RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216840.10

RABGGTA-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTA, Length 2,088 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-201ENST00000216840 SLFN5Q08AF3 891 aa22.71■■□□□ 1.23
RABGGTA-201ENST00000216840 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
RABGGTA-201ENST00000216840 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
RABGGTA-201ENST00000216840 PNPLA6Q8IY17 1366 aa22.69■■□□□ 1.22
RABGGTA-201ENST00000216840 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
RABGGTA-201ENST00000216840 PIK3R4Q99570 1358 aa22.68■■□□□ 1.22
RABGGTA-201ENST00000216840 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
RABGGTA-201ENST00000216840 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP22.67■■□□□ 1.22
RABGGTA-201ENST00000216840 NME9Q86XW9 330 aa22.67■■□□□ 1.22
RABGGTA-201ENST00000216840 TCP11L2Q8N4U5 519 aa22.67■■□□□ 1.22
RABGGTA-201ENST00000216840 NRKQ7Z2Y5 1582 aa22.66■■□□□ 1.22
RABGGTA-201ENST00000216840 PLEKHG3A1L390 1219 aa22.66■■□□□ 1.22
RABGGTA-201ENST00000216840 ANKLE2Q86XL3 938 aa22.66■■□□□ 1.22
RABGGTA-201ENST00000216840 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
RABGGTA-201ENST00000216840 WWC1Q8IX03 1113 aa22.66■■□□□ 1.22
RABGGTA-201ENST00000216840 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
RABGGTA-201ENST00000216840 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa22.65■■□□□ 1.22
RABGGTA-201ENST00000216840 POLKQ9UBT6 870 aa22.64■■□□□ 1.22
RABGGTA-201ENST00000216840 DMRT2Q9Y5R5 561 aa22.64■■□□□ 1.22
RABGGTA-201ENST00000216840 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
RABGGTA-201ENST00000216840 NUTM2FA1L443 756 aa22.64■■□□□ 1.21
RABGGTA-201ENST00000216840 E9PSI1 815 aa22.64■■□□□ 1.21
RABGGTA-201ENST00000216840 ZRANB1Q9UGI0 708 aa22.64■■□□□ 1.21
RABGGTA-201ENST00000216840 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
RABGGTA-201ENST00000216840 ACEP12821 1306 aa22.63■■□□□ 1.21
RABGGTA-201ENST00000216840 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
RABGGTA-201ENST00000216840 KCNA6P17658 529 aa22.62■■□□□ 1.21
RABGGTA-201ENST00000216840 FBLN1P23142 703 aa22.62■■□□□ 1.21
RABGGTA-201ENST00000216840 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
RABGGTA-201ENST00000216840 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
RABGGTA-201ENST00000216840 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
RABGGTA-201ENST00000216840 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
RABGGTA-201ENST00000216840 AATKQ6ZMQ8 1374 aa22.61■■□□□ 1.21
RABGGTA-201ENST00000216840 NEUROD2Q15784 382 aa22.61■■□□□ 1.21
RABGGTA-201ENST00000216840 CCDC27Q2M243 656 aa22.6■■□□□ 1.21
RABGGTA-201ENST00000216840 COG3Q96JB2 828 aa22.6■■□□□ 1.21
RABGGTA-201ENST00000216840 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa22.6■■□□□ 1.21
RABGGTA-201ENST00000216840 PLEKHF1Q96S99 279 aa22.59■■□□□ 1.21
RABGGTA-201ENST00000216840 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa22.59■■□□□ 1.21
RABGGTA-201ENST00000216840 USP6P35125 1406 aa22.59■■□□□ 1.21
RABGGTA-201ENST00000216840 PLIN1O60240 522 aa22.57■■□□□ 1.2
RABGGTA-201ENST00000216840 FMN2Q9NZ56 1722 aa22.57■■□□□ 1.2
RABGGTA-201ENST00000216840 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
RABGGTA-201ENST00000216840 WDR63Q8IWG1 891 aa22.56■■□□□ 1.2
RABGGTA-201ENST00000216840 EXOC6Q8TAG9 804 aa22.56■■□□□ 1.2
RABGGTA-201ENST00000216840 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
RABGGTA-201ENST00000216840 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa22.56■■□□□ 1.2
RABGGTA-201ENST00000216840 SSH2Q76I76 1423 aa22.56■■□□□ 1.2
RABGGTA-201ENST00000216840 ANKARQ7Z5J8 1434 aa22.54■■□□□ 1.2
