RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384109.1

RNU6-1029P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1029, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1029P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1029P-201ENST00000384109 FKBPLQ9UIM3 349 aa6.74□□□□□ -1.33
RNU6-1029P-201ENST00000384109 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
RNU6-1029P-201ENST00000384109 FLIIQ13045 1269 aa6.73□□□□□ -1.33
RNU6-1029P-201ENST00000384109 LINC01559Q495D7 138 aa6.73□□□□□ -1.33
RNU6-1029P-201ENST00000384109 ZNF511Q8NB15 262 aa6.73□□□□□ -1.33
RNU6-1029P-201ENST00000384109 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
RNU6-1029P-201ENST00000384109 TRIM34Q9BYJ4 488 aa6.73□□□□□ -1.33
RNU6-1029P-201ENST00000384109 SH3BP2P78314 561 aa6.72□□□□□ -1.33
RNU6-1029P-201ENST00000384109 SKOR1P84550 965 aa6.72□□□□□ -1.33
RNU6-1029P-201ENST00000384109 MCM6Q14566 821 aa6.72□□□□□ -1.33
RNU6-1029P-201ENST00000384109 EPS8L1Q8TE68 723 aa6.72□□□□□ -1.33
RNU6-1029P-201ENST00000384109 PRM3Q9NNZ6 103 aa6.72□□□□□ -1.33
RNU6-1029P-201ENST00000384109 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa6.72□□□□□ -1.33
RNU6-1029P-201ENST00000384109 WNT7AO00755 349 aa6.71□□□□□ -1.34
RNU6-1029P-201ENST00000384109 PDXDC2PQ6P474 469 aa6.7□□□□□ -1.34
RNU6-1029P-201ENST00000384109 GDF9O60383 454 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-1029P-201ENST00000384109 PRR20EP86478 221 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-1029P-201ENST00000384109 PRR20CP86479 221 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-1029P-201ENST00000384109 PRR20DP86480 221 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-1029P-201ENST00000384109 PRR20BP86481 221 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-1029P-201ENST00000384109 PRR20AP86496 221 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-1029P-201ENST00000384109 FOXC1Q12948 553 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-1029P-201ENST00000384109 AGERQ15109 404 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-1029P-201ENST00000384109 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
RNU6-1029P-201ENST00000384109 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
RNU6-1029P-201ENST00000384109 EHBP1Q8NDI1 1231 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-1029P-201ENST00000384109 PKD2L1Q9P0L9 805 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-1029P-201ENST00000384109 GPSM3Q9Y4H4 160 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-1029P-201ENST00000384109 VARSP26640 1264 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
RNU6-1029P-201ENST00000384109 PTK2Q05397 1052 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-1029P-201ENST00000384109 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-1029P-201ENST00000384109 FOXJ1Q92949 421 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-1029P-201ENST00000384109 TNFRSF10AO00220 468 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-1029P-201ENST00000384109 TRIM67Q6ZTA4 783 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-1029P-201ENST00000384109 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-1029P-201ENST00000384109 MRGPRX2Q96LB1 330 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-1029P-201ENST00000384109 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-1029P-201ENST00000384109 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-1029P-201ENST00000384109 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-1029P-201ENST00000384109 UBTFP17480 764 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
RNU6-1029P-201ENST00000384109 LAPTM4AQ15012 233 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-1029P-201ENST00000384109 FAM174AQ8TBP5 190 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-1029P-201ENST00000384109 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
RNU6-1029P-201ENST00000384109 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-1029P-201ENST00000384109 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-1029P-201ENST00000384109 RAD21O60216 631 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-1029P-201ENST00000384109 C4orf48Q5BLP8 95 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-1029P-201ENST00000384109 ZBTB33Q86T24 672 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-1029P-201ENST00000384109 CYP4X1Q8N118 509 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-1029P-201ENST00000384109 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
RNU6-1029P-201ENST00000384109 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-1029P-201ENST00000384109 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
RNU6-1029P-201ENST00000384109 ZBBXA8MT70 800 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-1029P-201ENST00000384109 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
RNU6-1029P-201ENST00000384109 GFRA3O60609 400 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-1029P-201ENST00000384109 GPR37L1O60883 481 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-1029P-201ENST00000384109 CARD14Q9BXL6 1004 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-1029P-201ENST00000384109 GDPD2Q9HCC8 539 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-1029P-201ENST00000384109 TOR4AQ9NXH8 423 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-1029P-201ENST00000384109 COG6Q9Y2V7 657 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-1029P-201ENST00000384109 SIAH2O43255 324 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-1029P-201ENST00000384109 ABL2P42684 1182 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-1029P-201ENST00000384109 ERFEQ4G0M1 354 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-1029P-201ENST00000384109 WWC1Q8IX03 1113 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-1029P-201ENST00000384109 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
RNU6-1029P-201ENST00000384109 MPNDQ8N594 471 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-1029P-201ENST00000384109 OCSTAMPQ9BR26 566 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-1029P-201ENST00000384109 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
RNU6-1029P-201ENST00000384109 NR1H3Q13133 447 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-1029P-201ENST00000384109 ADAM32Q8TC27 787 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-1029P-201ENST00000384109 SLC10A4Q96EP9 437 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-1029P-201ENST00000384109 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
RNU6-1029P-201ENST00000384109 TLL2Q9Y6L7 1015 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-1029P-201ENST00000384109 ALDH1A1P00352 501 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1029P-201ENST00000384109 FBXO45P0C2W1 286 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1029P-201ENST00000384109 WASHC4Q2M389 1173 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1029P-201ENST00000384109 ZNF592Q92610 1267 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1029P-201ENST00000384109 POM121Q96HA1 1249 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1029P-201ENST00000384109 CDK15Q96Q40 435 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1029P-201ENST00000384109 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-1029P-201ENST00000384109 IRF5Q13568 498 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-1029P-201ENST00000384109 WASF2Q9Y6W5 498 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-1029P-201ENST00000384109 FAM187AA6NFU0 413 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1029P-201ENST00000384109 ADH1CP00326 375 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1029P-201ENST00000384109 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1029P-201ENST00000384109 ARID5BQ14865 1188 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1029P-201ENST00000384109 PKDCCQ504Y2 493 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1029P-201ENST00000384109 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1029P-201ENST00000384109 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1029P-201ENST00000384109 J3QL48 77 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-1029P-201ENST00000384109 DGAT1O75907 488 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-1029P-201ENST00000384109 SMPD1P17405 629 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-1029P-201ENST00000384109 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP6.58□□□□□ -1.36
RNU6-1029P-201ENST00000384109 NBPF20Q3BBV1 942 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-1029P-201ENST00000384109 CLUAP1Q96AJ1 413 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-1029P-201ENST00000384109 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-1029P-201ENST00000384109 VAC14Q08AM6 782 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-1029P-201ENST00000384109 NR5A1Q13285 461 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-1029P-201ENST00000384109 A6NJR5 290 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-1029P-201ENST00000384109 FSHRP23945 695 aa6.56□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms