RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000410856.1

RNU2-38P-201, Transcript of RNA, U2 small nuclear 38, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU2-38P, Length 79 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU2-38P-201ENST00000410856 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
RNU2-38P-201ENST00000410856 FAM174AQ8TBP5 190 aa6.47□□□□□ -1.37
RNU2-38P-201ENST00000410856 BAP1Q92560 729 aa6.47□□□□□ -1.37
RNU2-38P-201ENST00000410856 SPDYE5A6NIY4 337 aa6.46□□□□□ -1.38
RNU2-38P-201ENST00000410856 DESI1Q6ICB0 168 aa6.46□□□□□ -1.38
RNU2-38P-201ENST00000410856 PCDHGC3Q9UN70 934 aa6.46□□□□□ -1.38
RNU2-38P-201ENST00000410856 SOBPA7XYQ1 873 aa6.44□□□□□ -1.38
RNU2-38P-201ENST00000410856 UPP2O95045 317 aa6.44□□□□□ -1.38
RNU2-38P-201ENST00000410856 MTMR2Q13614 643 aa6.44□□□□□ -1.38
RNU2-38P-201ENST00000410856 PRR7Q8TB68 274 aa6.44□□□□□ -1.38
RNU2-38P-201ENST00000410856 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
RNU2-38P-201ENST00000410856 PPFIA3O75145 1194 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU2-38P-201ENST00000410856 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
RNU2-38P-201ENST00000410856 NR5A1Q13285 461 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU2-38P-201ENST00000410856 C6orf118Q5T5N4 469 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU2-38P-201ENST00000410856 TMEM151AQ8N4L1 468 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU2-38P-201ENST00000410856 KCTD17Q8N5Z5 321 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU2-38P-201ENST00000410856 CDK15Q96Q40 435 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU2-38P-201ENST00000410856 CTHP32929 405 aa6.41□□□□□ -1.38
RNU2-38P-201ENST00000410856 LINC00528Q8N1L1 170 aa6.41□□□□□ -1.38
RNU2-38P-201ENST00000410856 SPIRE2Q8WWL2 714 aa6.41□□□□□ -1.38
RNU2-38P-201ENST00000410856 BMP2P12643 396 aa6.4□□□□□ -1.38
RNU2-38P-201ENST00000410856 ARID5BQ14865 1188 aa6.4□□□□□ -1.38
RNU2-38P-201ENST00000410856 ITPKCQ96DU7 683 aa6.4□□□□□ -1.38
RNU2-38P-201ENST00000410856 ZFAND3Q9H8U3 227 aa6.4□□□□□ -1.38
RNU2-38P-201ENST00000410856 MOXD2PA6NHM9 499 aa6.39□□□□□ -1.39
RNU2-38P-201ENST00000410856 GDF11O95390 407 aa6.39□□□□□ -1.39
RNU2-38P-201ENST00000410856 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
RNU2-38P-201ENST00000410856 GSK3AP49840 483 aa6.39□□□□□ -1.39
RNU2-38P-201ENST00000410856 PLCB2Q00722 1185 aa6.39□□□□□ -1.39
RNU2-38P-201ENST00000410856 MEIOBQ8N635 442 aa6.39□□□□□ -1.39
RNU2-38P-201ENST00000410856 SPTLC1O15269 473 aa6.38□□□□□ -1.39
RNU2-38P-201ENST00000410856 NDUFV2P19404 249 aa6.38□□□□□ -1.39
RNU2-38P-201ENST00000410856 RASSF7Q02833 373 aa6.38□□□□□ -1.39
RNU2-38P-201ENST00000410856 AGERQ15109 404 aa6.38□□□□□ -1.39
RNU2-38P-201ENST00000410856 NR3C2P08235 984 aa6.37□□□□□ -1.39
RNU2-38P-201ENST00000410856 GJA5P36382 358 aa6.37□□□□□ -1.39
RNU2-38P-201ENST00000410856 DIXDC1Q155Q3 683 aa6.37□□□□□ -1.39
RNU2-38P-201ENST00000410856 LYPD8Q6UX82 237 aa6.37□□□□□ -1.39
RNU2-38P-201ENST00000410856 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
RNU2-38P-201ENST00000410856 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
RNU2-38P-201ENST00000410856 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
RNU2-38P-201ENST00000410856 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP6.36□□□□□ -1.39
RNU2-38P-201ENST00000410856 FOXJ1Q92949 421 aa6.36□□□□□ -1.39
RNU2-38P-201ENST00000410856 DNMT3LQ9UJW3 386 aa6.36□□□□□ -1.39
RNU2-38P-201ENST00000410856 F12P00748 615 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
RNU2-38P-201ENST00000410856 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU2-38P-201ENST00000410856 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
RNU2-38P-201ENST00000410856 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU2-38P-201ENST00000410856 MAP10Q9P2G4 905 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU2-38P-201ENST00000410856 ADAMTS8Q9UP79 889 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU2-38P-201ENST00000410856 FSHRP23945 695 aa6.34□□□□□ -1.39
