RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 CHD4Q14839 1912 aa25.06■■□□□ 1.6
SPCS1-201ENST00000233025 APBA3O96018 575 aa25.04■■□□□ 1.6
SPCS1-201ENST00000233025 IFFO2Q5TF58 517 aa25.04■■□□□ 1.6
SPCS1-201ENST00000233025 SPON1Q9HCB6 807 aa25.04■■□□□ 1.6
SPCS1-201ENST00000233025 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
SPCS1-201ENST00000233025 PIK3C2GO75747 1445 aa25.03■■□□□ 1.6
SPCS1-201ENST00000233025 DCAF8L1A6NGE4 600 aa25.03■■□□□ 1.6
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM132EQ6IEE7 984 aa25.03■■□□□ 1.6
SPCS1-201ENST00000233025 CASZ1Q86V15 1759 aa25.03■■□□□ 1.6
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
SPCS1-201ENST00000233025 KCNQ2O43526 872 aa25.01■■□□□ 1.59
SPCS1-201ENST00000233025 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
SPCS1-201ENST00000233025 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa25■■□□□ 1.59
SPCS1-201ENST00000233025 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa25■■□□□ 1.59
SPCS1-201ENST00000233025 NRKQ7Z2Y5 1582 aa25■■□□□ 1.59
SPCS1-201ENST00000233025 NBPF8Q3BBV2 869 aa24.99■■□□□ 1.59
SPCS1-201ENST00000233025 NBPF14Q5TI25 921 aa24.99■■□□□ 1.59
SPCS1-201ENST00000233025 ANKARQ7Z5J8 1434 aa24.99■■□□□ 1.59
SPCS1-201ENST00000233025 SIRT1Q96EB6 747 aa24.98■■□□□ 1.59
SPCS1-201ENST00000233025 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa24.97■■□□□ 1.59
SPCS1-201ENST00000233025 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa24.97■■□□□ 1.59
SPCS1-201ENST00000233025 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
SPCS1-201ENST00000233025 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa24.96■■□□□ 1.59
SPCS1-201ENST00000233025 MYOM1P52179 1685 aa24.96■■□□□ 1.59
SPCS1-201ENST00000233025 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa24.95■■□□□ 1.58
SPCS1-201ENST00000233025 PRDM11Q9NQV5 511 aa24.92■■□□□ 1.58
SPCS1-201ENST00000233025 SBF2Q86WG5 1849 aa24.91■■□□□ 1.58
SPCS1-201ENST00000233025 CEP350Q5VT06 3117 aa24.91■■□□□ 1.58
SPCS1-201ENST00000233025 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
SPCS1-201ENST00000233025 C1QTNF8P60827 252 aa24.89■■□□□ 1.58
SPCS1-201ENST00000233025 PEAK1Q9H792 1746 aa24.88■■□□□ 1.57
SPCS1-201ENST00000233025 GPRASP1Q5JY77 1395 aa24.88■■□□□ 1.57
SPCS1-201ENST00000233025 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
SPCS1-201ENST00000233025 DLC1Q96QB1 1528 aa24.87■■□□□ 1.57
SPCS1-201ENST00000233025 KIAA0232Q92628 1395 aa24.87■■□□□ 1.57
SPCS1-201ENST00000233025 RGL3Q3MIN7 710 aa24.85■■□□□ 1.57
SPCS1-201ENST00000233025 BARGINQ6ZT62 677 aa24.85■■□□□ 1.57
SPCS1-201ENST00000233025 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
SPCS1-201ENST00000233025 PDE3BQ13370 1112 aa24.84■■□□□ 1.57
SPCS1-201ENST00000233025 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP24.84■■□□□ 1.57
SPCS1-201ENST00000233025 PRAM1Q96QH2 718 aa24.84■■□□□ 1.57
SPCS1-201ENST00000233025 TULP4Q9NRJ4 1543 aa24.84■■□□□ 1.57
SPCS1-201ENST00000233025 SSH2Q76I76 1423 aa24.84■■□□□ 1.57
SPCS1-201ENST00000233025 STRN4Q9NRL3 753 aa24.83■■□□□ 1.57
SPCS1-201ENST00000233025 LMO7Q8WWI1 1683 aa24.82■■□□□ 1.56
SPCS1-201ENST00000233025 CHRNA2Q15822 529 aa24.82■■□□□ 1.56
SPCS1-201ENST00000233025 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
SPCS1-201ENST00000233025 PRR36Q9H6K5 1346 aa24.82■■□□□ 1.56
SPCS1-201ENST00000233025 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
SPCS1-201ENST00000233025 ITSN1Q15811 1721 aa24.81■■□□□ 1.56
SPCS1-201ENST00000233025 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
