RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421750.1

TRAPPC2P4-201, Transcript of trafficking protein particle complex 2 pseudogene 4, humanhuman

BASIC

Gene TRAPPC2P4, Length 331 nt, Biotype unprocessed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 PALD1Q9ULE6 856 aa3.61□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 AURKCQ9UQB9 309 aa3.61□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 LIPT1Q9Y234 373 aa3.61□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 SIT1Q9Y3P8 196 aa3.61□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa3.61□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa3.61□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa3.61□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 CCDC187A0A096LP49 1063 aa3.6□□□□□ -1.83
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TRAPPC2P4-201ENST00000421750 GAGE10A6NGK3 116 aa3.6□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 AQP7P3A6NL99 342 aa3.6□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 N4BP3O15049 544 aa3.6□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 RTN2O75298 545 aa3.6□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 TADA2AO75478 443 aa3.6□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 RASAL1O95294 804 aa3.6□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 LARGE1O95461 756 aa3.6□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 OPN1MWP04001 364 aa3.6□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 URODP06132 367 aa3.6□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 RB1P06400 928 aa3.6□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 OPN1MW2P0DN77 364 aa3.6□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 OPN1MW3P0DN78 364 aa3.6□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 GZMAP12544 262 aa3.6□□□□□ -1.83
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TRAPPC2P4-201ENST00000421750 TMEM11P17152 192 aa3.6□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 ERCC2P18074 760 aa3.6□□□□□ -1.83
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TRAPPC2P4-201ENST00000421750 YY1P25490 414 aa3.6□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 CD6P30203 668 aa3.6□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 SLC5A2P31639 672 aa3.6□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 GUCY1A2P33402 732 aa3.6□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 TTKP33981 857 aa3.6□□□□□ -1.83
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TRAPPC2P4-201ENST00000421750 THBS2P35442 1172 aa3.6□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 GPD2P43304 727 aa3.6□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 SLC15A1P46059 708 aa3.6□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 SLC6A11P48066 632 aa3.6□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 CDK7P50613 346 aa3.6□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 ZNF81P51508 661 aa3.6□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 BMXP51813 675 aa3.6□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 EPHB3P54753 998 aa3.6□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 MFAP4P55083 255 aa3.6□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 WNT3P56703 355 aa3.6□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 KCNJ10P78508 379 aa3.6□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 PLP2Q04941 152 aa3.6□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa3.6□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 LMAN2Q12907 356 aa3.6□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 BMPR2Q13873 1038 aa3.6□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 TUBB2AQ13885 445 aa3.6□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 CLCA4Q14CN2 919 aa3.6□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 ACAP1Q15027 740 aa3.6□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 PDK1Q15118 436 aa3.6□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 INAQ16352 499 aa3.6□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 DGKDQ16760 1214 aa3.6□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 MEP1BQ16820 701 aa3.6□□□□□ -1.83
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TRAPPC2P4-201ENST00000421750 CRY2Q49AN0 593 aa3.6□□□□□ -1.83
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TRAPPC2P4-201ENST00000421750 SLC39A12Q504Y0 691 aa3.6□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 HSP90B2PQ58FF3 399 aa3.6□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 COLEC12Q5KU26 742 aa3.6□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 SPDYAQ5MJ70 313 aa3.6□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 CACHD1Q5VU97 1274 aa3.6□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa3.6□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa3.6□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 TMEM270Q6UE05 265 aa3.6□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 C22orf34Q6ZV56 151 aa3.6□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 USP37Q86T82 979 aa3.6□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 KBTBD6Q86V97 674 aa3.6□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 HOOK3Q86VS8 718 aa3.6□□□□□ -1.83
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TRAPPC2P4-201ENST00000421750 RHPN2Q8IUC4 686 aa3.6□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 CNTN4Q8IWV2 1026 aa3.6□□□□□ -1.83
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TRAPPC2P4-201ENST00000421750 ZNF366Q8N895 744 aa3.6□□□□□ -1.83
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TRAPPC2P4-201ENST00000421750 TMEM116Q8NCL8 245 aa3.6□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 CNNM3Q8NE01 707 aa3.6□□□□□ -1.83
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TRAPPC2P4-201ENST00000421750 UBE2FQ969M7 185 aa3.6□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 CLMNQ96JQ2 1002 aa3.6□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 FAM227BQ96M60 508 aa3.6□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 GSDMAQ96QA5 445 aa3.6□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 TUBB2BQ9BVA1 445 aa3.6□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 CCDC106Q9BWC9 280 aa3.6□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 SLC5A7Q9GZV3 580 aa3.6□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 ABCG8Q9H221 673 aa3.6□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 DPH5Q9H2P9 285 aa3.6□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 CCDC134Q9H6E4 229 aa3.6□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa3.6□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 TLR9Q9NR96 1032 aa3.6□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
TRAPPC2P4-201ENST00000421750 ABCB8Q9NUT2 735 aa3.6□□□□□ -1.83
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