RABGGTA-201ENST00000216840 NALCNQ8IZF0 1738 aa22.54■■□□□ 1.2
RABGGTA-201ENST00000216840 CCDC136Q96JN2 1154 aa22.53■■□□□ 1.2
RABGGTA-201ENST00000216840 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa22.53■■□□□ 1.2
RABGGTA-201ENST00000216840 OVOS2Q6IE36 1432 aa22.53■■□□□ 1.2
RABGGTA-201ENST00000216840 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa22.53■■□□□ 1.2
RABGGTA-201ENST00000216840 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
RABGGTA-201ENST00000216840 LRRC7Q96NW7 1537 aa22.52■■□□□ 1.2
RABGGTA-201ENST00000216840 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa22.52■■□□□ 1.19
RABGGTA-201ENST00000216840 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
RABGGTA-201ENST00000216840 TMPOP42166 694 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
RABGGTA-201ENST00000216840 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
RABGGTA-201ENST00000216840 FCHSD2O94868 740 aa22.5■■□□□ 1.19
RABGGTA-201ENST00000216840 IL13P35225 146 aa22.5■■□□□ 1.19
RABGGTA-201ENST00000216840 TTC21AQ8NDW8 1320 aa22.49■■□□□ 1.19
RABGGTA-201ENST00000216840 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
RABGGTA-201ENST00000216840 RSPH6AQ9H0K4 717 aa22.48■■□□□ 1.19
RABGGTA-201ENST00000216840 CRBNQ96SW2 442 aa22.47■■□□□ 1.19
RABGGTA-201ENST00000216840 TRIM35Q9UPQ4 493 aa22.47■■□□□ 1.19
RABGGTA-201ENST00000216840 USP31Q70CQ4 1352 aa22.47■■□□□ 1.19
RABGGTA-201ENST00000216840 C20orf194Q5TEA3 1177 aa22.46■■□□□ 1.19
RABGGTA-201ENST00000216840 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
RABGGTA-201ENST00000216840 PRKAR2BP31323 418 aa22.45■■□□□ 1.18
RABGGTA-201ENST00000216840 PIK3C2AO00443 1686 aa22.44■■□□□ 1.18
RABGGTA-201ENST00000216840 PEAK1Q9H792 1746 aa22.44■■□□□ 1.18
RABGGTA-201ENST00000216840 BCAR3O75815 825 aa22.43■■□□□ 1.18
RABGGTA-201ENST00000216840 MYH16Q9H6N6 1097 aa22.43■■□□□ 1.18
RABGGTA-201ENST00000216840 RIPK4P57078 832 aa22.43■■□□□ 1.18
RABGGTA-201ENST00000216840 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa22.43■■□□□ 1.18
RABGGTA-201ENST00000216840 HMOX1P09601 288 aa22.42■■□□□ 1.18
RABGGTA-201ENST00000216840 NWD1Q149M9 1564 aa22.41■■□□□ 1.18
RABGGTA-201ENST00000216840 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
RABGGTA-201ENST00000216840 IL16Q14005 1332 aa22.39■■□□□ 1.18
RABGGTA-201ENST00000216840 NEFMP07197 916 aa22.39■■□□□ 1.17
RABGGTA-201ENST00000216840 PHACTR3Q96KR7 559 aa22.39■■□□□ 1.17
RABGGTA-201ENST00000216840 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
RABGGTA-201ENST00000216840 USP54Q70EL1 1684 aa22.39■■□□□ 1.17
RABGGTA-201ENST00000216840 FANCIQ9NVI1 1328 aa22.37■■□□□ 1.17
RABGGTA-201ENST00000216840 RARSP54136 660 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
RABGGTA-201ENST00000216840 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
RABGGTA-201ENST00000216840 NFE2L2Q16236 605 aa22.37■■□□□ 1.17
RABGGTA-201ENST00000216840 PHF8Q9UPP1 1060 aa22.36■■□□□ 1.17
RABGGTA-201ENST00000216840 DLG5Q8TDM6 1919 aa22.35■■□□□ 1.17
RABGGTA-201ENST00000216840 RGPD1P0DJD0 1748 aa22.35■■□□□ 1.17
RABGGTA-201ENST00000216840 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
RABGGTA-201ENST00000216840 SOX12O15370 315 aa22.34■■□□□ 1.17
RABGGTA-201ENST00000216840 MAP3K19Q56UN5 1328 aa22.34■■□□□ 1.17
RABGGTA-201ENST00000216840 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa22.33■■□□□ 1.17
RABGGTA-201ENST00000216840 NLRP6P59044 892 aa22.32■■□□□ 1.16
RABGGTA-201ENST00000216840 SBNO1A3KN83 1393 aa22.32■■□□□ 1.16
RABGGTA-201ENST00000216840 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
RABGGTA-201ENST00000216840 PDE3AQ14432 1141 aa22.3■■□□□ 1.16
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