SPCS1-201ENST00000233025 USP35Q9P2H5 1018 aa24.8■■□□□ 1.56
SPCS1-201ENST00000233025 PTGER2P43116 358 aa24.78■■□□□ 1.56
SPCS1-201ENST00000233025 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
SPCS1-201ENST00000233025 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
SPCS1-201ENST00000233025 LRRC37A3O60309 1634 aa24.75■■□□□ 1.55
SPCS1-201ENST00000233025 ATP7BP35670 1465 aa24.75■■□□□ 1.55
SPCS1-201ENST00000233025 ADGRB1O14514 1584 aa24.73■■□□□ 1.55
SPCS1-201ENST00000233025 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa24.73■■□□□ 1.55
SPCS1-201ENST00000233025 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa24.73■■□□□ 1.55
SPCS1-201ENST00000233025 OVOS2Q6IE36 1432 aa24.73■■□□□ 1.55
SPCS1-201ENST00000233025 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
SPCS1-201ENST00000233025 CFAP70Q5T0N1 1121 aa24.73■■□□□ 1.55
SPCS1-201ENST00000233025 TCP11L2Q8N4U5 519 aa24.73■■□□□ 1.55
SPCS1-201ENST00000233025 PLSCR1O15162 318 aa24.72■■□□□ 1.55
SPCS1-201ENST00000233025 ZBTB7AO95365 584 aa24.72■■□□□ 1.55
SPCS1-201ENST00000233025 WNK3Q9BYP7 1800 aa24.71■■□□□ 1.55
SPCS1-201ENST00000233025 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
SPCS1-201ENST00000233025 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
SPCS1-201ENST00000233025 SYT17Q9BSW7 474 aa24.71■■□□□ 1.55
SPCS1-201ENST00000233025 POGKQ9P215 609 aa24.71■■□□□ 1.55
SPCS1-201ENST00000233025 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
SPCS1-201ENST00000233025 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
SPCS1-201ENST00000233025 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
SPCS1-201ENST00000233025 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
SPCS1-201ENST00000233025 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
SPCS1-201ENST00000233025 AKAP12Q02952 1782 aa24.68■■□□□ 1.54
SPCS1-201ENST00000233025 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
SPCS1-201ENST00000233025 EVA1CP58658 441 aa24.67■■□□□ 1.54
SPCS1-201ENST00000233025 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa24.66■■□□□ 1.54
SPCS1-201ENST00000233025 CPDO75976 1380 aa24.66■■□□□ 1.54
SPCS1-201ENST00000233025 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
SPCS1-201ENST00000233025 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
SPCS1-201ENST00000233025 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.54
SPCS1-201ENST00000233025 WASLO00401 505 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.54
SPCS1-201ENST00000233025 PROM2Q8N271 834 aa24.64■■□□□ 1.54
SPCS1-201ENST00000233025 SGIP1Q9BQI5 828 aa24.64■■□□□ 1.54
SPCS1-201ENST00000233025 SHANK3Q9BYB0 1731 aa24.64■■□□□ 1.53
SPCS1-201ENST00000233025 PTF1AQ7RTS3 328 aa24.63■■□□□ 1.53
SPCS1-201ENST00000233025 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
SPCS1-201ENST00000233025 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
SPCS1-201ENST00000233025 NUTM2GQ5VZR2 741 aa24.61■■□□□ 1.53
SPCS1-201ENST00000233025 MAP3K5Q99683 1374 aa24.61■■□□□ 1.53
SPCS1-201ENST00000233025 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
SPCS1-201ENST00000233025 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
SPCS1-201ENST00000233025 CRB1P82279 1406 aa24.59■■□□□ 1.53
SPCS1-201ENST00000233025 MTFR1LQ9H019 292 aa24.58■■□□□ 1.53
SPCS1-201ENST00000233025 BCL9O00512 1426 aa24.58■■□□□ 1.53
SPCS1-201ENST00000233025 USP19O94966 1318 aa24.58■■□□□ 1.52
SPCS1-201ENST00000233025 TRAK1Q9UPV9 953 aa24.57■■□□□ 1.52
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