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		33.9	■■■■□ 3.02
PQLC3-204	ENST00000441908	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	33.9	■■■■□ 3.02
PQLC3-204	ENST00000441908	SBNO1	A3KN83	1393 aa		33.9	■■■■□ 3.02
PQLC3-204	ENST00000441908	ALS2	Q96Q42	1657 aa		33.88	■■■■□ 3.01
PQLC3-204	ENST00000441908	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		33.88	■■■■□ 3.01
PQLC3-204	ENST00000441908	JCAD	Q9P266	1359 aa		33.88	■■■■□ 3.01
PQLC3-204	ENST00000441908	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		33.87	■■■■□ 3.01
PQLC3-204	ENST00000441908	SHPRH	Q149N8	1683 aa		33.86	■■■■□ 3.01
PQLC3-204	ENST00000441908	SSH2	Q76I76	1423 aa		33.85	■■■■□ 3.01
PQLC3-204	ENST00000441908	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		33.85	■■■■□ 3.01
PQLC3-204	ENST00000441908	PANK3	Q9H999	370 aa		33.85	■■■■□ 3.01
PQLC3-204	ENST00000441908	ABTB2	Q8N961	1025 aa		33.84	■■■■□ 3.01
PQLC3-204	ENST00000441908	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		33.83	■■■■□ 3.01
PQLC3-204	ENST00000441908	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		33.83	■■■■□ 3.01
PQLC3-204	ENST00000441908	EDC4	Q6P2E9	1401 aa	Known RBP	33.81	■■■■□ 3
PQLC3-204	ENST00000441908	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	33.81	■■■■□ 3
PQLC3-204	ENST00000441908	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	33.81	■■■■□ 3
PQLC3-204	ENST00000441908	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	33.81	■■■■□ 3
PQLC3-204	ENST00000441908	PIK3C2A	O00443	1686 aa		33.81	■■■■□ 3
PQLC3-204	ENST00000441908	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		33.79	■■■■□ 3
PQLC3-204	ENST00000441908	ARHGEF10	O15013	1369 aa		33.79	■■■■□ 3
PQLC3-204	ENST00000441908	NME9	Q86XW9	330 aa		33.79	■■■■□ 3
PQLC3-204	ENST00000441908	ZRANB1	Q9UGI0	708 aa		33.79	■■■■□ 3
PQLC3-204	ENST00000441908	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	33.77	■■■■□ 3
PQLC3-204	ENST00000441908	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	33.76	■■■■□ 3
PQLC3-204	ENST00000441908	NLRP6	P59044	892 aa		33.75	■■■□□ 2.99
PQLC3-204	ENST00000441908	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		33.74	■■■□□ 2.99
PQLC3-204	ENST00000441908	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	33.72	■■■□□ 2.99
PQLC3-204	ENST00000441908	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	33.72	■■■□□ 2.99
PQLC3-204	ENST00000441908	ABCA3	Q99758	1704 aa		33.71	■■■□□ 2.99
PQLC3-204	ENST00000441908	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	33.71	■■■□□ 2.99
PQLC3-204	ENST00000441908	LRP6	O75581	1613 aa		33.7	■■■□□ 2.99
PQLC3-204	ENST00000441908	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	33.7	■■■□□ 2.99
PQLC3-204	ENST00000441908	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		33.7	■■■□□ 2.98
PQLC3-204	ENST00000441908	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		33.69	■■■□□ 2.98
PQLC3-204	ENST00000441908	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		33.69	■■■□□ 2.98
PQLC3-204	ENST00000441908	SOX12	O15370	315 aa		33.69	■■■□□ 2.98
PQLC3-204	ENST00000441908	ADAMTS2	O95450	1211 aa		33.69	■■■□□ 2.98
PQLC3-204	ENST00000441908	NLRP13	Q86W25	1043 aa		33.69	■■■□□ 2.98
PQLC3-204	ENST00000441908	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		33.69	■■■□□ 2.98
PQLC3-204	ENST00000441908	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	33.67	■■■□□ 2.98
PQLC3-204	ENST00000441908	FYB1	O15117	783 aa		33.67	■■■□□ 2.98
PQLC3-204	ENST00000441908	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	33.66	■■■□□ 2.98
PQLC3-204	ENST00000441908	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	33.65	■■■□□ 2.98
PQLC3-204	ENST00000441908	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		33.64	■■■□□ 2.98
PQLC3-204	ENST00000441908	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		33.62	■■■□□ 2.97
PQLC3-204	ENST00000441908	USP19	O94966	1318 aa		33.61	■■■□□ 2.97
PQLC3-204	ENST00000441908	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	33.61	■■■□□ 2.97
