RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431405.1

USP9YP31-201, Transcript of USP9Y pseudogene 31, humanhuman

BASIC

Gene USP9YP31, Length 881 nt, Biotype unprocessed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9YP31-201ENST00000431405 ZNF804AQ7Z570 1209 aa4.87□□□□□ -1.63
USP9YP31-201ENST00000431405 TTC30AQ86WT1 665 aa4.87□□□□□ -1.63
USP9YP31-201ENST00000431405 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
USP9YP31-201ENST00000431405 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
USP9YP31-201ENST00000431405 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa4.87□□□□□ -1.63
USP9YP31-201ENST00000431405 WDR60Q8WVS4 1066 aa4.87□□□□□ -1.63
USP9YP31-201ENST00000431405 OVCA2Q8WZ82 227 aa4.87□□□□□ -1.63
USP9YP31-201ENST00000431405 SCLT1Q96NL6 688 aa4.87□□□□□ -1.63
USP9YP31-201ENST00000431405 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
USP9YP31-201ENST00000431405 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
USP9YP31-201ENST00000431405 USP29Q9HBJ7 922 aa4.87□□□□□ -1.63
USP9YP31-201ENST00000431405 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
USP9YP31-201ENST00000431405 ABHD10Q9NUJ1 306 aa4.87□□□□□ -1.63
USP9YP31-201ENST00000431405 FBXO28Q9NVF7 368 aa4.87□□□□□ -1.63
USP9YP31-201ENST00000431405 FZD4Q9ULV1 537 aa4.87□□□□□ -1.63
USP9YP31-201ENST00000431405 VPS4AQ9UN37 437 aa4.87□□□□□ -1.63
USP9YP31-201ENST00000431405 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa4.87□□□□□ -1.63
USP9YP31-201ENST00000431405 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
USP9YP31-201ENST00000431405 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
USP9YP31-201ENST00000431405 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
USP9YP31-201ENST00000431405 RIMS2Q9UQ26 1411 aa4.87□□□□□ -1.63
USP9YP31-201ENST00000431405 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
USP9YP31-201ENST00000431405 CDK4P11802 303 aa4.86□□□□□ -1.63
USP9YP31-201ENST00000431405 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
USP9YP31-201ENST00000431405 POLE2P56282 527 aa4.86□□□□□ -1.63
USP9YP31-201ENST00000431405 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
USP9YP31-201ENST00000431405 CCDC15Q0P6D6 951 aa4.86□□□□□ -1.63
USP9YP31-201ENST00000431405 GAB1Q13480 694 aa4.86□□□□□ -1.63
USP9YP31-201ENST00000431405 FAM153CQ494X1 144 aa4.86□□□□□ -1.63
USP9YP31-201ENST00000431405 AKNAD1Q5T1N1 836 aa4.86□□□□□ -1.63
USP9YP31-201ENST00000431405 CEP85Q6P2H3 762 aa4.86□□□□□ -1.63
USP9YP31-201ENST00000431405 ACSM6Q6P461 480 aa4.86□□□□□ -1.63
USP9YP31-201ENST00000431405 TRIM72Q6ZMU5 477 aa4.86□□□□□ -1.63
USP9YP31-201ENST00000431405 RAB11FIP2Q7L804 512 aa4.86□□□□□ -1.63
USP9YP31-201ENST00000431405 ARHGEF25Q86VW2 580 aa4.86□□□□□ -1.63
USP9YP31-201ENST00000431405 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
USP9YP31-201ENST00000431405 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
USP9YP31-201ENST00000431405 OR52L2PQ8NGH6 319 aa4.86□□□□□ -1.63
USP9YP31-201ENST00000431405 CAGE1Q8TC20 777 aa4.86□□□□□ -1.63
USP9YP31-201ENST00000431405 HMGB4Q8WW32 186 aa4.86□□□□□ -1.63
USP9YP31-201ENST00000431405 RUBCNQ92622 972 aa4.86□□□□□ -1.63
USP9YP31-201ENST00000431405 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa4.86□□□□□ -1.63
USP9YP31-201ENST00000431405 FAM167BQ9BTA0 163 aa4.86□□□□□ -1.63
USP9YP31-201ENST00000431405 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa4.86□□□□□ -1.63
USP9YP31-201ENST00000431405 CDCP1Q9H5V8 836 aa4.86□□□□□ -1.63
USP9YP31-201ENST00000431405 CCDC134Q9H6E4 229 aa4.86□□□□□ -1.63
USP9YP31-201ENST00000431405 SH3BP4Q9P0V3 963 aa4.86□□□□□ -1.63
USP9YP31-201ENST00000431405 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
