RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361368.6

SMURF1-202, Transcript of SMAD specific E3 ubiquitin protein ligase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMURF1, Length 5,581 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF1-202ENST00000361368 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
SMURF1-202ENST00000361368 STRN4Q9NRL3 753 aa24.29■■□□□ 1.48
SMURF1-202ENST00000361368 CCDC7Q96M83 1385 aa24.28■■□□□ 1.48
SMURF1-202ENST00000361368 KRT18P05783 430 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
SMURF1-202ENST00000361368 SYCP1Q15431 976 aa24.28■■□□□ 1.48
SMURF1-202ENST00000361368 TMEM132EQ6IEE7 984 aa24.28■■□□□ 1.48
SMURF1-202ENST00000361368 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
SMURF1-202ENST00000361368 PAF1Q8N7H5 531 aa24.28■■□□□ 1.48
SMURF1-202ENST00000361368 PDILTQ8N807 584 aa24.28■■□□□ 1.48
SMURF1-202ENST00000361368 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
SMURF1-202ENST00000361368 NACAP1Q9BZK3 213 aa24.28■■□□□ 1.48
SMURF1-202ENST00000361368 MTHFSP49914 203 aa24.28■■□□□ 1.48
SMURF1-202ENST00000361368 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.28■■□□□ 1.48
SMURF1-202ENST00000361368 SMARCE1Q969G3 411 aa24.28■■□□□ 1.48
SMURF1-202ENST00000361368 SCAPERQ9BY12 1400 aa24.27■■□□□ 1.48
SMURF1-202ENST00000361368 CAGE1Q8TC20 777 aa24.27■■□□□ 1.48
SMURF1-202ENST00000361368 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
SMURF1-202ENST00000361368 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
SMURF1-202ENST00000361368 KINO60870 393 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
SMURF1-202ENST00000361368 SPG7Q9UQ90 795 aa24.26■■□□□ 1.47
SMURF1-202ENST00000361368 CABP4P57796 275 aa24.26■■□□□ 1.47
SMURF1-202ENST00000361368 CNTLNQ9NXG0 1405 aa24.26■■□□□ 1.47
SMURF1-202ENST00000361368 GNAI2P04899 355 aa24.25■■□□□ 1.47
SMURF1-202ENST00000361368 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
SMURF1-202ENST00000361368 ARHGAP5Q13017 1502 aa24.25■■□□□ 1.47
SMURF1-202ENST00000361368 JMYQ8N9B5 988 aa24.24■■□□□ 1.47
SMURF1-202ENST00000361368 DCTN1Q14203 1278 aa24.24■■□□□ 1.47
SMURF1-202ENST00000361368 PANK1Q8TE04 598 aa24.24■■□□□ 1.47
SMURF1-202ENST00000361368 CCP110O43303 1012 aa24.24■■□□□ 1.47
SMURF1-202ENST00000361368 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa24.24■■□□□ 1.47
SMURF1-202ENST00000361368 PRKAR2BP31323 418 aa24.23■■□□□ 1.47
SMURF1-202ENST00000361368 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.23■■□□□ 1.47
SMURF1-202ENST00000361368 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
SMURF1-202ENST00000361368 TCP11L2Q8N4U5 519 aa24.23■■□□□ 1.47
SMURF1-202ENST00000361368 GCC1Q96CN9 775 aa24.22■■□□□ 1.47
SMURF1-202ENST00000361368 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa24.22■■□□□ 1.47
SMURF1-202ENST00000361368 SMARCA4P51532 1647 aa24.22■■□□□ 1.47
SMURF1-202ENST00000361368 MBD3O95983 291 aa24.21■■□□□ 1.47
SMURF1-202ENST00000361368 CCDC39Q9UFE4 941 aa24.21■■□□□ 1.47
SMURF1-202ENST00000361368 TRIM22Q8IYM9 498 aa24.21■■□□□ 1.47
SMURF1-202ENST00000361368 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
SMURF1-202ENST00000361368 CCT4P50991 539 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
SMURF1-202ENST00000361368 ATP2B1P20020 1258 aa24.2■■□□□ 1.47
SMURF1-202ENST00000361368 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa24.2■■□□□ 1.46
SMURF1-202ENST00000361368 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
SMURF1-202ENST00000361368 STK38Q15208 465 aa24.19■■□□□ 1.46
SMURF1-202ENST00000361368 ANKRD1Q15327 319 aa24.19■■□□□ 1.46
SMURF1-202ENST00000361368 IGF1RP08069 1367 aa24.19■■□□□ 1.46
