RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419302.1

PDCL2P1-201, Transcript of phosducin-like 2 pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene PDCL2P1, Length 352 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2P1-201ENST00000419302 TSC1Q92574 1164 aa7.84□□□□□ -1.15
PDCL2P1-201ENST00000419302 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa7.84□□□□□ -1.15
PDCL2P1-201ENST00000419302 VARSP26640 1264 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
PDCL2P1-201ENST00000419302 RIC3Q7Z5B4 369 aa7.83□□□□□ -1.16
PDCL2P1-201ENST00000419302 TLL2Q9Y6L7 1015 aa7.83□□□□□ -1.16
PDCL2P1-201ENST00000419302 SPTLC1O15269 473 aa7.82□□□□□ -1.16
PDCL2P1-201ENST00000419302 HRCP23327 699 aa7.82□□□□□ -1.16
PDCL2P1-201ENST00000419302 LYPD8Q6UX82 237 aa7.82□□□□□ -1.16
PDCL2P1-201ENST00000419302 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP7.81□□□□□ -1.16
PDCL2P1-201ENST00000419302 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP7.81□□□□□ -1.16
PDCL2P1-201ENST00000419302 CFAP99D6REC4 459 aa7.81□□□□□ -1.16
PDCL2P1-201ENST00000419302 BMP1P13497 986 aa7.81□□□□□ -1.16
PDCL2P1-201ENST00000419302 AGERQ15109 404 aa7.81□□□□□ -1.16
PDCL2P1-201ENST00000419302 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP7.81□□□□□ -1.16
PDCL2P1-201ENST00000419302 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
PDCL2P1-201ENST00000419302 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP7.81□□□□□ -1.16
PDCL2P1-201ENST00000419302 TERTO14746 1132 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
PDCL2P1-201ENST00000419302 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
PDCL2P1-201ENST00000419302 PDE4DQ08499 809 aa7.8□□□□□ -1.16
PDCL2P1-201ENST00000419302 CABLES1Q8TDN4 633 aa7.8□□□□□ -1.16
PDCL2P1-201ENST00000419302 NNTQ13423 1086 aa7.79□□□□□ -1.16
PDCL2P1-201ENST00000419302 FAM174AQ8TBP5 190 aa7.79□□□□□ -1.16
PDCL2P1-201ENST00000419302 MAP10Q9P2G4 905 aa7.79□□□□□ -1.16
PDCL2P1-201ENST00000419302 ARID5BQ14865 1188 aa7.78□□□□□ -1.16
PDCL2P1-201ENST00000419302 MYSM1Q5VVJ2 828 aa7.77□□□□□ -1.17
PDCL2P1-201ENST00000419302 SLC16A10Q8TF71 515 aa7.77□□□□□ -1.17
PDCL2P1-201ENST00000419302 SLC24A3Q9HC58 644 aa7.77□□□□□ -1.17
PDCL2P1-201ENST00000419302 LOC100996750A0A140TA64 210 aa7.76□□□□□ -1.17
PDCL2P1-201ENST00000419302 TRIM46Q7Z4K8 759 aa7.76□□□□□ -1.17
PDCL2P1-201ENST00000419302 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP7.76□□□□□ -1.17
PDCL2P1-201ENST00000419302 FOXJ1Q92949 421 aa7.76□□□□□ -1.17
PDCL2P1-201ENST00000419302 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa7.76□□□□□ -1.17
PDCL2P1-201ENST00000419302 LIMD1Q9UGP4 676 aa7.76□□□□□ -1.17
PDCL2P1-201ENST00000419302 ADH1CP00326 375 aa7.75□□□□□ -1.17
PDCL2P1-201ENST00000419302 F12P00748 615 aaPredicted RBP7.75□□□□□ -1.17
PDCL2P1-201ENST00000419302 LORP23490 312 aaPredicted RBP7.75□□□□□ -1.17
PDCL2P1-201ENST00000419302 WDR4P57081 412 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
PDCL2P1-201ENST00000419302 SCARF1Q14162 830 aa7.75□□□□□ -1.17
PDCL2P1-201ENST00000419302 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP7.75□□□□□ -1.17
PDCL2P1-201ENST00000419302 MPNDQ8N594 471 aa7.75□□□□□ -1.17
PDCL2P1-201ENST00000419302 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
PDCL2P1-201ENST00000419302 QPCTQ16769 361 aa7.74□□□□□ -1.17
PDCL2P1-201ENST00000419302 ARMC2Q8NEN0 867 aa7.74□□□□□ -1.17
PDCL2P1-201ENST00000419302 CLK2P49760 499 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
PDCL2P1-201ENST00000419302 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
PDCL2P1-201ENST00000419302 ZFP42Q96MM3 310 aa7.73□□□□□ -1.17
PDCL2P1-201ENST00000419302 RSPH6AQ9H0K4 717 aa7.73□□□□□ -1.17
PDCL2P1-201ENST00000419302 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
