RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000222753.5

HOXA13-201, Transcript of homeobox A13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXA13, Length 5,030 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13-201ENST00000222753 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
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HOXA13-201ENST00000222753 TRDNQ13061 729 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXA13-201ENST00000222753 CCDC192P0DO97 292 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXA13-201ENST00000222753 SDF4Q9BRK5 362 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXA13-201ENST00000222753 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
HOXA13-201ENST00000222753 NECTIN2Q92692 538 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXA13-201ENST00000222753 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXA13-201ENST00000222753 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
HOXA13-201ENST00000222753 ARHGAP5Q13017 1502 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXA13-201ENST00000222753 CCP110O43303 1012 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXA13-201ENST00000222753 HSP90B2PQ58FF3 399 aa22.27■■□□□ 1.16
HOXA13-201ENST00000222753 C1orf115Q9H7X2 142 aa22.27■■□□□ 1.16
HOXA13-201ENST00000222753 HIP1O00291 1037 aa22.27■■□□□ 1.16
HOXA13-201ENST00000222753 FIBPO43427 364 aa22.27■■□□□ 1.16
HOXA13-201ENST00000222753 AEBP1Q8IUX7 1158 aa22.27■■□□□ 1.16
HOXA13-201ENST00000222753 CLSTN1O94985 981 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXA13-201ENST00000222753 TMEM132EQ6IEE7 984 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXA13-201ENST00000222753 IFT140Q96RY7 1462 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXA13-201ENST00000222753 GNAI2P04899 355 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXA13-201ENST00000222753 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
HOXA13-201ENST00000222753 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
HOXA13-201ENST00000222753 KINO60870 393 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
HOXA13-201ENST00000222753 CCDC27Q2M243 656 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXA13-201ENST00000222753 C20orf194Q5TEA3 1177 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXA13-201ENST00000222753 CCDC30Q5VVM6 783 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXA13-201ENST00000222753 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXA13-201ENST00000222753 SURF6O75683 361 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
HOXA13-201ENST00000222753 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
HOXA13-201ENST00000222753 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
HOXA13-201ENST00000222753 OLFM4Q6UX06 510 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXA13-201ENST00000222753 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
HOXA13-201ENST00000222753 CCT4P50991 539 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
HOXA13-201ENST00000222753 TBC1D2Q9BYX2 928 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXA13-201ENST00000222753 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP22.22■■□□□ 1.15
HOXA13-201ENST00000222753 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXA13-201ENST00000222753 CCDC112Q8NEF3 446 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXA13-201ENST00000222753 TTC5Q8N0Z6 440 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXA13-201ENST00000222753 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
HOXA13-201ENST00000222753 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
HOXA13-201ENST00000222753 CEP89Q96ST8 783 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXA13-201ENST00000222753 RARSP54136 660 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.15
HOXA13-201ENST00000222753 GAS2L2Q8NHY3 880 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXA13-201ENST00000222753 KRT85P78386 507 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXA13-201ENST00000222753 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
HOXA13-201ENST00000222753 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXA13-201ENST00000222753 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
HOXA13-201ENST00000222753 LRRCC1Q9C099 1032 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXA13-201ENST00000222753 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
HOXA13-201ENST00000222753 FSD1Q9BTV5 496 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXA13-201ENST00000222753 ANKRD1Q15327 319 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXA13-201ENST00000222753 FBXW7Q969H0 707 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXA13-201ENST00000222753 AK7Q96M32 723 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXA13-201ENST00000222753 DUSP27Q5VZP5 1158 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXA13-201ENST00000222753 SKAP1Q86WV1 359 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXA13-201ENST00000222753 ERC1Q8IUD2 1116 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXA13-201ENST00000222753 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
HOXA13-201ENST00000222753 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXA13-201ENST00000222753 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
HOXA13-201ENST00000222753 MARCH6O60337 910 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXA13-201ENST00000222753 SPC24Q8NBT2 197 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXA13-201ENST00000222753 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
HOXA13-201ENST00000222753 TMEM57Q8N5G2 664 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXA13-201ENST00000222753 PDCL3Q9H2J4 239 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXA13-201ENST00000222753 TNMDQ9H2S6 317 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXA13-201ENST00000222753 APPP05067 770 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXA13-201ENST00000222753 PDCL2Q8N4E4 241 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXA13-201ENST00000222753 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
HOXA13-201ENST00000222753 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXA13-201ENST00000222753 PSME1Q06323 249 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXA13-201ENST00000222753 FCHSD2O94868 740 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXA13-201ENST00000222753 NFXL1Q6ZNB6 911 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXA13-201ENST00000222753 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
HOXA13-201ENST00000222753 RUFY1Q96T51 708 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXA13-201ENST00000222753 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
HOXA13-201ENST00000222753 SMC2O95347 1197 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXA13-201ENST00000222753 ABCC11Q96J66 1382 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXA13-201ENST00000222753 SLC4A2P04920 1241 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXA13-201ENST00000222753 TMPOP42166 694 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
HOXA13-201ENST00000222753 FOSBP53539 338 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXA13-201ENST00000222753 GPRASP1Q5JY77 1395 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXA13-201ENST00000222753 ALDH1L2Q3SY69 923 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXA13-201ENST00000222753 TBC1D32Q96NH3 1257 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXA13-201ENST00000222753 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
HOXA13-201ENST00000222753 MCM5P33992 734 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXA13-201ENST00000222753 MAPKBP1O60336 1514 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXA13-201ENST00000222753 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
HOXA13-201ENST00000222753 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
HOXA13-201ENST00000222753 ERICH2A1L162 156 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXA13-201ENST00000222753 SYCE3A1L190 88 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXA13-201ENST00000222753 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
HOXA13-201ENST00000222753 CDR1P51861 262 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXA13-201ENST00000222753 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXA13-201ENST00000222753 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXA13-201ENST00000222753 RIC3Q7Z5B4 369 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXA13-201ENST00000222753 PDILTQ8N807 584 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXA13-201ENST00000222753 EVA1CP58658 441 aa22.1■■□□□ 1.13
HOXA13-201ENST00000222753 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
HOXA13-201ENST00000222753 NUP62CLQ9H1M0 184 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXA13-201ENST00000222753 ABCC5O15440 1437 aa22.09■■□□□ 1.13
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