RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330233.11

CRIP1-201, Transcript of cysteine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CRIP1, Length 1,311 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1-201ENST00000330233 ALS2Q96Q42 1657 aa37.15■■■■□ 3.54
CRIP1-201ENST00000330233 POLR3GLQ9BT43 218 aa37.14■■■■□ 3.54
CRIP1-201ENST00000330233 CD163L1Q9NR16 1453 aa37.14■■■■□ 3.54
CRIP1-201ENST00000330233 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP37.13■■■■□ 3.54
CRIP1-201ENST00000330233 MON2Q7Z3U7 1717 aa37.12■■■■□ 3.53
CRIP1-201ENST00000330233 ABTB2Q8N961 1025 aa37.1■■■■□ 3.53
CRIP1-201ENST00000330233 SSH2Q76I76 1423 aa37.1■■■■□ 3.53
CRIP1-201ENST00000330233 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa37.09■■■■□ 3.53
CRIP1-201ENST00000330233 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP37.09■■■■□ 3.53
CRIP1-201ENST00000330233 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP37.09■■■■□ 3.53
CRIP1-201ENST00000330233 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP37.09■■■■□ 3.53
CRIP1-201ENST00000330233 A0A1W2PP64 1363 aa37.08■■■■□ 3.53
CRIP1-201ENST00000330233 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa37.08■■■■□ 3.53
CRIP1-201ENST00000330233 TTC21AQ8NDW8 1320 aa37.08■■■■□ 3.53
CRIP1-201ENST00000330233 MYOM1P52179 1685 aa37.07■■■■□ 3.52
CRIP1-201ENST00000330233 KIF7Q2M1P5 1343 aa37.05■■■■□ 3.52
CRIP1-201ENST00000330233 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP37.04■■■■□ 3.52
CRIP1-201ENST00000330233 NLRP13Q86W25 1043 aa37.04■■■■□ 3.52
CRIP1-201ENST00000330233 NRKQ7Z2Y5 1582 aa37.02■■■■□ 3.52
CRIP1-201ENST00000330233 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP37.01■■■■□ 3.52
CRIP1-201ENST00000330233 NLRP6P59044 892 aa36.99■■■■□ 3.51
CRIP1-201ENST00000330233 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP36.99■■■■□ 3.51
CRIP1-201ENST00000330233 NUTM2GQ5VZR2 741 aa36.99■■■■□ 3.51
CRIP1-201ENST00000330233 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP36.99■■■■□ 3.51
CRIP1-201ENST00000330233 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP36.99■■■■□ 3.51
CRIP1-201ENST00000330233 CABLES1Q8TDN4 633 aa36.98■■■■□ 3.51
CRIP1-201ENST00000330233 LRP6O75581 1613 aa36.97■■■■□ 3.51
CRIP1-201ENST00000330233 PLEKHG5O94827 1062 aa36.96■■■■□ 3.51
CRIP1-201ENST00000330233 CCDC7Q96M83 1385 aa36.96■■■■□ 3.51
CRIP1-201ENST00000330233 PIK3C2AO00443 1686 aa36.94■■■■□ 3.5
CRIP1-201ENST00000330233 ADAMTS2O95450 1211 aa36.93■■■■□ 3.5
CRIP1-201ENST00000330233 ABCA3Q99758 1704 aa36.93■■■■□ 3.5
CRIP1-201ENST00000330233 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP36.93■■■■□ 3.5
CRIP1-201ENST00000330233 WASHC2AQ641Q2 1341 aa36.93■■■■□ 3.5
CRIP1-201ENST00000330233 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa36.91■■■■□ 3.5
CRIP1-201ENST00000330233 CARD14Q9BXL6 1004 aa36.91■■■■□ 3.5
CRIP1-201ENST00000330233 PANK3Q9H999 370 aa36.91■■■■□ 3.5
CRIP1-201ENST00000330233 USP19O94966 1318 aa36.9■■■■□ 3.5
CRIP1-201ENST00000330233 USP31Q70CQ4 1352 aa36.89■■■■□ 3.5
CRIP1-201ENST00000330233 NME9Q86XW9 330 aa36.88■■■■□ 3.49
CRIP1-201ENST00000330233 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP36.86■■■■□ 3.49
CRIP1-201ENST00000330233 GCP02774 474 aa36.85■■■■□ 3.49
CRIP1-201ENST00000330233 C8orf37Q96NL8 207 aa36.85■■■■□ 3.49
CRIP1-201ENST00000330233 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP36.85■■■■□ 3.49
CRIP1-201ENST00000330233 NGLY1Q96IV0 654 aa36.85■■■■□ 3.49
CRIP1-201ENST00000330233 NSD3Q9BZ95 1437 aa36.84■■■■□ 3.49
CRIP1-201ENST00000330233 KCNH5Q8NCM2 988 aa36.84■■■■□ 3.49
CRIP1-201ENST00000330233 USP54Q70EL1 1684 aa36.83■■■■□ 3.49
CRIP1-201ENST00000330233 FYB1O15117 783 aa36.82■■■■□ 3.48
