RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233331.11

INO80B-201, Transcript of INO80 complex subunit B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene INO80B, Length 1,261 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80B-201ENST00000233331 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa43.47■■■■■ 4.55
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INO80B-201ENST00000233331 CABP1Q9NZU7 370 aa43.43■■■■■ 4.54
INO80B-201ENST00000233331 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa43.42■■■■■ 4.54
INO80B-201ENST00000233331 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP43.39■■■■■ 4.54
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INO80B-201ENST00000233331 BCL9LQ86UU0 1499 aa43.38■■■■■ 4.53
INO80B-201ENST00000233331 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa43.37■■■■■ 4.53
INO80B-201ENST00000233331 ATAD2Q6PL18 1390 aa43.36■■■■■ 4.53
INO80B-201ENST00000233331 ATRNO75882 1429 aa43.36■■■■■ 4.53
INO80B-201ENST00000233331 SLIT2O94813 1529 aa43.36■■■■■ 4.53
INO80B-201ENST00000233331 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP43.35■■■■■ 4.53
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INO80B-201ENST00000233331 PLCH1Q4KWH8 1693 aa43.32■■■■■ 4.53
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INO80B-201ENST00000233331 AKAP12Q02952 1782 aa43.23■■■■■ 4.51
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INO80B-201ENST00000233331 USP19O94966 1318 aa43.16■■■■■ 4.5
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INO80B-201ENST00000233331 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP43.13■■■■■ 4.49
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INO80B-201ENST00000233331 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa43.07■■■■■ 4.49
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INO80B-201ENST00000233331 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP43.03■■■■■ 4.48
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INO80B-201ENST00000233331 A0A1W2PP64 1363 aa42.97■■■■■ 4.47
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INO80B-201ENST00000233331 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa42.89■■■■■ 4.46
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INO80B-201ENST00000233331 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa42.88■■■■■ 4.45
INO80B-201ENST00000233331 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa42.88■■■■■ 4.45
INO80B-201ENST00000233331 NME9Q86XW9 330 aa42.87■■■■■ 4.45
INO80B-201ENST00000233331 SEPT12Q8IYM1 358 aa42.87■■■■■ 4.45
INO80B-201ENST00000233331 SOX12O15370 315 aa42.86■■■■■ 4.45
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INO80B-201ENST00000233331 USP54Q70EL1 1684 aa42.83■■■■■ 4.45
INO80B-201ENST00000233331 A0A0G2JS52 829 aa42.83■■■■■ 4.45
INO80B-201ENST00000233331 MYT1Q01538 1121 aa42.83■■■■■ 4.45
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INO80B-201ENST00000233331 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa42.79■■■■■ 4.44
INO80B-201ENST00000233331 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP42.79■■■■■ 4.44
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INO80B-201ENST00000233331 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP42.75■■■■■ 4.43
INO80B-201ENST00000233331 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP42.75■■■■■ 4.43
INO80B-201ENST00000233331 ARHGEF25Q86VW2 580 aa42.75■■■■■ 4.43
INO80B-201ENST00000233331 COL18A1P39060 1754 aa42.75■■■■■ 4.43
INO80B-201ENST00000233331 USP35Q9P2H5 1018 aa42.73■■■■■ 4.43
INO80B-201ENST00000233331 MYOM1P52179 1685 aa42.72■■■■■ 4.43
INO80B-201ENST00000233331 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa42.71■■■■■ 4.43
INO80B-201ENST00000233331 OVOS2Q6IE36 1432 aa42.71■■■■■ 4.43
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