RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000297239.10

SYTL3-201, Transcript of synaptotagmin like 3, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYTL3, Length 2,292 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3-201ENST00000297239 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa23.54■■□□□ 1.36
SYTL3-201ENST00000297239 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
SYTL3-201ENST00000297239 GOLGA2Q08379 1002 aa23.53■■□□□ 1.36
SYTL3-201ENST00000297239 NME9Q86XW9 330 aa23.53■■□□□ 1.36
SYTL3-201ENST00000297239 MON2Q7Z3U7 1717 aa23.53■■□□□ 1.36
SYTL3-201ENST00000297239 AKAP12Q02952 1782 aa23.53■■□□□ 1.36
SYTL3-201ENST00000297239 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
SYTL3-201ENST00000297239 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
SYTL3-201ENST00000297239 ITSN1Q15811 1721 aa23.51■■□□□ 1.35
SYTL3-201ENST00000297239 DIP2AQ14689 1571 aa23.51■■□□□ 1.35
SYTL3-201ENST00000297239 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
SYTL3-201ENST00000297239 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP23.5■■□□□ 1.35
SYTL3-201ENST00000297239 NEUROD2Q15784 382 aa23.5■■□□□ 1.35
SYTL3-201ENST00000297239 IQSEC2Q5JU85 1478 aa23.5■■□□□ 1.35
SYTL3-201ENST00000297239 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
SYTL3-201ENST00000297239 SLFN5Q08AF3 891 aa23.49■■□□□ 1.35
SYTL3-201ENST00000297239 RUNDC1Q96C34 613 aa23.49■■□□□ 1.35
SYTL3-201ENST00000297239 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa23.49■■□□□ 1.35
SYTL3-201ENST00000297239 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
SYTL3-201ENST00000297239 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
SYTL3-201ENST00000297239 PTCH1Q13635 1447 aa23.49■■□□□ 1.35
SYTL3-201ENST00000297239 TCP11L2Q8N4U5 519 aa23.48■■□□□ 1.35
SYTL3-201ENST00000297239 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
SYTL3-201ENST00000297239 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
SYTL3-201ENST00000297239 PLIN1O60240 522 aa23.47■■□□□ 1.35
SYTL3-201ENST00000297239 KCNA6P17658 529 aa23.47■■□□□ 1.35
SYTL3-201ENST00000297239 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
SYTL3-201ENST00000297239 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
SYTL3-201ENST00000297239 WWC1Q8IX03 1113 aa23.46■■□□□ 1.35
SYTL3-201ENST00000297239 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
SYTL3-201ENST00000297239 POLKQ9UBT6 870 aa23.45■■□□□ 1.35
SYTL3-201ENST00000297239 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
SYTL3-201ENST00000297239 ACEP12821 1306 aa23.44■■□□□ 1.34
SYTL3-201ENST00000297239 PNPLA6Q8IY17 1366 aa23.44■■□□□ 1.34
SYTL3-201ENST00000297239 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa23.43■■□□□ 1.34
SYTL3-201ENST00000297239 ANKLE2Q86XL3 938 aa23.42■■□□□ 1.34
SYTL3-201ENST00000297239 EXOC6Q8TAG9 804 aa23.42■■□□□ 1.34
SYTL3-201ENST00000297239 NRKQ7Z2Y5 1582 aa23.41■■□□□ 1.34
SYTL3-201ENST00000297239 PLEKHG3A1L390 1219 aa23.4■■□□□ 1.34
SYTL3-201ENST00000297239 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
SYTL3-201ENST00000297239 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa23.4■■□□□ 1.34
SYTL3-201ENST00000297239 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
SYTL3-201ENST00000297239 PLEKHF1Q96S99 279 aa23.39■■□□□ 1.34
SYTL3-201ENST00000297239 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.34
SYTL3-201ENST00000297239 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
SYTL3-201ENST00000297239 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa23.38■■□□□ 1.33
SYTL3-201ENST00000297239 E9PSI1 815 aa23.38■■□□□ 1.33
SYTL3-201ENST00000297239 NGEFQ8N5V2 710 aa23.38■■□□□ 1.33
