RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384154.1

RNU6-190P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 190, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-190P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-190P-201ENST00000384154 LIMD1Q9UGP4 676 aa6.44□□□□□ -1.38
RNU6-190P-201ENST00000384154 JUNDP17535 347 aa6.43□□□□□ -1.38
RNU6-190P-201ENST00000384154 MPNDQ8N594 471 aa6.43□□□□□ -1.38
RNU6-190P-201ENST00000384154 POLR3EQ9NVU0 708 aa6.43□□□□□ -1.38
RNU6-190P-201ENST00000384154 MOXD2PA6NHM9 499 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-190P-201ENST00000384154 H3BM21 787 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-190P-201ENST00000384154 TRIM46Q7Z4K8 759 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-190P-201ENST00000384154 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
RNU6-190P-201ENST00000384154 SLC16A10Q8TF71 515 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-190P-201ENST00000384154 HLA-CQ95604 372 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-190P-201ENST00000384154 FAM181BA6NEQ2 426 aa6.41□□□□□ -1.38
RNU6-190P-201ENST00000384154 FLIIQ13045 1269 aa6.41□□□□□ -1.38
RNU6-190P-201ENST00000384154 MCM6Q14566 821 aa6.41□□□□□ -1.38
RNU6-190P-201ENST00000384154 PPP2R2DQ66LE6 453 aa6.41□□□□□ -1.38
RNU6-190P-201ENST00000384154 RIC3Q7Z5B4 369 aa6.41□□□□□ -1.38
RNU6-190P-201ENST00000384154 RETREG3Q86VR2 466 aa6.41□□□□□ -1.38
RNU6-190P-201ENST00000384154 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.4□□□□□ -1.38
RNU6-190P-201ENST00000384154 ALDH1A1P00352 501 aa6.4□□□□□ -1.38
RNU6-190P-201ENST00000384154 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
RNU6-190P-201ENST00000384154 IRF7Q92985 503 aa6.4□□□□□ -1.38
RNU6-190P-201ENST00000384154 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6.4□□□□□ -1.38
RNU6-190P-201ENST00000384154 GMPRP36959 345 aa6.39□□□□□ -1.39
RNU6-190P-201ENST00000384154 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
RNU6-190P-201ENST00000384154 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
RNU6-190P-201ENST00000384154 CCDC24Q8N4L8 307 aa6.39□□□□□ -1.39
RNU6-190P-201ENST00000384154 LILRB3O75022 631 aa6.38□□□□□ -1.39
RNU6-190P-201ENST00000384154 VSIG8P0DPA2 414 aa6.38□□□□□ -1.39
RNU6-190P-201ENST00000384154 FDX1P10109 184 aa6.38□□□□□ -1.39
RNU6-190P-201ENST00000384154 NDUFV2P19404 249 aa6.38□□□□□ -1.39
RNU6-190P-201ENST00000384154 RFC5P40937 340 aa6.38□□□□□ -1.39
RNU6-190P-201ENST00000384154 QPCTQ16769 361 aa6.38□□□□□ -1.39
RNU6-190P-201ENST00000384154 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa6.38□□□□□ -1.39
RNU6-190P-201ENST00000384154 NUDT12Q9BQG2 462 aa6.38□□□□□ -1.39
RNU6-190P-201ENST00000384154 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
RNU6-190P-201ENST00000384154 SH3BP2P78314 561 aa6.37□□□□□ -1.39
RNU6-190P-201ENST00000384154 EHBP1Q8NDI1 1231 aa6.37□□□□□ -1.39
RNU6-190P-201ENST00000384154 ERBB4Q15303 1308 aa6.36□□□□□ -1.39
RNU6-190P-201ENST00000384154 SOCS7O14512 581 aa6.36□□□□□ -1.39
RNU6-190P-201ENST00000384154 BMP1P13497 986 aa6.36□□□□□ -1.39
RNU6-190P-201ENST00000384154 GUCA2AQ02747 115 aa6.36□□□□□ -1.39
RNU6-190P-201ENST00000384154 PTPRNQ16849 979 aa6.36□□□□□ -1.39
RNU6-190P-201ENST00000384154 DESI1Q6ICB0 168 aa6.36□□□□□ -1.39
RNU6-190P-201ENST00000384154 BANK1Q8NDB2 785 aa6.36□□□□□ -1.39
RNU6-190P-201ENST00000384154 ZBTB3Q9H5J0 574 aa6.36□□□□□ -1.39
RNU6-190P-201ENST00000384154 EVA1BQ9NVM1 165 aa6.36□□□□□ -1.39
RNU6-190P-201ENST00000384154 PCDHGC3Q9UN70 934 aa6.36□□□□□ -1.39
RNU6-190P-201ENST00000384154 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa6.36□□□□□ -1.39
RNU6-190P-201ENST00000384154 SPDYE5A6NIY4 337 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU6-190P-201ENST00000384154 CCNYL3P0C7X3 344 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU6-190P-201ENST00000384154 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU6-190P-201ENST00000384154 CABLES1Q8TDN4 633 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU6-190P-201ENST00000384154 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
