RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000336128.11

ZNF548-201, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene ZNF548, Length 2,115 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-201ENST00000336128 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
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ZNF548-201ENST00000336128 PLEKHG3A1L390 1219 aa16.42■□□□□ 0.22
ZNF548-201ENST00000336128 GOLGA2Q08379 1002 aa16.42■□□□□ 0.22
ZNF548-201ENST00000336128 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
ZNF548-201ENST00000336128 NUTM2FA1L443 756 aa16.42■□□□□ 0.22
ZNF548-201ENST00000336128 PPP4R2Q9NY27 417 aa16.41■□□□□ 0.22
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ZNF548-201ENST00000336128 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP16.4■□□□□ 0.22
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ZNF548-201ENST00000336128 PNPLA6Q8IY17 1366 aa16.4■□□□□ 0.22
ZNF548-201ENST00000336128 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
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ZNF548-201ENST00000336128 DUSP27Q5VZP5 1158 aa16.39■□□□□ 0.21
ZNF548-201ENST00000336128 FMN2Q9NZ56 1722 aa16.39■□□□□ 0.21
ZNF548-201ENST00000336128 USP6P35125 1406 aa16.39■□□□□ 0.21
ZNF548-201ENST00000336128 SLFN5Q08AF3 891 aa16.39■□□□□ 0.21
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ZNF548-201ENST00000336128 POLKQ9UBT6 870 aa16.38■□□□□ 0.21
ZNF548-201ENST00000336128 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa16.38■□□□□ 0.21
ZNF548-201ENST00000336128 ANKARQ7Z5J8 1434 aa16.38■□□□□ 0.21
ZNF548-201ENST00000336128 TCP11L2Q8N4U5 519 aa16.37■□□□□ 0.21
ZNF548-201ENST00000336128 AATKQ6ZMQ8 1374 aa16.37■□□□□ 0.21
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ZNF548-201ENST00000336128 NALCNQ8IZF0 1738 aa16.37■□□□□ 0.21
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ZNF548-201ENST00000336128 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
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ZNF548-201ENST00000336128 WWC1Q8IX03 1113 aa16.36■□□□□ 0.21
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ZNF548-201ENST00000336128 SSH2Q76I76 1423 aa16.35■□□□□ 0.21
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ZNF548-201ENST00000336128 DMRT2Q9Y5R5 561 aa16.34■□□□□ 0.21
ZNF548-201ENST00000336128 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa16.34■□□□□ 0.21
ZNF548-201ENST00000336128 OVOS2Q6IE36 1432 aa16.34■□□□□ 0.21
ZNF548-201ENST00000336128 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
ZNF548-201ENST00000336128 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa16.34■□□□□ 0.21
ZNF548-201ENST00000336128 NEUROD2Q15784 382 aa16.33■□□□□ 0.21
ZNF548-201ENST00000336128 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa16.33■□□□□ 0.21
ZNF548-201ENST00000336128 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.21
ZNF548-201ENST00000336128 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
ZNF548-201ENST00000336128 PLEKHF1Q96S99 279 aa16.33■□□□□ 0.2
ZNF548-201ENST00000336128 NWD1Q149M9 1564 aa16.32■□□□□ 0.2
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ZNF548-201ENST00000336128 USP31Q70CQ4 1352 aa16.28■□□□□ 0.2
ZNF548-201ENST00000336128 IL13P35225 146 aa16.28■□□□□ 0.2
ZNF548-201ENST00000336128 PIK3C2AO00443 1686 aa16.28■□□□□ 0.2
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ZNF548-201ENST00000336128 PLIN1O60240 522 aa16.27■□□□□ 0.19
ZNF548-201ENST00000336128 FCHSD2O94868 740 aa16.27■□□□□ 0.19
ZNF548-201ENST00000336128 RSPH6AQ9H0K4 717 aa16.27■□□□□ 0.19
ZNF548-201ENST00000336128 EXOC6Q8TAG9 804 aa16.26■□□□□ 0.19
ZNF548-201ENST00000336128 PEAK1Q9H792 1746 aa16.25■□□□□ 0.19
ZNF548-201ENST00000336128 PRKAR2BP31323 418 aa16.24■□□□□ 0.19
ZNF548-201ENST00000336128 USP54Q70EL1 1684 aa16.24■□□□□ 0.19
ZNF548-201ENST00000336128 PHF8Q9UPP1 1060 aa16.24■□□□□ 0.19
ZNF548-201ENST00000336128 TRIM35Q9UPQ4 493 aa16.23■□□□□ 0.19
ZNF548-201ENST00000336128 HMOX1P09601 288 aa16.22■□□□□ 0.19
ZNF548-201ENST00000336128 CCDC136Q96JN2 1154 aa16.22■□□□□ 0.19
ZNF548-201ENST00000336128 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
ZNF548-201ENST00000336128 C14orf37Q86TY3 774 aa16.22■□□□□ 0.19
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ZNF548-201ENST00000336128 RIPK4P57078 832 aa16.21■□□□□ 0.19
ZNF548-201ENST00000336128 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP16.21■□□□□ 0.19
ZNF548-201ENST00000336128 MYH16Q9H6N6 1097 aa16.21■□□□□ 0.19
ZNF548-201ENST00000336128 CRBNQ96SW2 442 aa16.21■□□□□ 0.18
ZNF548-201ENST00000336128 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa16.21■□□□□ 0.18
ZNF548-201ENST00000336128 SOX12O15370 315 aa16.2■□□□□ 0.18
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ZNF548-201ENST00000336128 C20orf194Q5TEA3 1177 aa16.19■□□□□ 0.18
ZNF548-201ENST00000336128 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
ZNF548-201ENST00000336128 IL16Q14005 1332 aa16.19■□□□□ 0.18
ZNF548-201ENST00000336128 MAP3K19Q56UN5 1328 aa16.19■□□□□ 0.18
ZNF548-201ENST00000336128 NFE2L2Q16236 605 aa16.19■□□□□ 0.18
ZNF548-201ENST00000336128 RGPD1P0DJD0 1748 aa16.18■□□□□ 0.18
ZNF548-201ENST00000336128 BCAR3O75815 825 aa16.18■□□□□ 0.18
ZNF548-201ENST00000336128 NLRP6P59044 892 aa16.18■□□□□ 0.18
ZNF548-201ENST00000336128 PHACTR3Q96KR7 559 aa16.18■□□□□ 0.18
ZNF548-201ENST00000336128 SBNO1A3KN83 1393 aa16.18■□□□□ 0.18
ZNF548-201ENST00000336128 FANCIQ9NVI1 1328 aa16.17■□□□□ 0.18
ZNF548-201ENST00000336128 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa16.17■□□□□ 0.18
ZNF548-201ENST00000336128 ESCO1Q5FWF5 840 aa16.17■□□□□ 0.18
ZNF548-201ENST00000336128 FLT4P35916 1363 aa16.17■□□□□ 0.18
ZNF548-201ENST00000336128 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
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