RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417497.5

TTC28-AS1-202, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene TTC28-AS1, Length 627 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-202ENST00000417497 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP18.8■□□□□ 0.6
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TTC28-AS1-202ENST00000417497 ABCA3Q99758 1704 aa18.79■□□□□ 0.6
TTC28-AS1-202ENST00000417497 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
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TTC28-AS1-202ENST00000417497 TESK2Q96S53 571 aa18.76■□□□□ 0.59
TTC28-AS1-202ENST00000417497 ATAD2Q6PL18 1390 aa18.76■□□□□ 0.59
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TTC28-AS1-202ENST00000417497 ABTB2Q8N961 1025 aa18.75■□□□□ 0.59
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TTC28-AS1-202ENST00000417497 SLIT2O94813 1529 aa18.74■□□□□ 0.59
TTC28-AS1-202ENST00000417497 ATRNO75882 1429 aa18.74■□□□□ 0.59
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TTC28-AS1-202ENST00000417497 SSH2Q76I76 1423 aa18.69■□□□□ 0.58
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TTC28-AS1-202ENST00000417497 PRDM11Q9NQV5 511 aa18.69■□□□□ 0.58
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TTC28-AS1-202ENST00000417497 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP18.69■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-202ENST00000417497 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP18.68■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-202ENST00000417497 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP18.68■□□□□ 0.58
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TTC28-AS1-202ENST00000417497 CHRNA2Q15822 529 aa18.68■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-202ENST00000417497 NLRP13Q86W25 1043 aa18.68■□□□□ 0.58
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TTC28-AS1-202ENST00000417497 BTG4Q9NY30 223 aa18.68■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-202ENST00000417497 USP19O94966 1318 aa18.68■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-202ENST00000417497 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa18.68■□□□□ 0.58
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TTC28-AS1-202ENST00000417497 NLRP6P59044 892 aa18.67■□□□□ 0.58
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TTC28-AS1-202ENST00000417497 NRKQ7Z2Y5 1582 aa18.66■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-202ENST00000417497 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP18.65■□□□□ 0.58
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TTC28-AS1-202ENST00000417497 PIK3C2AO00443 1686 aa18.65■□□□□ 0.58
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TTC28-AS1-202ENST00000417497 TMF1P82094 1093 aa18.64■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-202ENST00000417497 VPS72Q15906 364 aa18.64■□□□□ 0.57
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TTC28-AS1-202ENST00000417497 NWD2Q9ULI1 1742 aa18.63■□□□□ 0.57
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TTC28-AS1-202ENST00000417497 A0A1W2PP64 1363 aa18.63■□□□□ 0.57
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TTC28-AS1-202ENST00000417497 SLC24A1O60721 1099 aa18.62■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-202ENST00000417497 TERF2IPQ9NYB0 399 aa18.62■□□□□ 0.57
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TTC28-AS1-202ENST00000417497 TTC21AQ8NDW8 1320 aa18.62■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-202ENST00000417497 MON2Q7Z3U7 1717 aa18.61■□□□□ 0.57
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TTC28-AS1-202ENST00000417497 SLIT3O75094 1523 aa18.6■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-202ENST00000417497 NME9Q86XW9 330 aa18.6■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-202ENST00000417497 CPDO75976 1380 aa18.59■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-202ENST00000417497 STRN4Q9NRL3 753 aa18.59■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-202ENST00000417497 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-202ENST00000417497 NINLQ9Y2I6 1382 aa18.58■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-202ENST00000417497 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.56
TTC28-AS1-202ENST00000417497 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa18.57■□□□□ 0.56
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TTC28-AS1-202ENST00000417497 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa18.55■□□□□ 0.56
TTC28-AS1-202ENST00000417497 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP18.55■□□□□ 0.56
TTC28-AS1-202ENST00000417497 CDCA8Q53HL2 280 aa18.55■□□□□ 0.56
TTC28-AS1-202ENST00000417497 SEPT12Q8IYM1 358 aa18.55■□□□□ 0.56
TTC28-AS1-202ENST00000417497 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP18.55■□□□□ 0.56
TTC28-AS1-202ENST00000417497 LMO7Q8WWI1 1683 aa18.54■□□□□ 0.56
TTC28-AS1-202ENST00000417497 A0A0G2JS52 829 aa18.54■□□□□ 0.56
TTC28-AS1-202ENST00000417497 EVA1CP58658 441 aa18.54■□□□□ 0.56
TTC28-AS1-202ENST00000417497 MYT1Q01538 1121 aa18.54■□□□□ 0.56
TTC28-AS1-202ENST00000417497 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa18.54■□□□□ 0.56
TTC28-AS1-202ENST00000417497 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
TTC28-AS1-202ENST00000417497 KCNH5Q8NCM2 988 aa18.53■□□□□ 0.56
TTC28-AS1-202ENST00000417497 POLR3GLQ9BT43 218 aa18.53■□□□□ 0.56
TTC28-AS1-202ENST00000417497 NFAT5O94916 1531 aa18.53■□□□□ 0.56
TTC28-AS1-202ENST00000417497 USP31Q70CQ4 1352 aa18.53■□□□□ 0.56
TTC28-AS1-202ENST00000417497 ARHGEF25Q86VW2 580 aa18.52■□□□□ 0.56
TTC28-AS1-202ENST00000417497 USP35Q9P2H5 1018 aa18.52■□□□□ 0.56
TTC28-AS1-202ENST00000417497 AATKQ6ZMQ8 1374 aa18.52■□□□□ 0.55
TTC28-AS1-202ENST00000417497 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa18.51■□□□□ 0.55
TTC28-AS1-202ENST00000417497 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
TTC28-AS1-202ENST00000417497 AXIN2Q9Y2T1 843 aa18.51■□□□□ 0.55
TTC28-AS1-202ENST00000417497 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
TTC28-AS1-202ENST00000417497 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa18.49■□□□□ 0.55
TTC28-AS1-202ENST00000417497 OVOS2Q6IE36 1432 aa18.49■□□□□ 0.55
TTC28-AS1-202ENST00000417497 MYOM1P52179 1685 aa18.49■□□□□ 0.55
TTC28-AS1-202ENST00000417497 USP54Q70EL1 1684 aa18.48■□□□□ 0.55
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