PQLC3-204	ENST00000441908	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	33.6	■■■□□ 2.97
PQLC3-204	ENST00000441908	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	33.6	■■■□□ 2.97
PQLC3-204	ENST00000441908	USP31	Q70CQ4	1352 aa		33.6	■■■□□ 2.97
PQLC3-204	ENST00000441908	COG3	Q96JB2	828 aa		33.6	■■■□□ 2.97
PQLC3-204	ENST00000441908	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		33.59	■■■□□ 2.97
PQLC3-204	ENST00000441908	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		33.59	■■■□□ 2.97
PQLC3-204	ENST00000441908	GC	P02774	474 aa		33.59	■■■□□ 2.97
PQLC3-204	ENST00000441908	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		33.57	■■■□□ 2.97
PQLC3-204	ENST00000441908	USP54	Q70EL1	1684 aa		33.57	■■■□□ 2.96
PQLC3-204	ENST00000441908	FBLN1	P23142	703 aa		33.57	■■■□□ 2.96
PQLC3-204	ENST00000441908	SLIT3	O75094	1523 aa		33.57	■■■□□ 2.96
PQLC3-204	ENST00000441908	C8orf37	Q96NL8	207 aa		33.56	■■■□□ 2.96
PQLC3-204	ENST00000441908	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	33.53	■■■□□ 2.96
PQLC3-204	ENST00000441908	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	33.52	■■■□□ 2.96
PQLC3-204	ENST00000441908	KIAA0232	Q92628	1395 aa		33.52	■■■□□ 2.96
PQLC3-204	ENST00000441908	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		33.51	■■■□□ 2.96
PQLC3-204	ENST00000441908	CHRNA2	Q15822	529 aa		33.51	■■■□□ 2.95
PQLC3-204	ENST00000441908	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	33.5	■■■□□ 2.95
PQLC3-204	ENST00000441908	NFAT5	O94916	1531 aa		33.49	■■■□□ 2.95
PQLC3-204	ENST00000441908	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		33.49	■■■□□ 2.95
PQLC3-204	ENST00000441908	FAM83G	A6ND36	823 aa		33.48	■■■□□ 2.95
PQLC3-204	ENST00000441908	NGLY1	Q96IV0	654 aa		33.48	■■■□□ 2.95
PQLC3-204	ENST00000441908	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		33.48	■■■□□ 2.95
PQLC3-204	ENST00000441908	LTN1	O94822	1766 aa		33.46	■■■□□ 2.95
PQLC3-204	ENST00000441908	MORC1	Q86VD1	984 aa		33.44	■■■□□ 2.94
PQLC3-204	ENST00000441908	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	33.43	■■■□□ 2.94
PQLC3-204	ENST00000441908	NSD2	O96028	1365 aa		33.43	■■■□□ 2.94
PQLC3-204	ENST00000441908	PLCH1	Q4KWH8	1693 aa		33.42	■■■□□ 2.94
PQLC3-204	ENST00000441908	AFF2	P51816	1311 aa		33.41	■■■□□ 2.94
PQLC3-204	ENST00000441908	CPD	O75976	1380 aa		33.4	■■■□□ 2.94
PQLC3-204	ENST00000441908	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		33.4	■■■□□ 2.94
PQLC3-204	ENST00000441908	COL14A1	Q05707	1796 aa	Known RBP	33.4	■■■□□ 2.94
PQLC3-204	ENST00000441908	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	33.39	■■■□□ 2.94
PQLC3-204	ENST00000441908	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	33.38	■■■□□ 2.93
PQLC3-204	ENST00000441908	BTG4	Q9NY30	223 aa		33.38	■■■□□ 2.93
PQLC3-204	ENST00000441908	RGPD5	Q99666	1765 aa		33.38	■■■□□ 2.93
PQLC3-204	ENST00000441908	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		33.37	■■■□□ 2.93
PQLC3-204	ENST00000441908	USP21	Q9UK80	565 aa		33.34	■■■□□ 2.93
PQLC3-204	ENST00000441908	AXIN2	Q9Y2T1	843 aa		33.34	■■■□□ 2.93
PQLC3-204	ENST00000441908	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		33.34	■■■□□ 2.93
PQLC3-204	ENST00000441908	COL18A1	P39060	1754 aa		33.34	■■■□□ 2.93
PQLC3-204	ENST00000441908	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	33.34	■■■□□ 2.93
PQLC3-204	ENST00000441908	SLIT2	O94813	1529 aa		33.34	■■■□□ 2.93
PQLC3-204	ENST00000441908	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		33.33	■■■□□ 2.93
PQLC3-204	ENST00000441908	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		33.33	■■■□□ 2.93
PQLC3-204	ENST00000441908	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		33.33	■■■□□ 2.93
PQLC3-204	ENST00000441908	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	33.33	■■■□□ 2.93
PQLC3-204	ENST00000441908	STRN4	Q9NRL3	753 aa		33.32	■■■□□ 2.92
PQLC3-204	ENST00000441908	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	33.32	■■■□□ 2.92

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