RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428584.5

TTC28-AS1-207, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC28-AS1, Length 5,859 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP17.85■□□□□ 0.45
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP17.85■□□□□ 0.45
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP17.85■□□□□ 0.45
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa17.85■□□□□ 0.45
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ERICH3Q5RHP9 1530 aa17.85■□□□□ 0.45
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GRIN2BQ13224 1484 aa17.84■□□□□ 0.45
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NEK4P51957 841 aa17.84■□□□□ 0.45
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SMC2O95347 1197 aa17.84■□□□□ 0.45
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SURF6O75683 361 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
TTC28-AS1-207ENST00000428584 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SMARCE1Q969G3 411 aa17.84■□□□□ 0.45
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa17.84■□□□□ 0.45
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NLRP2Q9NX02 1062 aa17.83■□□□□ 0.45
TTC28-AS1-207ENST00000428584 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GNAI2P04899 355 aa17.82■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP17.82■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP17.82■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MYO6Q9UM54 1294 aa17.82■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FYB1O15117 783 aa17.82■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FILIP1LQ4L180 1135 aa17.82■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP17.82■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-207ENST00000428584 AEBP1Q8IUX7 1158 aa17.82■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP17.82■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-207ENST00000428584 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP17.82■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-207ENST00000428584 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP17.82■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ODF2Q5BJF6 829 aa17.81■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-207ENST00000428584 OFD1O75665 1012 aa17.81■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NLRP6P59044 892 aa17.81■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PRKAR2BP31323 418 aa17.81■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-207ENST00000428584 EFCAB5A4FU69 1503 aa17.81■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-207ENST00000428584 DCTN1Q14203 1278 aa17.8■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NCAPD3P42695 1498 aa17.8■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP17.8■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-207ENST00000428584 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa17.8■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TMEM132EQ6IEE7 984 aa17.79■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-207ENST00000428584 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa17.79■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CCDC66A2RUB6 948 aa17.78■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ANKRD1Q15327 319 aa17.78■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-207ENST00000428584 C1orf115Q9H7X2 142 aa17.78■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-207ENST00000428584 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP17.78■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-207ENST00000428584 AKNAQ7Z591 1439 aa17.78■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CCT4P50991 539 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TXLNAP40222 546 aa17.78■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KIF6Q6ZMV9 814 aa17.78■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-207ENST00000428584 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP17.77■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-207ENST00000428584 WDR63Q8IWG1 891 aa17.77■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa17.77■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FIBPO43427 364 aa17.77■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-207ENST00000428584 STK38Q15208 465 aa17.77■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa17.77■□□□□ 0.44
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CCDC192P0DO97 292 aa17.77■□□□□ 0.43
TTC28-AS1-207ENST00000428584 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.43
TTC28-AS1-207ENST00000428584 BACH2Q9BYV9 841 aa17.77■□□□□ 0.43
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP17.76■□□□□ 0.43
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RDXP35241 583 aaKnown RBP17.76■□□□□ 0.43
TTC28-AS1-207ENST00000428584 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP17.76■□□□□ 0.43
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TTLL5Q6EMB2 1281 aa17.76■□□□□ 0.43
TTC28-AS1-207ENST00000428584 JMYQ8N9B5 988 aa17.76■□□□□ 0.43
TTC28-AS1-207ENST00000428584 LRRCC1Q9C099 1032 aa17.76■□□□□ 0.43
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TTC39AQ5SRH9 613 aa17.75■□□□□ 0.43
TTC28-AS1-207ENST00000428584 BRPF3Q9ULD4 1205 aa17.75■□□□□ 0.43
TTC28-AS1-207ENST00000428584 DACH1Q9UI36 760 aa17.75■□□□□ 0.43
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CFAP70Q5T0N1 1121 aa17.75■□□□□ 0.43
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NUTM2GQ5VZR2 741 aa17.75■□□□□ 0.43
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa17.75■□□□□ 0.43
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KDM4AO75164 1064 aa17.75■□□□□ 0.43
TTC28-AS1-207ENST00000428584 BCAR3O75815 825 aa17.75■□□□□ 0.43
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP17.74■□□□□ 0.43
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CCDC158Q5M9N0 1113 aa17.74■□□□□ 0.43
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ABTB2Q8N961 1025 aa17.74■□□□□ 0.43
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MVPQ14764 893 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
TTC28-AS1-207ENST00000428584 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP17.74■□□□□ 0.43
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ERBINQ96RT1 1412 aa17.73■□□□□ 0.43
TTC28-AS1-207ENST00000428584 H0YHG0 523 aa17.73■□□□□ 0.43
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa17.73■□□□□ 0.43
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TNMDQ9H2S6 317 aa17.73■□□□□ 0.43
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GRPEL1Q9HAV7 217 aa17.73■□□□□ 0.43
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CFTRP13569 1480 aa17.72■□□□□ 0.43
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SPC24Q8NBT2 197 aa17.72■□□□□ 0.43
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SLC4A2P04920 1241 aa17.72■□□□□ 0.43
TTC28-AS1-207ENST00000428584 LEKR1Q6ZMV7 388 aa17.72■□□□□ 0.43
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CCDC191Q8NCU4 936 aa17.72■□□□□ 0.43
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FMNL2Q96PY5 1086 aa17.72■□□□□ 0.43
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CHD1LQ86WJ1 897 aa17.71■□□□□ 0.43
TTC28-AS1-207ENST00000428584 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP17.71■□□□□ 0.43
TTC28-AS1-207ENST00000428584 C9orf84Q5VXU9 1444 aa17.71■□□□□ 0.43
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SERPINC1P01008 464 aa17.71■□□□□ 0.43
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TATP17735 454 aaPredicted RBP17.71■□□□□ 0.43
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CALRP27797 417 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.43
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa17.71■□□□□ 0.43
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP17.71■□□□□ 0.43
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa17.7■□□□□ 0.42
TTC28-AS1-207ENST00000428584 HECW1Q76N89 1606 aa17.7■□□□□ 0.42
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.4 ms