RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429299.2

LTB-210, Transcript of lymphotoxin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LTB, Length 897 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTB-210ENST00000429299 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP28.69■■■□□ 2.18
LTB-210ENST00000429299 RGPD1P0DJD0 1748 aa28.68■■■□□ 2.18
LTB-210ENST00000429299 ADGRB2O60241 1585 aa28.67■■■□□ 2.18
LTB-210ENST00000429299 PRDM11Q9NQV5 511 aa28.67■■■□□ 2.18
LTB-210ENST00000429299 TRAK1Q9UPV9 953 aa28.67■■■□□ 2.18
LTB-210ENST00000429299 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP28.66■■■□□ 2.18
LTB-210ENST00000429299 ALS2Q96Q42 1657 aa28.66■■■□□ 2.18
LTB-210ENST00000429299 PRR36Q9H6K5 1346 aa28.66■■■□□ 2.18
LTB-210ENST00000429299 WASLO00401 505 aaPredicted RBP28.65■■■□□ 2.18
LTB-210ENST00000429299 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP28.65■■■□□ 2.18
LTB-210ENST00000429299 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP28.65■■■□□ 2.18
LTB-210ENST00000429299 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.18
LTB-210ENST00000429299 FAM196AQ6ZSG2 479 aa28.64■■■□□ 2.18
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LTB-210ENST00000429299 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa28.62■■■□□ 2.17
LTB-210ENST00000429299 ADGRB1O14514 1584 aa28.61■■■□□ 2.17
LTB-210ENST00000429299 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa28.61■■■□□ 2.17
LTB-210ENST00000429299 TULP4Q9NRJ4 1543 aa28.6■■■□□ 2.17
LTB-210ENST00000429299 TRIM37O94972 964 aa28.6■■■□□ 2.17
LTB-210ENST00000429299 PARD3Q8TEW0 1356 aa28.57■■■□□ 2.16
LTB-210ENST00000429299 APBA3O96018 575 aa28.56■■■□□ 2.16
LTB-210ENST00000429299 KIAA0232Q92628 1395 aa28.56■■■□□ 2.16
LTB-210ENST00000429299 STAC3Q96MF2 364 aa28.55■■■□□ 2.16
LTB-210ENST00000429299 STRN4Q9NRL3 753 aa28.55■■■□□ 2.16
LTB-210ENST00000429299 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
LTB-210ENST00000429299 CHRNA2Q15822 529 aa28.54■■■□□ 2.16
LTB-210ENST00000429299 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa28.53■■■□□ 2.16
LTB-210ENST00000429299 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa28.53■■■□□ 2.16
LTB-210ENST00000429299 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
LTB-210ENST00000429299 EVA1CP58658 441 aa28.51■■■□□ 2.15
LTB-210ENST00000429299 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
LTB-210ENST00000429299 PDE3BQ13370 1112 aa28.51■■■□□ 2.15
LTB-210ENST00000429299 BARGINQ6ZT62 677 aa28.51■■■□□ 2.15
LTB-210ENST00000429299 DCAF11Q8TEB1 546 aa28.51■■■□□ 2.15
LTB-210ENST00000429299 USP35Q9P2H5 1018 aa28.49■■■□□ 2.15
LTB-210ENST00000429299 NBPF8Q3BBV2 869 aa28.48■■■□□ 2.15
LTB-210ENST00000429299 NBPF14Q5TI25 921 aa28.48■■■□□ 2.15
LTB-210ENST00000429299 ATP7BP35670 1465 aa28.46■■■□□ 2.15
LTB-210ENST00000429299 NUTM2GQ5VZR2 741 aa28.45■■■□□ 2.14
LTB-210ENST00000429299 TCP11L2Q8N4U5 519 aa28.43■■■□□ 2.14
LTB-210ENST00000429299 CDK19Q9BWU1 502 aa28.43■■■□□ 2.14
LTB-210ENST00000429299 SSH2Q76I76 1423 aa28.43■■■□□ 2.14
LTB-210ENST00000429299 CCDC61Q9Y6R9 512 aa28.42■■■□□ 2.14
LTB-210ENST00000429299 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP28.41■■■□□ 2.14
LTB-210ENST00000429299 YY1P25490 414 aa28.41■■■□□ 2.14
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LTB-210ENST00000429299 ACEP12821 1306 aa28.41■■■□□ 2.14
LTB-210ENST00000429299 ITSN1Q15811 1721 aa28.4■■■□□ 2.14