SYTL3-201ENST00000297239 COG3Q96JB2 828 aa23.38■■□□□ 1.33
SYTL3-201ENST00000297239 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
SYTL3-201ENST00000297239 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
SYTL3-201ENST00000297239 USP6P35125 1406 aa23.36■■□□□ 1.33
SYTL3-201ENST00000297239 PIK3R4Q99570 1358 aa23.36■■□□□ 1.33
SYTL3-201ENST00000297239 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
SYTL3-201ENST00000297239 C20orf194Q5TEA3 1177 aa23.35■■□□□ 1.33
SYTL3-201ENST00000297239 CCDC136Q96JN2 1154 aa23.33■■□□□ 1.33
SYTL3-201ENST00000297239 AATKQ6ZMQ8 1374 aa23.32■■□□□ 1.32
SYTL3-201ENST00000297239 NALCNQ8IZF0 1738 aa23.32■■□□□ 1.32
SYTL3-201ENST00000297239 SSH2Q76I76 1423 aa23.32■■□□□ 1.32
SYTL3-201ENST00000297239 LRRC7Q96NW7 1537 aa23.32■■□□□ 1.32
SYTL3-201ENST00000297239 CCDC27Q2M243 656 aa23.31■■□□□ 1.32
SYTL3-201ENST00000297239 FMN2Q9NZ56 1722 aa23.31■■□□□ 1.32
SYTL3-201ENST00000297239 TMPOP42166 694 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
SYTL3-201ENST00000297239 CRBNQ96SW2 442 aa23.3■■□□□ 1.32
SYTL3-201ENST00000297239 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa23.3■■□□□ 1.32
SYTL3-201ENST00000297239 OVOS2Q6IE36 1432 aa23.3■■□□□ 1.32
SYTL3-201ENST00000297239 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
SYTL3-201ENST00000297239 BCAR3O75815 825 aa23.29■■□□□ 1.32
SYTL3-201ENST00000297239 HMOX1P09601 288 aa23.29■■□□□ 1.32
SYTL3-201ENST00000297239 IL13P35225 146 aa23.29■■□□□ 1.32
SYTL3-201ENST00000297239 WDR63Q8IWG1 891 aa23.29■■□□□ 1.32
SYTL3-201ENST00000297239 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
SYTL3-201ENST00000297239 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
SYTL3-201ENST00000297239 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa23.28■■□□□ 1.32
SYTL3-201ENST00000297239 RSPH6AQ9H0K4 717 aa23.28■■□□□ 1.32
SYTL3-201ENST00000297239 TRIM35Q9UPQ4 493 aa23.28■■□□□ 1.32
SYTL3-201ENST00000297239 SOX12O15370 315 aa23.27■■□□□ 1.32
SYTL3-201ENST00000297239 PRKAR2BP31323 418 aa23.26■■□□□ 1.31
SYTL3-201ENST00000297239 FCHSD2O94868 740 aa23.25■■□□□ 1.31
SYTL3-201ENST00000297239 PHACTR3Q96KR7 559 aa23.24■■□□□ 1.31
SYTL3-201ENST00000297239 PEAK1Q9H792 1746 aa23.24■■□□□ 1.31
SYTL3-201ENST00000297239 ANKARQ7Z5J8 1434 aa23.24■■□□□ 1.31
SYTL3-201ENST00000297239 RIPK4P57078 832 aa23.23■■□□□ 1.31
SYTL3-201ENST00000297239 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
SYTL3-201ENST00000297239 PIK3C2AO00443 1686 aa23.22■■□□□ 1.31
SYTL3-201ENST00000297239 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
SYTL3-201ENST00000297239 USP31Q70CQ4 1352 aa23.2■■□□□ 1.31
SYTL3-201ENST00000297239 NBR1Q14596 966 aa23.2■■□□□ 1.3
SYTL3-201ENST00000297239 TTC21AQ8NDW8 1320 aa23.19■■□□□ 1.3
SYTL3-201ENST00000297239 NUTM2GQ5VZR2 741 aa23.19■■□□□ 1.3
SYTL3-201ENST00000297239 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
SYTL3-201ENST00000297239 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa23.18■■□□□ 1.3
SYTL3-201ENST00000297239 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
SYTL3-201ENST00000297239 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa23.17■■□□□ 1.3
SYTL3-201ENST00000297239 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
SYTL3-201ENST00000297239 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
SYTL3-201ENST00000297239 RARSP54136 660 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
SYTL3-201ENST00000297239 AEBP1Q8IUX7 1158 aa23.16■■□□□ 1.3
SYTL3-201ENST00000297239 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
SYTL3-201ENST00000297239 MYH16Q9H6N6 1097 aa23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.9 ms