RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000222753.5

HOXA13-201, Transcript of homeobox A13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXA13, Length 5,030 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13-201ENST00000222753 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
HOXA13-201ENST00000222753 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
HOXA13-201ENST00000222753 TRDNQ13061 729 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXA13-201ENST00000222753 CCDC192P0DO97 292 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXA13-201ENST00000222753 SDF4Q9BRK5 362 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXA13-201ENST00000222753 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
HOXA13-201ENST00000222753 NECTIN2Q92692 538 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXA13-201ENST00000222753 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXA13-201ENST00000222753 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
HOXA13-201ENST00000222753 ARHGAP5Q13017 1502 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXA13-201ENST00000222753 CCP110O43303 1012 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXA13-201ENST00000222753 HSP90B2PQ58FF3 399 aa22.27■■□□□ 1.16
HOXA13-201ENST00000222753 C1orf115Q9H7X2 142 aa22.27■■□□□ 1.16
HOXA13-201ENST00000222753 HIP1O00291 1037 aa22.27■■□□□ 1.16
HOXA13-201ENST00000222753 FIBPO43427 364 aa22.27■■□□□ 1.16
HOXA13-201ENST00000222753 AEBP1Q8IUX7 1158 aa22.27■■□□□ 1.16
HOXA13-201ENST00000222753 CLSTN1O94985 981 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXA13-201ENST00000222753 TMEM132EQ6IEE7 984 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXA13-201ENST00000222753 IFT140Q96RY7 1462 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXA13-201ENST00000222753 GNAI2P04899 355 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXA13-201ENST00000222753 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
HOXA13-201ENST00000222753 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
HOXA13-201ENST00000222753 KINO60870 393 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
HOXA13-201ENST00000222753 CCDC27Q2M243 656 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXA13-201ENST00000222753 C20orf194Q5TEA3 1177 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXA13-201ENST00000222753 CCDC30Q5VVM6 783 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXA13-201ENST00000222753 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXA13-201ENST00000222753 SURF6O75683 361 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
HOXA13-201ENST00000222753 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
HOXA13-201ENST00000222753 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
HOXA13-201ENST00000222753 OLFM4Q6UX06 510 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXA13-201ENST00000222753 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
HOXA13-201ENST00000222753 CCT4P50991 539 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
HOXA13-201ENST00000222753 TBC1D2Q9BYX2 928 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXA13-201ENST00000222753 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP22.22■■□□□ 1.15
HOXA13-201ENST00000222753 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXA13-201ENST00000222753 CCDC112Q8NEF3 446 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXA13-201ENST00000222753 TTC5Q8N0Z6 440 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXA13-201ENST00000222753 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
HOXA13-201ENST00000222753 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
HOXA13-201ENST00000222753 CEP89Q96ST8 783 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXA13-201ENST00000222753 RARSP54136 660 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.15
HOXA13-201ENST00000222753 GAS2L2Q8NHY3 880 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXA13-201ENST00000222753 KRT85P78386 507 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXA13-201ENST00000222753 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
HOXA13-201ENST00000222753 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXA13-201ENST00000222753 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
HOXA13-201ENST00000222753 LRRCC1Q9C099 1032 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXA13-201ENST00000222753 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
HOXA13-201ENST00000222753 FSD1Q9BTV5 496 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXA13-201ENST00000222753 ANKRD1Q15327 319 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXA13-201ENST00000222753 FBXW7Q969H0 707 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXA13-201ENST00000222753 AK7Q96M32 723 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXA13-201ENST00000222753 DUSP27Q5VZP5 1158 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXA13-201ENST00000222753 SKAP1Q86WV1 359 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXA13-201ENST00000222753 ERC1Q8IUD2 1116 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXA13-201ENST00000222753 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
HOXA13-201ENST00000222753 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXA13-201ENST00000222753 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
HOXA13-201ENST00000222753 MARCH6O60337 910 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXA13-201ENST00000222753 SPC24Q8NBT2 197 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXA13-201ENST00000222753 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
HOXA13-201ENST00000222753 TMEM57Q8N5G2 664 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXA13-201ENST00000222753 PDCL3Q9H2J4 239 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXA13-201ENST00000222753 TNMDQ9H2S6 317 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXA13-201ENST00000222753 APPP05067 770 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXA13-201ENST00000222753 PDCL2Q8N4E4 241 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXA13-201ENST00000222753 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
HOXA13-201ENST00000222753 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXA13-201ENST00000222753 PSME1Q06323 249 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXA13-201ENST00000222753 FCHSD2O94868 740 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXA13-201ENST00000222753 NFXL1Q6ZNB6 911 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXA13-201ENST00000222753 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
HOXA13-201ENST00000222753 RUFY1Q96T51 708 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXA13-201ENST00000222753 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
HOXA13-201ENST00000222753 SMC2O95347 1197 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXA13-201ENST00000222753 ABCC11Q96J66 1382 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXA13-201ENST00000222753 SLC4A2P04920 1241 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXA13-201ENST00000222753 TMPOP42166 694 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
HOXA13-201ENST00000222753 FOSBP53539 338 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXA13-201ENST00000222753 GPRASP1Q5JY77 1395 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXA13-201ENST00000222753 ALDH1L2Q3SY69 923 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXA13-201ENST00000222753 TBC1D32Q96NH3 1257 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXA13-201ENST00000222753 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
HOXA13-201ENST00000222753 MCM5P33992 734 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXA13-201ENST00000222753 MAPKBP1O60336 1514 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXA13-201ENST00000222753 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
HOXA13-201ENST00000222753 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
HOXA13-201ENST00000222753 ERICH2A1L162 156 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXA13-201ENST00000222753 SYCE3A1L190 88 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXA13-201ENST00000222753 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
HOXA13-201ENST00000222753 CDR1P51861 262 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXA13-201ENST00000222753 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXA13-201ENST00000222753 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXA13-201ENST00000222753 RIC3Q7Z5B4 369 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXA13-201ENST00000222753 PDILTQ8N807 584 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXA13-201ENST00000222753 EVA1CP58658 441 aa22.1■■□□□ 1.13
HOXA13-201ENST00000222753 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
HOXA13-201ENST00000222753 NUP62CLQ9H1M0 184 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXA13-201ENST00000222753 ABCC5O15440 1437 aa22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.7 ms