LTB-210ENST00000429299 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
LTB-210ENST00000429299 PLEKHG3A1L390 1219 aa28.39■■■□□ 2.14
LTB-210ENST00000429299 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP28.39■■■□□ 2.14
LTB-210ENST00000429299 ABTB2Q8N961 1025 aa28.39■■■□□ 2.14
LTB-210ENST00000429299 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.13
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LTB-210ENST00000429299 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa28.37■■■□□ 2.13
LTB-210ENST00000429299 SPON1Q9HCB6 807 aa28.37■■■□□ 2.13
LTB-210ENST00000429299 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa28.36■■■□□ 2.13
LTB-210ENST00000429299 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
LTB-210ENST00000429299 RREB1Q92766 1687 aa28.35■■■□□ 2.13
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LTB-210ENST00000429299 NLRP13Q86W25 1043 aa28.33■■■□□ 2.13
LTB-210ENST00000429299 USP19O94966 1318 aa28.32■■■□□ 2.12
LTB-210ENST00000429299 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
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LTB-210ENST00000429299 NUP188Q5SRE5 1749 aa28.31■■■□□ 2.12
LTB-210ENST00000429299 NRKQ7Z2Y5 1582 aa28.28■■■□□ 2.12
LTB-210ENST00000429299 LMO7Q8WWI1 1683 aa28.27■■■□□ 2.12
LTB-210ENST00000429299 PLSCR1O15162 318 aa28.27■■■□□ 2.12
LTB-210ENST00000429299 NINLQ9Y2I6 1382 aa28.26■■■□□ 2.12
LTB-210ENST00000429299 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa28.24■■■□□ 2.11
LTB-210ENST00000429299 CRB1P82279 1406 aa28.23■■■□□ 2.11
LTB-210ENST00000429299 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
LTB-210ENST00000429299 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
LTB-210ENST00000429299 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa28.22■■■□□ 2.11
LTB-210ENST00000429299 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa28.22■■■□□ 2.11
LTB-210ENST00000429299 OVOS2Q6IE36 1432 aa28.22■■■□□ 2.11
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LTB-210ENST00000429299 DDB1Q16531 1140 aa28.19■■■□□ 2.1
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LTB-210ENST00000429299 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa28.18■■■□□ 2.1
LTB-210ENST00000429299 NLRP6P59044 892 aa28.16■■■□□ 2.1
LTB-210ENST00000429299 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa28.15■■■□□ 2.1
LTB-210ENST00000429299 ZBTB7CA1YPR0 619 aa28.14■■■□□ 2.1
LTB-210ENST00000429299 NBPF1Q3BBV0 1214 aa28.14■■■□□ 2.1
LTB-210ENST00000429299 CABP2Q9NPB3 220 aa28.14■■■□□ 2.1
LTB-210ENST00000429299 PEAK1Q9H792 1746 aa28.14■■■□□ 2.1
LTB-210ENST00000429299 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP28.13■■■□□ 2.09
LTB-210ENST00000429299 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP28.13■■■□□ 2.09
LTB-210ENST00000429299 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP28.13■■■□□ 2.09
LTB-210ENST00000429299 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa28.13■■■□□ 2.09
LTB-210ENST00000429299 PROM2Q8N271 834 aa28.12■■■□□ 2.09
LTB-210ENST00000429299 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP28.12■■■□□ 2.09
LTB-210ENST00000429299 CABP1Q9NZU7 370 aa28.11■■■□□ 2.09
LTB-210ENST00000429299 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa28.11■■■□□ 2.09
LTB-210ENST00000429299 PTF1AQ7RTS3 328 aa28.1■■■□□ 2.09
LTB-210ENST00000429299 SBF2Q86WG5 1849 aa28.1■■■□□ 2.09
LTB-210ENST00000429299 BCL9O00512 1426 aa28.09■■■□□ 2.09
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