RNU2-38P-201ENST00000410856 ZBTB3Q9H5J0 574 aa6.34□□□□□ -1.39
RNU2-38P-201ENST00000410856 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
RNU2-38P-201ENST00000410856 IGHA1P01876 353 aa6.33□□□□□ -1.4
RNU2-38P-201ENST00000410856 GRM5P41594 1212 aa6.33□□□□□ -1.4
RNU2-38P-201ENST00000410856 KRT76Q01546 638 aa6.33□□□□□ -1.4
RNU2-38P-201ENST00000410856 SVOPQ8N4V2 548 aa6.33□□□□□ -1.4
RNU2-38P-201ENST00000410856 ARMC2Q8NEN0 867 aa6.33□□□□□ -1.4
RNU2-38P-201ENST00000410856 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa6.33□□□□□ -1.4
RNU2-38P-201ENST00000410856 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa6.33□□□□□ -1.4
RNU2-38P-201ENST00000410856 TTLL8A6PVC2 850 aa6.32□□□□□ -1.4
RNU2-38P-201ENST00000410856 FOXK2Q01167 660 aa6.32□□□□□ -1.4
RNU2-38P-201ENST00000410856 C4orf48Q5BLP8 95 aa6.32□□□□□ -1.4
RNU2-38P-201ENST00000410856 NBPF14Q5TI25 921 aa6.32□□□□□ -1.4
RNU2-38P-201ENST00000410856 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
RNU2-38P-201ENST00000410856 CFAP99D6REC4 459 aa6.31□□□□□ -1.4
RNU2-38P-201ENST00000410856 PTSQ03393 145 aa6.31□□□□□ -1.4
RNU2-38P-201ENST00000410856 AMHR2Q16671 573 aa6.31□□□□□ -1.4
RNU2-38P-201ENST00000410856 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
RNU2-38P-201ENST00000410856 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
RNU2-38P-201ENST00000410856 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
RNU2-38P-201ENST00000410856 CCDC116Q8IYX3 515 aa6.31□□□□□ -1.4
RNU2-38P-201ENST00000410856 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
RNU2-38P-201ENST00000410856 BEGAINQ9BUH8 593 aa6.31□□□□□ -1.4
RNU2-38P-201ENST00000410856 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa6.31□□□□□ -1.4
RNU2-38P-201ENST00000410856 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
RNU2-38P-201ENST00000410856 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
RNU2-38P-201ENST00000410856 KANK3Q6NY19 840 aa6.3□□□□□ -1.4
RNU2-38P-201ENST00000410856 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
RNU2-38P-201ENST00000410856 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
RNU2-38P-201ENST00000410856 TBC1D2Q9BYX2 928 aa6.3□□□□□ -1.4
RNU2-38P-201ENST00000410856 HRCP23327 699 aa6.29□□□□□ -1.4
RNU2-38P-201ENST00000410856 GPAT2Q6NUI2 795 aa6.29□□□□□ -1.4
RNU2-38P-201ENST00000410856 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa6.29□□□□□ -1.4
RNU2-38P-201ENST00000410856 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa6.29□□□□□ -1.4
RNU2-38P-201ENST00000410856 IRS1P35568 1242 aa6.28□□□□□ -1.4
RNU2-38P-201ENST00000410856 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
RNU2-38P-201ENST00000410856 CCDC155Q8N6L0 562 aa6.28□□□□□ -1.4
RNU2-38P-201ENST00000410856 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
RNU2-38P-201ENST00000410856 SLURP2P0DP57 97 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU2-38P-201ENST00000410856 MARSP56192 900 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
RNU2-38P-201ENST00000410856 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU2-38P-201ENST00000410856 SPINT1O43278 529 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU2-38P-201ENST00000410856 ITGA6P23229 1130 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU2-38P-201ENST00000410856 TSC1Q92574 1164 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU2-38P-201ENST00000410856 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP6.26□□□□□ -1.41
RNU2-38P-201ENST00000410856 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU2-38P-201ENST00000410856 CDC14CA4D256 554 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU2-38P-201ENST00000410856 SLC35F4A4IF30 521 aa6.25□□□□□ -1.41
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