USP9YP31-201ENST00000431405 KCND3Q9UK17 655 aa4.86□□□□□ -1.63
USP9YP31-201ENST00000431405 FEM1BQ9UK73 627 aa4.86□□□□□ -1.63
USP9YP31-201ENST00000431405 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
USP9YP31-201ENST00000431405 NRAPQ86VF7 1730 aa4.86□□□□□ -1.63
USP9YP31-201ENST00000431405 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
USP9YP31-201ENST00000431405 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
USP9YP31-201ENST00000431405 CCDC189A1A4V9 331 aa4.85□□□□□ -1.63
USP9YP31-201ENST00000431405 LRRC3CA6NJW4 275 aa4.85□□□□□ -1.63
USP9YP31-201ENST00000431405 TARM1B6A8C7 271 aa4.85□□□□□ -1.63
USP9YP31-201ENST00000431405 FYB1O15117 783 aa4.85□□□□□ -1.63
USP9YP31-201ENST00000431405 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
USP9YP31-201ENST00000431405 JAK3P52333 1124 aa4.85□□□□□ -1.63
USP9YP31-201ENST00000431405 ARL4CP56559 192 aa4.85□□□□□ -1.63
USP9YP31-201ENST00000431405 FOXL2P58012 376 aa4.85□□□□□ -1.63
USP9YP31-201ENST00000431405 RPL15P61313 204 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
USP9YP31-201ENST00000431405 CFHR3Q02985 330 aa4.85□□□□□ -1.63
USP9YP31-201ENST00000431405 PPFIA1Q13136 1202 aa4.85□□□□□ -1.63
USP9YP31-201ENST00000431405 BIRC3Q13489 604 aa4.85□□□□□ -1.63
USP9YP31-201ENST00000431405 ANKRD40Q6AI12 368 aa4.85□□□□□ -1.63
USP9YP31-201ENST00000431405 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
USP9YP31-201ENST00000431405 RFX8Q6ZV50 586 aa4.85□□□□□ -1.63
USP9YP31-201ENST00000431405 CPXCR1Q8N123 301 aa4.85□□□□□ -1.63
USP9YP31-201ENST00000431405 FAM71DQ8N9W8 422 aa4.85□□□□□ -1.63
USP9YP31-201ENST00000431405 SPPL3Q8TCT6 385 aa4.85□□□□□ -1.63
USP9YP31-201ENST00000431405 THAP4Q8WY91 577 aa4.85□□□□□ -1.63
USP9YP31-201ENST00000431405 C3orf49Q96BT1 292 aa4.85□□□□□ -1.63
USP9YP31-201ENST00000431405 EVI5LQ96CN4 794 aa4.85□□□□□ -1.63
USP9YP31-201ENST00000431405 GCC1Q96CN9 775 aa4.85□□□□□ -1.63
USP9YP31-201ENST00000431405 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
USP9YP31-201ENST00000431405 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
USP9YP31-201ENST00000431405 ELOVL1Q9BW60 279 aa4.85□□□□□ -1.63
USP9YP31-201ENST00000431405 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
USP9YP31-201ENST00000431405 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa4.85□□□□□ -1.63
USP9YP31-201ENST00000431405 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
USP9YP31-201ENST00000431405 SAYSD1Q9NPB0 183 aa4.85□□□□□ -1.63
USP9YP31-201ENST00000431405 G6PC2Q9NQR9 355 aa4.85□□□□□ -1.63
USP9YP31-201ENST00000431405 SEMA4GQ9NTN9 838 aa4.85□□□□□ -1.63
USP9YP31-201ENST00000431405 SEMA5BQ9P283 1151 aa4.85□□□□□ -1.63
USP9YP31-201ENST00000431405 RAB21Q9UL25 225 aa4.85□□□□□ -1.63
USP9YP31-201ENST00000431405 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
USP9YP31-201ENST00000431405 RCE1Q9Y256 329 aa4.85□□□□□ -1.63
USP9YP31-201ENST00000431405 PRAG1Q86YV5 1406 aa4.85□□□□□ -1.63
USP9YP31-201ENST00000431405 TULP4Q9NRJ4 1543 aa4.85□□□□□ -1.63
USP9YP31-201ENST00000431405 CUL9Q8IWT3 2517 aa4.84□□□□□ -1.63
USP9YP31-201ENST00000431405 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
USP9YP31-201ENST00000431405 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa4.84□□□□□ -1.63
USP9YP31-201ENST00000431405 C16orf96A6NNT2 1141 aa4.84□□□□□ -1.63
USP9YP31-201ENST00000431405 NKX2-8O15522 239 aa4.84□□□□□ -1.63
USP9YP31-201ENST00000431405 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
USP9YP31-201ENST00000431405 KAT7O95251 611 aa4.84□□□□□ -1.63
USP9YP31-201ENST00000431405 MT-CO3P00414 261 aa4.84□□□□□ -1.63
USP9YP31-201ENST00000431405 C1RP00736 705 aa4.84□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 93.2 ms