RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000413409.6

PTPRC-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,338 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-206ENST00000413409 L3MBTL2Q969R5 705 aa24.06■■□□□ 1.44
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PTPRC-206ENST00000413409 APBA3O96018 575 aa24.04■■□□□ 1.44
PTPRC-206ENST00000413409 KNDC1Q76NI1 1749 aa24.01■■□□□ 1.43
PTPRC-206ENST00000413409 FAM196AQ6ZSG2 479 aa24■■□□□ 1.43
PTPRC-206ENST00000413409 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa24■■□□□ 1.43
PTPRC-206ENST00000413409 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
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PTPRC-206ENST00000413409 ADGRB2O60241 1585 aa23.99■■□□□ 1.43
PTPRC-206ENST00000413409 IFT172Q9UG01 1749 aa23.99■■□□□ 1.43
PTPRC-206ENST00000413409 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
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PTPRC-206ENST00000413409 SPON1Q9HCB6 807 aa23.97■■□□□ 1.43
PTPRC-206ENST00000413409 NUP188Q5SRE5 1749 aa23.96■■□□□ 1.43
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PTPRC-206ENST00000413409 NINLQ9Y2I6 1382 aa23.96■■□□□ 1.43
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PTPRC-206ENST00000413409 DCAF8L1A6NGE4 600 aa23.94■■□□□ 1.42
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PTPRC-206ENST00000413409 NBPF14Q5TI25 921 aa23.94■■□□□ 1.42
PTPRC-206ENST00000413409 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
PTPRC-206ENST00000413409 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
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PTPRC-206ENST00000413409 PIK3C2GO75747 1445 aa23.91■■□□□ 1.42
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PTPRC-206ENST00000413409 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP23.9■■□□□ 1.42
PTPRC-206ENST00000413409 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa23.9■■□□□ 1.42
PTPRC-206ENST00000413409 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP23.89■■□□□ 1.42
PTPRC-206ENST00000413409 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa23.88■■□□□ 1.41
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PTPRC-206ENST00000413409 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa23.87■■□□□ 1.41
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PTPRC-206ENST00000413409 PRAM1Q96QH2 718 aa23.86■■□□□ 1.41
PTPRC-206ENST00000413409 ANKARQ7Z5J8 1434 aa23.86■■□□□ 1.41
PTPRC-206ENST00000413409 CHRNA2Q15822 529 aa23.85■■□□□ 1.41
PTPRC-206ENST00000413409 STRN4Q9NRL3 753 aa23.85■■□□□ 1.41
PTPRC-206ENST00000413409 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
PTPRC-206ENST00000413409 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
PTPRC-206ENST00000413409 KIAA0232Q92628 1395 aa23.83■■□□□ 1.41
PTPRC-206ENST00000413409 PDE3BQ13370 1112 aa23.83■■□□□ 1.4
PTPRC-206ENST00000413409 USP35Q9P2H5 1018 aa23.83■■□□□ 1.4
PTPRC-206ENST00000413409 PRR36Q9H6K5 1346 aa23.82■■□□□ 1.4
PTPRC-206ENST00000413409 GPRASP1Q5JY77 1395 aa23.82■■□□□ 1.4
PTPRC-206ENST00000413409 C1QTNF8P60827 252 aa23.81■■□□□ 1.4
PTPRC-206ENST00000413409 CFAP70Q5T0N1 1121 aa23.81■■□□□ 1.4
PTPRC-206ENST00000413409 BARGINQ6ZT62 677 aa23.81■■□□□ 1.4
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PTPRC-206ENST00000413409 TCP11L2Q8N4U5 519 aa23.71■■□□□ 1.39
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PTPRC-206ENST00000413409 CHD4Q14839 1912 aa23.63■■□□□ 1.37
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PTPRC-206ENST00000413409 DCAF11Q8TEB1 546 aa23.62■■□□□ 1.37
PTPRC-206ENST00000413409 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
PTPRC-206ENST00000413409 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
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PTPRC-206ENST00000413409 SGIP1Q9BQI5 828 aa23.6■■□□□ 1.37
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