RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345807.6

CLTB-202, Transcript of clathrin light chain B, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLTB, Length 1,161 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTB-202ENST00000345807 BRWD3Q6RI45 1802 aa32.83■■■□□ 2.85
CLTB-202ENST00000345807 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP32.83■■■□□ 2.85
CLTB-202ENST00000345807 NRAPQ86VF7 1730 aa32.82■■■□□ 2.85
CLTB-202ENST00000345807 BTG4Q9NY30 223 aa32.82■■■□□ 2.84
CLTB-202ENST00000345807 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa32.82■■■□□ 2.84
CLTB-202ENST00000345807 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP32.8■■■□□ 2.84
CLTB-202ENST00000345807 CCDC61Q9Y6R9 512 aa32.8■■■□□ 2.84
CLTB-202ENST00000345807 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP32.79■■■□□ 2.84
CLTB-202ENST00000345807 L3MBTL2Q969R5 705 aa32.78■■■□□ 2.84
CLTB-202ENST00000345807 ACEP12821 1306 aa32.77■■■□□ 2.84
CLTB-202ENST00000345807 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP32.77■■■□□ 2.84
CLTB-202ENST00000345807 PLEKHG3A1L390 1219 aa32.75■■■□□ 2.83
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CLTB-202ENST00000345807 PRDM11Q9NQV5 511 aa32.74■■■□□ 2.83
CLTB-202ENST00000345807 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP32.74■■■□□ 2.83
CLTB-202ENST00000345807 SIN3AQ96ST3 1273 aa32.73■■■□□ 2.83
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CLTB-202ENST00000345807 KRT27Q7Z3Y8 459 aa32.72■■■□□ 2.83
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CLTB-202ENST00000345807 ZRANB1Q9UGI0 708 aa32.68■■■□□ 2.82
CLTB-202ENST00000345807 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa32.68■■■□□ 2.82
CLTB-202ENST00000345807 NEUROD1Q13562 356 aa32.67■■■□□ 2.82
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CLTB-202ENST00000345807 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa32.67■■■□□ 2.82
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CLTB-202ENST00000345807 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa32.57■■■□□ 2.8
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CLTB-202ENST00000345807 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa32.56■■■□□ 2.8
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CLTB-202ENST00000345807 USP6P35125 1406 aa32.51■■■□□ 2.8
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CLTB-202ENST00000345807 TCP11L2Q8N4U5 519 aa32.39■■■□□ 2.78
CLTB-202ENST00000345807 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP32.38■■■□□ 2.77
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CLTB-202ENST00000345807 CARD11Q9BXL7 1154 aa32.35■■■□□ 2.77
CLTB-202ENST00000345807 AATKQ6ZMQ8 1374 aa32.34■■■□□ 2.77
CLTB-202ENST00000345807 TONSLQ96HA7 1378 aa32.34■■■□□ 2.77
CLTB-202ENST00000345807 PDE3BQ13370 1112 aa32.34■■■□□ 2.77
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CLTB-202ENST00000345807 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa32.32■■■□□ 2.77
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CLTB-202ENST00000345807 CRB1P82279 1406 aa32.31■■■□□ 2.76
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CLTB-202ENST00000345807 SOX12O15370 315 aa32.23■■■□□ 2.75
CLTB-202ENST00000345807 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa32.23■■■□□ 2.75
CLTB-202ENST00000345807 AXIN2Q9Y2T1 843 aa32.23■■■□□ 2.75
CLTB-202ENST00000345807 APBA3O96018 575 aa32.22■■■□□ 2.75
CLTB-202ENST00000345807 CAMKK2Q96RR4 588 aa32.22■■■□□ 2.75
CLTB-202ENST00000345807 WDR17Q8IZU2 1322 aa32.2■■■□□ 2.74
CLTB-202ENST00000345807 LRP5O75197 1615 aa32.18■■■□□ 2.74
CLTB-202ENST00000345807 CD163L1Q9NR16 1453 aa32.18■■■□□ 2.74
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