PDCL2P1-201ENST00000419302 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP7.73□□□□□ -1.17
PDCL2P1-201ENST00000419302 LILRB3O75022 631 aa7.72□□□□□ -1.17
PDCL2P1-201ENST00000419302 TUSC1Q2TAM9 212 aa7.72□□□□□ -1.17
PDCL2P1-201ENST00000419302 NBPF14Q5TI25 921 aa7.72□□□□□ -1.17
PDCL2P1-201ENST00000419302 TIMP2P16035 220 aa7.71□□□□□ -1.18
PDCL2P1-201ENST00000419302 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP7.71□□□□□ -1.18
PDCL2P1-201ENST00000419302 POLR3EQ9NVU0 708 aa7.71□□□□□ -1.18
PDCL2P1-201ENST00000419302 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa7.7□□□□□ -1.18
PDCL2P1-201ENST00000419302 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP7.7□□□□□ -1.18
PDCL2P1-201ENST00000419302 NR5A1Q13285 461 aa7.7□□□□□ -1.18
PDCL2P1-201ENST00000419302 CDK15Q96Q40 435 aa7.7□□□□□ -1.18
PDCL2P1-201ENST00000419302 VEGFBP49765 207 aa7.69□□□□□ -1.18
PDCL2P1-201ENST00000419302 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
PDCL2P1-201ENST00000419302 IRF7Q92985 503 aa7.69□□□□□ -1.18
PDCL2P1-201ENST00000419302 UPP2O95045 317 aa7.68□□□□□ -1.18
PDCL2P1-201ENST00000419302 C4orf48Q5BLP8 95 aa7.68□□□□□ -1.18
PDCL2P1-201ENST00000419302 NPAS3Q8IXF0 933 aa7.68□□□□□ -1.18
PDCL2P1-201ENST00000419302 NR3C2P08235 984 aa7.67□□□□□ -1.18
PDCL2P1-201ENST00000419302 FSHRP23945 695 aa7.67□□□□□ -1.18
PDCL2P1-201ENST00000419302 C6orf118Q5T5N4 469 aa7.67□□□□□ -1.18
PDCL2P1-201ENST00000419302 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP7.67□□□□□ -1.18
PDCL2P1-201ENST00000419302 ITPKCQ96DU7 683 aa7.67□□□□□ -1.18
PDCL2P1-201ENST00000419302 CARD14Q9BXL6 1004 aa7.67□□□□□ -1.18
PDCL2P1-201ENST00000419302 ZFAND3Q9H8U3 227 aa7.67□□□□□ -1.18
PDCL2P1-201ENST00000419302 MAN1A2O60476 641 aa7.66□□□□□ -1.18
PDCL2P1-201ENST00000419302 GMPRP36959 345 aa7.66□□□□□ -1.18
PDCL2P1-201ENST00000419302 FAM181BA6NEQ2 426 aa7.65□□□□□ -1.18
PDCL2P1-201ENST00000419302 BMP2P12643 396 aa7.65□□□□□ -1.18
PDCL2P1-201ENST00000419302 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
PDCL2P1-201ENST00000419302 SOBPA7XYQ1 873 aa7.64□□□□□ -1.19
PDCL2P1-201ENST00000419302 H3BM21 787 aa7.64□□□□□ -1.19
PDCL2P1-201ENST00000419302 GRM5P41594 1212 aa7.64□□□□□ -1.19
PDCL2P1-201ENST00000419302 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa7.64□□□□□ -1.19
PDCL2P1-201ENST00000419302 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP7.64□□□□□ -1.19
PDCL2P1-201ENST00000419302 CTDSPL2Q05D32 466 aa7.63□□□□□ -1.19
PDCL2P1-201ENST00000419302 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa7.63□□□□□ -1.19
PDCL2P1-201ENST00000419302 LINC00528Q8N1L1 170 aa7.63□□□□□ -1.19
PDCL2P1-201ENST00000419302 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa7.63□□□□□ -1.19
PDCL2P1-201ENST00000419302 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa7.63□□□□□ -1.19
PDCL2P1-201ENST00000419302 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP7.62□□□□□ -1.19
PDCL2P1-201ENST00000419302 CCDC116Q8IYX3 515 aa7.62□□□□□ -1.19
PDCL2P1-201ENST00000419302 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa7.62□□□□□ -1.19
PDCL2P1-201ENST00000419302 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa7.62□□□□□ -1.19
PDCL2P1-201ENST00000419302 ERBB4Q15303 1308 aa7.61□□□□□ -1.19
PDCL2P1-201ENST00000419302 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP7.61□□□□□ -1.19
PDCL2P1-201ENST00000419302 MEIOBQ8N635 442 aa7.61□□□□□ -1.19
PDCL2P1-201ENST00000419302 DDRGK1Q96HY6 314 aa7.61□□□□□ -1.19
PDCL2P1-201ENST00000419302 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa7.61□□□□□ -1.19
PDCL2P1-201ENST00000419302 ERFEQ4G0M1 354 aa7.6□□□□□ -1.19
PDCL2P1-201ENST00000419302 ZBTB33Q86T24 672 aa7.6□□□□□ -1.19
PDCL2P1-201ENST00000419302 LRRN4Q8WUT4 740 aa7.6□□□□□ -1.19
PDCL2P1-201ENST00000419302 SLC10A4Q96EP9 437 aa7.6□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.5 ms