RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000049074.12

Ptprf-201, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene Ptprf, Length 7,656 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Nlrp3Q8R4B8 1033 aa21.01■□□□□ 0.95
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Polr1aO35134 1717 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Becn1O88597 448 aa21■□□□□ 0.95
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Nup133Q8R0G9 1155 aa21■□□□□ 0.95
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Cyp46a1Q9WVK8 500 aa21■□□□□ 0.95
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ccdc30Q8BVF4 654 aa21■□□□□ 0.95
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Cd109Q8R422 1442 aa21■□□□□ 0.95
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Cspp1B2RX88 1205 aa20.99■□□□□ 0.95
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gpatch3Q8BIY1 525 aa20.99■□□□□ 0.95
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Rpgrip1lQ8CG73 1264 aa20.99■□□□□ 0.95
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Tom1O88746 492 aa20.99■□□□□ 0.95
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Galntl5Q9D4M9 431 aa20.99■□□□□ 0.95
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Babam1Q3UI43 333 aa20.98■□□□□ 0.95
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gm14025A2AP89 1413 aa20.97■□□□□ 0.95
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Dhx8A2A4P0 1244 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Cfap99A0A140LIX9 648 aa20.97■□□□□ 0.95
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ncbp1Q3UYV9 790 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Rbm26Q6NZN0 1012 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
Ptprf-201ENSMUST00000049074 PsapQ61207 557 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
Ptprf-201ENSMUST00000049074 PogkQ80TC5 607 aa20.96■□□□□ 0.95
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Pdcl3Q8BVF2 240 aa20.96■□□□□ 0.95
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gigyf1Q99MR1 1044 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.95
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ca8P28651 291 aa20.95■□□□□ 0.94
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Nsfl1cQ9CZ44 370 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gm10563F6WIE4 79 aa20.95■□□□□ 0.94
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Trim58Q5NCC9 485 aa20.95■□□□□ 0.94
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Plekhg5Q66T02 1073 aa20.95■□□□□ 0.94
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ipo9Q91YE6 1041 aa20.94■□□□□ 0.94
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ccdc141E9Q8Q6 1531 aa20.94■□□□□ 0.94
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Map7d2A2AG50 781 aa20.93■□□□□ 0.94
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Dusp9Q7TNL7 452 aa20.93■□□□□ 0.94
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Cwc27Q3TKY6 469 aa20.93■□□□□ 0.94
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Smg6P61406 1418 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Tnnt2P50752 301 aa20.93■□□□□ 0.94
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Nek4Q9Z1J2 792 aa20.93■□□□□ 0.94
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Rai14Q9EP71 979 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Frat2Q8K025 231 aa20.92■□□□□ 0.94
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ankrd13dQ6PD24 605 aa20.91■□□□□ 0.94
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Q3UJC8 639 aa20.91■□□□□ 0.94
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Fkbp5Q64378 456 aa20.91■□□□□ 0.94
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Vps37dQ810I0 261 aa20.91■□□□□ 0.94
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ccdc155Q80VJ8 648 aa20.9■□□□□ 0.94
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Necab1Q8BG18 352 aa20.9■□□□□ 0.94
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Eif3bQ8JZQ9 803 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Cux1P53564 1515 aa20.9■□□□□ 0.94
Ptprf-201ENSMUST00000049074 OptnQ8K3K8 584 aa20.9■□□□□ 0.94
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Rrs1Q9CYH6 365 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Smarca2Q6DIC0 1577 aa20.89■□□□□ 0.94
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Kif20aP97329 887 aa20.89■□□□□ 0.94
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gnai2P08752 355 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Slc5a1Q8C3K6 665 aa20.89■□□□□ 0.93
Ptprf-201ENSMUST00000049074 IbspQ61711 324 aa20.89■□□□□ 0.93
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Erc1Q99MI1 1120 aa20.89■□□□□ 0.93
Ptprf-201ENSMUST00000049074 HmmrQ00547 794 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Psma5Q9Z2U1 241 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Kdm2bQ6P1G2 1309 aa20.89■□□□□ 0.93
Ptprf-201ENSMUST00000049074 VgfQ0VGU4 617 aa20.88■□□□□ 0.93
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Duox2A2AQ99 1517 aa20.88■□□□□ 0.93
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Znf219Q6IQX8 726 aa20.88■□□□□ 0.93
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Mrc2Q64449 1479 aa20.88■□□□□ 0.93
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Rnf216P58283 853 aa20.87■□□□□ 0.93
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Igf2bp2Q5SF07 592 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
Ptprf-201ENSMUST00000049074 InsrP15208 1372 aa20.86■□□□□ 0.93
Ptprf-201ENSMUST00000049074 IncenpQ9WU62 880 aa20.86■□□□□ 0.93
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gm7298A0A0N4SVU1 1476 aa20.86■□□□□ 0.93
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Exoc5Q3TPX4 708 aa20.86■□□□□ 0.93
Ptprf-201ENSMUST00000049074 PalmQ9Z0P4 383 aa20.86■□□□□ 0.93
Ptprf-201ENSMUST00000049074 KarsQ99MN1 595 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Smc2Q8CG48 1191 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Spty2d1Q68FG3 682 aa20.85■□□□□ 0.93
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Polr3dQ91WD1 398 aa20.85■□□□□ 0.93
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Tnni2P13412 182 aa20.84■□□□□ 0.93
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Cavin4A2AMM0 362 aa20.84■□□□□ 0.93
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Q7TT23 1179 aa20.84■□□□□ 0.93
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Jmjd4Q8BFT6 427 aa20.84■□□□□ 0.93
Ptprf-201ENSMUST00000049074 NaspQ99MD9 773 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ano8Q6PB70 1060 aa20.83■□□□□ 0.93
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ak7Q9D2H2 614 aa20.83■□□□□ 0.93
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Znf18Q810A1 556 aa20.83■□□□□ 0.92
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ssr1Q9CY50 286 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Crybg2B7ZCC2 1516 aa20.82■□□□□ 0.92
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Nphp1Q9QY53 687 aa20.82■□□□□ 0.92
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Kiaa1211Q5PR69 1207 aa20.81■□□□□ 0.92
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Srgap3Q812A2 1099 aa20.81■□□□□ 0.92
Ptprf-201ENSMUST00000049074 CadpsQ80TJ1 1355 aa20.81■□□□□ 0.92
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ltv1Q6NSQ7 470 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Tut1Q8R3F9 869 aa20.81■□□□□ 0.92
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gcom1E9PZ54 550 aa20.81■□□□□ 0.92
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gsdma2Q32M21 443 aa20.81■□□□□ 0.92
Ptprf-201ENSMUST00000049074 MyzapQ3UIJ9 466 aa20.81■□□□□ 0.92
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ttll12Q3UDE2 639 aa20.8■□□□□ 0.92
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Farp2Q91VS8 1065 aa20.8■□□□□ 0.92
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Dixdc1Q80Y83 711 aa20.79■□□□□ 0.92
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Kif16bB1AVY7 1312 aa20.79■□□□□ 0.92
Ptprf-201ENSMUST00000049074 TrhQ62361 256 aa20.79■□□□□ 0.92
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Washc2Q6PGL7 1334 aa20.79■□□□□ 0.92
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Lrrfip2Q91WK0 415 aa20.78■□□□□ 0.92
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Nol7Q9D7Z3 254 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Smarcc1P97496 1104 aa20.78■□□□□ 0.92
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Slf2Q6P9P0 1278 aa20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 13.1 ms