RNU6-190P-201ENST00000384154 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
RNU6-190P-201ENST00000384154 TMEM259Q4ZIN3 620 aa6.34□□□□□ -1.39
RNU6-190P-201ENST00000384154 WASF2Q9Y6W5 498 aa6.34□□□□□ -1.39
RNU6-190P-201ENST00000384154 HRCP23327 699 aa6.33□□□□□ -1.4
RNU6-190P-201ENST00000384154 VARSP26640 1264 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
RNU6-190P-201ENST00000384154 MTMR2Q13614 643 aa6.33□□□□□ -1.4
RNU6-190P-201ENST00000384154 ZFP42Q96MM3 310 aa6.33□□□□□ -1.4
RNU6-190P-201ENST00000384154 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
RNU6-190P-201ENST00000384154 USP17L8P0C7I0 530 aa6.32□□□□□ -1.4
RNU6-190P-201ENST00000384154 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
RNU6-190P-201ENST00000384154 MTMR14Q8NCE2 650 aa6.32□□□□□ -1.4
RNU6-190P-201ENST00000384154 UNC93B1Q9H1C4 597 aa6.32□□□□□ -1.4
RNU6-190P-201ENST00000384154 UBTFP17480 764 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
RNU6-190P-201ENST00000384154 KCNH2Q12809 1159 aa6.31□□□□□ -1.4
RNU6-190P-201ENST00000384154 CDK15Q96Q40 435 aa6.31□□□□□ -1.4
RNU6-190P-201ENST00000384154 A6NJR5 290 aa6.3□□□□□ -1.4
RNU6-190P-201ENST00000384154 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
RNU6-190P-201ENST00000384154 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
RNU6-190P-201ENST00000384154 CFAP99D6REC4 459 aa6.3□□□□□ -1.4
RNU6-190P-201ENST00000384154 C6orf229H3BNL8 230 aa6.3□□□□□ -1.4
RNU6-190P-201ENST00000384154 TIMP2P16035 220 aa6.3□□□□□ -1.4
RNU6-190P-201ENST00000384154 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
RNU6-190P-201ENST00000384154 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
RNU6-190P-201ENST00000384154 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
RNU6-190P-201ENST00000384154 ZNF511Q8NB15 262 aa6.3□□□□□ -1.4
RNU6-190P-201ENST00000384154 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
RNU6-190P-201ENST00000384154 ZMYND15Q9H091 742 aa6.3□□□□□ -1.4
RNU6-190P-201ENST00000384154 SNRKQ9NRH2 765 aa6.3□□□□□ -1.4
RNU6-190P-201ENST00000384154 APBB1O00213 710 aa6.29□□□□□ -1.4
RNU6-190P-201ENST00000384154 AP1G2O75843 785 aa6.29□□□□□ -1.4
RNU6-190P-201ENST00000384154 ADH1CP00326 375 aa6.29□□□□□ -1.4
RNU6-190P-201ENST00000384154 BAP1Q92560 729 aa6.29□□□□□ -1.4
RNU6-190P-201ENST00000384154 GSK3AP49840 483 aa6.28□□□□□ -1.4
RNU6-190P-201ENST00000384154 NNTQ13423 1086 aa6.28□□□□□ -1.4
RNU6-190P-201ENST00000384154 TLL2Q9Y6L7 1015 aa6.28□□□□□ -1.4
RNU6-190P-201ENST00000384154 VEGFBP49765 207 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-190P-201ENST00000384154 KCNMA1Q12791 1236 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-190P-201ENST00000384154 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
RNU6-190P-201ENST00000384154 PRR7Q8TB68 274 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-190P-201ENST00000384154 CLUAP1Q96AJ1 413 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-190P-201ENST00000384154 POM121Q96HA1 1249 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-190P-201ENST00000384154 COG6Q9Y2V7 657 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-190P-201ENST00000384154 SCARF1Q14162 830 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-190P-201ENST00000384154 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
RNU6-190P-201ENST00000384154 GPR37L1O60883 481 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-190P-201ENST00000384154 LYPD8Q6UX82 237 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-190P-201ENST00000384154 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
RNU6-190P-201ENST00000384154 RAD21O60216 631 aa6.24□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.9 ms