SMURF1-202ENST00000361368 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
SMURF1-202ENST00000361368 ATP2B2Q01814 1243 aa24.18■■□□□ 1.46
SMURF1-202ENST00000361368 SOGA3Q5TF21 947 aa24.18■■□□□ 1.46
SMURF1-202ENST00000361368 PRAM1Q96QH2 718 aa24.18■■□□□ 1.46
SMURF1-202ENST00000361368 PRDM2Q13029 1718 aa24.17■■□□□ 1.46
SMURF1-202ENST00000361368 RABEP1Q15276 862 aa24.17■■□□□ 1.46
SMURF1-202ENST00000361368 MPHOSPH8Q99549 860 aa24.17■■□□□ 1.46
SMURF1-202ENST00000361368 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
SMURF1-202ENST00000361368 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
SMURF1-202ENST00000361368 CFAP70Q5T0N1 1121 aa24.16■■□□□ 1.46
SMURF1-202ENST00000361368 STIM1Q13586 685 aa24.16■■□□□ 1.46
SMURF1-202ENST00000361368 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
SMURF1-202ENST00000361368 SYNJ2O15056 1496 aa24.16■■□□□ 1.46
SMURF1-202ENST00000361368 KDM4AO75164 1064 aa24.16■■□□□ 1.46
SMURF1-202ENST00000361368 TXLNBQ8N3L3 684 aa24.16■■□□□ 1.46
SMURF1-202ENST00000361368 ADAMTS8Q9UP79 889 aa24.16■■□□□ 1.46
SMURF1-202ENST00000361368 DACH1Q9UI36 760 aa24.16■■□□□ 1.46
SMURF1-202ENST00000361368 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
SMURF1-202ENST00000361368 FANCIQ9NVI1 1328 aa24.15■■□□□ 1.46
SMURF1-202ENST00000361368 NEK4P51957 841 aa24.15■■□□□ 1.46
SMURF1-202ENST00000361368 FAM43AQ8N2R8 423 aa24.15■■□□□ 1.46
SMURF1-202ENST00000361368 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa24.15■■□□□ 1.46
SMURF1-202ENST00000361368 PDCL3Q9H2J4 239 aa24.15■■□□□ 1.46
SMURF1-202ENST00000361368 TRIM5Q9C035 493 aa24.15■■□□□ 1.46
SMURF1-202ENST00000361368 HFM1A2PYH4 1435 aa24.14■■□□□ 1.46
SMURF1-202ENST00000361368 SMC2O95347 1197 aa24.14■■□□□ 1.46
SMURF1-202ENST00000361368 CCDC57Q2TAC2 916 aa24.14■■□□□ 1.46
SMURF1-202ENST00000361368 CCDC69A6NI79 296 aa24.14■■□□□ 1.46
SMURF1-202ENST00000361368 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
SMURF1-202ENST00000361368 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
SMURF1-202ENST00000361368 SLC4A2P04920 1241 aa24.13■■□□□ 1.45
SMURF1-202ENST00000361368 AFAP1Q8N556 730 aa24.13■■□□□ 1.45
SMURF1-202ENST00000361368 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa24.13■■□□□ 1.45
SMURF1-202ENST00000361368 ANKLE2Q86XL3 938 aa24.13■■□□□ 1.45
SMURF1-202ENST00000361368 AEBP1Q8IUX7 1158 aa24.13■■□□□ 1.45
SMURF1-202ENST00000361368 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
SMURF1-202ENST00000361368 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
SMURF1-202ENST00000361368 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
SMURF1-202ENST00000361368 SLC52A1Q9NWF4 448 aa24.13■■□□□ 1.45
SMURF1-202ENST00000361368 PPP2R1AP30153 589 aa24.12■■□□□ 1.45
SMURF1-202ENST00000361368 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
SMURF1-202ENST00000361368 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa24.12■■□□□ 1.45
SMURF1-202ENST00000361368 ERLIN2O94905 339 aa24.12■■□□□ 1.45
SMURF1-202ENST00000361368 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP24.12■■□□□ 1.45
SMURF1-202ENST00000361368 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
SMURF1-202ENST00000361368 MRE11P49959 708 aa24.11■■□□□ 1.45
SMURF1-202ENST00000361368 LRRCC1Q9C099 1032 aa24.11■■□□□ 1.45
SMURF1-202ENST00000361368 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
SMURF1-202ENST00000361368 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.1■■□□□ 1.45
SMURF1-202ENST00000361368 SULT6B1Q6IMI4 303 aa24.1■■□□□ 1.45
SMURF1-202ENST00000361368 CDK19Q9BWU1 502 aa24.1■■□□□ 1.45
SMURF1-202ENST00000361368 POGZQ7Z3K3 1410 aa24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.7 ms