RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000339950.4

USP1-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP1, Length 3,996 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP1-201ENST00000339950 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
USP1-201ENST00000339950 RNF214Q8ND24 703 aa14.82□□□□□ -0.04
USP1-201ENST00000339950 CASC1Q6TDU7 716 aa14.81□□□□□ -0.04
USP1-201ENST00000339950 SLC4A2P04920 1241 aa14.81□□□□□ -0.04
USP1-201ENST00000339950 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
USP1-201ENST00000339950 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
USP1-201ENST00000339950 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa14.81□□□□□ -0.04
USP1-201ENST00000339950 GBP4Q96PP9 640 aa14.8□□□□□ -0.04
USP1-201ENST00000339950 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
USP1-201ENST00000339950 CHMP3Q9Y3E7 222 aa14.8□□□□□ -0.04
USP1-201ENST00000339950 C8orf58Q8NAV2 365 aa14.8□□□□□ -0.04
USP1-201ENST00000339950 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP14.8□□□□□ -0.04
USP1-201ENST00000339950 KIF16BQ96L93 1317 aa14.8□□□□□ -0.04
USP1-201ENST00000339950 CHAMP1Q96JM3 812 aa14.8□□□□□ -0.04
USP1-201ENST00000339950 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa14.8□□□□□ -0.04
USP1-201ENST00000339950 SHANK2Q9UPX8 1470 aa14.79□□□□□ -0.04
USP1-201ENST00000339950 ZNF521Q96K83 1311 aa14.79□□□□□ -0.04
USP1-201ENST00000339950 TBC1D32Q96NH3 1257 aa14.79□□□□□ -0.04
USP1-201ENST00000339950 RSPH6AQ9H0K4 717 aa14.79□□□□□ -0.04
USP1-201ENST00000339950 WDR7Q9Y4E6 1490 aa14.79□□□□□ -0.04
USP1-201ENST00000339950 TSPYL4Q9UJ04 414 aa14.79□□□□□ -0.04
USP1-201ENST00000339950 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa14.78□□□□□ -0.04
USP1-201ENST00000339950 TRHP20396 242 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
USP1-201ENST00000339950 USHBP1Q8N6Y0 703 aa14.78□□□□□ -0.04
USP1-201ENST00000339950 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
USP1-201ENST00000339950 ANO2Q9NQ90 1003 aa14.78□□□□□ -0.04
USP1-201ENST00000339950 KCNJ4P48050 445 aa14.78□□□□□ -0.04
USP1-201ENST00000339950 GNAI1P63096 354 aa14.78□□□□□ -0.04
USP1-201ENST00000339950 STK31Q9BXU1 1019 aa14.78□□□□□ -0.04
USP1-201ENST00000339950 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa14.78□□□□□ -0.04
USP1-201ENST00000339950 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
USP1-201ENST00000339950 TRIM35Q9UPQ4 493 aa14.78□□□□□ -0.04
USP1-201ENST00000339950 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.04
USP1-201ENST00000339950 STAC3Q96MF2 364 aa14.77□□□□□ -0.04
USP1-201ENST00000339950 FOXO3O43524 673 aa14.77□□□□□ -0.04
USP1-201ENST00000339950 MBIPQ9NS73 344 aa14.77□□□□□ -0.04
USP1-201ENST00000339950 CD109Q6YHK3 1445 aa14.77□□□□□ -0.05
USP1-201ENST00000339950 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP14.77□□□□□ -0.051e-5■■■■□ 25.8
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USP1-201ENST00000339950 ADGBQ8N7X0 1667 aa14.76□□□□□ -0.05
USP1-201ENST00000339950 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
USP1-201ENST00000339950 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
USP1-201ENST00000339950 TTC37Q6PGP7 1564 aa14.76□□□□□ -0.05
USP1-201ENST00000339950 KDM5DQ9BY66 1539 aa14.75□□□□□ -0.05
USP1-201ENST00000339950 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
USP1-201ENST00000339950 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa14.75□□□□□ -0.05
USP1-201ENST00000339950 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
USP1-201ENST00000339950 POLKQ9UBT6 870 aa14.75□□□□□ -0.05
USP1-201ENST00000339950 ANXA1P04083 346 aa14.75□□□□□ -0.05
USP1-201ENST00000339950 NLRP6P59044 892 aa14.75□□□□□ -0.05
USP1-201ENST00000339950 A0A1W2PP64 1363 aa14.74□□□□□ -0.05
USP1-201ENST00000339950 PKNOX2Q96KN3 472 aa14.74□□□□□ -0.05
USP1-201ENST00000339950 DUOX2Q9NRD8 1548 aa14.74□□□□□ -0.05
USP1-201ENST00000339950 NFE2L2Q16236 605 aa14.74□□□□□ -0.05
USP1-201ENST00000339950 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
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USP1-201ENST00000339950 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa14.73□□□□□ -0.05
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USP1-201ENST00000339950 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP14.72□□□□□ -0.05
USP1-201ENST00000339950 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
USP1-201ENST00000339950 ATP10AO60312 1499 aa14.71□□□□□ -0.05
USP1-201ENST00000339950 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
USP1-201ENST00000339950 MEIS3Q99687 375 aa14.71□□□□□ -0.05
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USP1-201ENST00000339950 FCHSD2O94868 740 aa14.71□□□□□ -0.05
USP1-201ENST00000339950 GDPD2Q9HCC8 539 aa14.71□□□□□ -0.05
USP1-201ENST00000339950 USP19O94966 1318 aa14.71□□□□□ -0.06
USP1-201ENST00000339950 ABCA8O94911 1581 aa14.7□□□□□ -0.06
USP1-201ENST00000339950 MSNP26038 577 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
USP1-201ENST00000339950 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa14.7□□□□□ -0.06
USP1-201ENST00000339950 PIK3C2GO75747 1445 aa14.7□□□□□ -0.06
USP1-201ENST00000339950 CDC45O75419 566 aa14.7□□□□□ -0.06
USP1-201ENST00000339950 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
USP1-201ENST00000339950 CCDC27Q2M243 656 aa14.69□□□□□ -0.06
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USP1-201ENST00000339950 PTPRTO14522 1441 aa14.69□□□□□ -0.06
USP1-201ENST00000339950 DDX11L8A8MPP1 907 aa14.69□□□□□ -0.06
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USP1-201ENST00000339950 SLC52A1Q9NWF4 448 aa14.69□□□□□ -0.06
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USP1-201ENST00000339950 LMOD3Q0VAK6 560 aa14.68□□□□□ -0.06
USP1-201ENST00000339950 NUTM1Q86Y26 1132 aa14.68□□□□□ -0.06
USP1-201ENST00000339950 ERVK-7P63135 1459 aa14.68□□□□□ -0.06
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USP1-201ENST00000339950 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
USP1-201ENST00000339950 ST18O60284 1047 aa14.67□□□□□ -0.06
USP1-201ENST00000339950 GRPEL1Q9HAV7 217 aa14.67□□□□□ -0.06
USP1-201ENST00000339950 CCDC61Q9Y6R9 512 aa14.67□□□□□ -0.06
USP1-201ENST00000339950 HMMRO75330 724 aa14.66□□□□□ -0.06
USP1-201ENST00000339950 SURF6O75683 361 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
USP1-201ENST00000339950 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
USP1-201ENST00000339950 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
USP1-201ENST00000339950 G2E3Q7L622 706 aa14.66□□□□□ -0.06
USP1-201ENST00000339950 FGD1P98174 961 aa14.65□□□□□ -0.06
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