RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399892.6

SEH1L-202, Transcript of SEH1 like nucleoporin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SEH1L, Length 1,846 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEH1L-202ENST00000399892 MON2Q7Z3U7 1717 aa24.49■■□□□ 1.51
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SEH1L-202ENST00000399892 ARHGEF10O15013 1369 aa24.49■■□□□ 1.51
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SEH1L-202ENST00000399892 CCDC7Q96M83 1385 aa24.47■■□□□ 1.51
SEH1L-202ENST00000399892 PLEKHG5O94827 1062 aa24.47■■□□□ 1.51
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SEH1L-202ENST00000399892 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
SEH1L-202ENST00000399892 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa24.42■■□□□ 1.5
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SEH1L-202ENST00000399892 PANK3Q9H999 370 aa24.4■■□□□ 1.5
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SEH1L-202ENST00000399892 PIK3C2AO00443 1686 aa24.37■■□□□ 1.49
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SEH1L-202ENST00000399892 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
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SEH1L-202ENST00000399892 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
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SEH1L-202ENST00000399892 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
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SEH1L-202ENST00000399892 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa24.29■■□□□ 1.48
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SEH1L-202ENST00000399892 SOX12O15370 315 aa24.28■■□□□ 1.48
SEH1L-202ENST00000399892 GGNBP2Q9H3C7 697 aa24.28■■□□□ 1.48
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SEH1L-202ENST00000399892 KCNH5Q8NCM2 988 aa24.26■■□□□ 1.47
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SEH1L-202ENST00000399892 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa24.23■■□□□ 1.47
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SEH1L-202ENST00000399892 PRDM11Q9NQV5 511 aa24.22■■□□□ 1.47
SEH1L-202ENST00000399892 NSD2O96028 1365 aa24.2■■□□□ 1.46
SEH1L-202ENST00000399892 KIAA0232Q92628 1395 aa24.2■■□□□ 1.46
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SEH1L-202ENST00000399892 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
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SEH1L-202ENST00000399892 FAM83GA6ND36 823 aa24.17■■□□□ 1.46
SEH1L-202ENST00000399892 CHRNA2Q15822 529 aa24.17■■□□□ 1.46
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SEH1L-202ENST00000399892 LTN1O94822 1766 aa24.15■■□□□ 1.46
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SEH1L-202ENST00000399892 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
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SEH1L-202ENST00000399892 MAP3K19Q56UN5 1328 aa24.07■■□□□ 1.44
SEH1L-202ENST00000399892 UNC5CLQ8IV45 518 aa24.07■■□□□ 1.44
SEH1L-202ENST00000399892 RGPD5Q99666 1765 aa24.06■■□□□ 1.44
SEH1L-202ENST00000399892 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
SEH1L-202ENST00000399892 STRN4Q9NRL3 753 aa24.06■■□□□ 1.44
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