CRIP1-201ENST00000330233 ZRANB1Q9UGI0 708 aa36.82■■■■□ 3.48
CRIP1-201ENST00000330233 SLIT3O75094 1523 aa36.8■■■■□ 3.48
CRIP1-201ENST00000330233 CGNL1Q0VF96 1302 aa36.8■■■■□ 3.48
CRIP1-201ENST00000330233 COG3Q96JB2 828 aa36.8■■■■□ 3.48
CRIP1-201ENST00000330233 KIF20BQ96Q89 1820 aa36.79■■■■□ 3.48
CRIP1-201ENST00000330233 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP36.77■■■■□ 3.48
CRIP1-201ENST00000330233 KNSTRNQ9Y448 316 aa36.77■■■■□ 3.48
CRIP1-201ENST00000330233 FAM83GA6ND36 823 aa36.76■■■■□ 3.47
CRIP1-201ENST00000330233 AFF2P51816 1311 aa36.75■■■■□ 3.47
CRIP1-201ENST00000330233 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP36.75■■■■□ 3.47
CRIP1-201ENST00000330233 GGNBP2Q9H3C7 697 aa36.75■■■■□ 3.47
CRIP1-201ENST00000330233 PRDM11Q9NQV5 511 aa36.75■■■■□ 3.47
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP36.74■■■■□ 3.47
CRIP1-201ENST00000330233 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa36.74■■■■□ 3.47
CRIP1-201ENST00000330233 OVOS2Q6IE36 1432 aa36.74■■■■□ 3.47
CRIP1-201ENST00000330233 CPDO75976 1380 aa36.74■■■■□ 3.47
CRIP1-201ENST00000330233 KIAA0232Q92628 1395 aa36.73■■■■□ 3.47
CRIP1-201ENST00000330233 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP36.72■■■■□ 3.47
CRIP1-201ENST00000330233 SOX12O15370 315 aa36.68■■■■□ 3.46
CRIP1-201ENST00000330233 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP36.68■■■■□ 3.46
CRIP1-201ENST00000330233 USP21Q9UK80 565 aa36.68■■■■□ 3.46
CRIP1-201ENST00000330233 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP36.67■■■■□ 3.46
CRIP1-201ENST00000330233 NWD2Q9ULI1 1742 aa36.66■■■■□ 3.46
CRIP1-201ENST00000330233 SLIT2O94813 1529 aa36.66■■■■□ 3.46
CRIP1-201ENST00000330233 NFAT5O94916 1531 aa36.65■■■■□ 3.46
CRIP1-201ENST00000330233 PLCH1Q4KWH8 1693 aa36.65■■■■□ 3.46
CRIP1-201ENST00000330233 ARHGEF25Q86VW2 580 aa36.65■■■■□ 3.46
CRIP1-201ENST00000330233 NSD2O96028 1365 aa36.65■■■■□ 3.46
CRIP1-201ENST00000330233 CHRNA2Q15822 529 aa36.64■■■■□ 3.46
CRIP1-201ENST00000330233 UNC5CLQ8IV45 518 aa36.63■■■■□ 3.45
CRIP1-201ENST00000330233 BTG4Q9NY30 223 aa36.62■■■■□ 3.45
CRIP1-201ENST00000330233 BCL9LQ86UU0 1499 aa36.62■■■■□ 3.45
CRIP1-201ENST00000330233 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa36.61■■■■□ 3.45
CRIP1-201ENST00000330233 ZBTB7CA1YPR0 619 aa36.61■■■■□ 3.45
CRIP1-201ENST00000330233 AATKQ6ZMQ8 1374 aa36.61■■■■□ 3.45
CRIP1-201ENST00000330233 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP36.59■■■■□ 3.45
CRIP1-201ENST00000330233 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP36.59■■■■□ 3.45
CRIP1-201ENST00000330233 LTN1O94822 1766 aa36.59■■■■□ 3.45
CRIP1-201ENST00000330233 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP36.59■■■■□ 3.45
CRIP1-201ENST00000330233 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP36.59■■■■□ 3.45
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP36.58■■■■□ 3.45
CRIP1-201ENST00000330233 COL18A1P39060 1754 aa36.56■■■■□ 3.44
CRIP1-201ENST00000330233 POTEAQ6S8J7 498 aa36.55■■■■□ 3.44
CRIP1-201ENST00000330233 LMO7Q8WWI1 1683 aa36.54■■■■□ 3.44
CRIP1-201ENST00000330233 EVA1CP58658 441 aa36.54■■■■□ 3.44
CRIP1-201ENST00000330233 MORC1Q86VD1 984 aa36.53■■■■□ 3.44
CRIP1-201ENST00000330233 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP36.52■■■■□ 3.44
CRIP1-201ENST00000330233 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa36.52■■■■□ 3.44
CRIP1-201ENST00000330233 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa36.52■■■■□ 3.44
CRIP1-201ENST00000330233 ABCC6O95255 1503 aa36.52■■■■□ 3.44
CRIP1-201ENST00000330233 RGPD5Q99666 1765 aa36.51■■■■□ 3.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.9 ms