RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316939.2

GADD45GIP1-201, Transcript of GADD45G interacting protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GADD45GIP1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GNGT1P63211 74 aa22.45■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IGDCC3Q8IVU1 814 aa22.45■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa22.45■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa22.45■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 STK39Q9UEW8 545 aa22.45■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KCNK1O00180 336 aa22.44■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TLR5O60602 858 aa22.44■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 AVILO75366 819 aa22.44■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SEC24AO95486 1093 aa22.44■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 URODP06132 367 aa22.44■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RAB33AQ14088 237 aa22.44■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 AFMIDQ63HM1 303 aa22.44■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EXOC3L1Q86VI1 746 aa22.44■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MYRFLQ96LU7 910 aa22.44■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 YME1L1Q96TA2 773 aa22.44■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CSH1P0DML2 217 aa22.43■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CSH2P0DML3 217 aa22.43■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PSMB4P28070 264 aa22.43■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GUCY1A3Q02108 690 aa22.43■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MTM1Q13496 603 aa22.43■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KLHL38Q2WGJ6 581 aa22.43■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MS4A13Q5J8X5 152 aa22.43■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CAPN12Q6ZSI9 719 aa22.43■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 C14orf80Q86SX3 495 aa22.43■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TADA2BQ86TJ2 420 aa22.43■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MAML1Q92585 1016 aa22.43■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MAFFQ9ULX9 164 aa22.43■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ACTL7BQ9Y614 415 aa22.43■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa22.43■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GSTA2P09210 222 aa22.43■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCNCP24863 283 aa22.43■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NR1H3Q13133 447 aa22.43■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TEX44Q53QW1 395 aa22.43■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KLHDC10Q6PID8 442 aa22.43■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PID1Q7Z2X4 250 aa22.43■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NLRP14Q86W24 1093 aa22.43■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MIB1Q86YT6 1006 aa22.43■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LRRC49Q8IUZ0 686 aa22.43■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DHRS4Q9BTZ2 278 aa22.43■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CEP41Q9BYV8 373 aa22.43■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCSER2Q9H7U1 834 aa22.43■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DONSONQ9NYP3 566 aa22.43■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC12A8A0AV02 714 aa22.42■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa22.42■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LRRC31Q6UY01 552 aa22.42■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa22.42■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FBF1Q8TES7 1133 aa22.42■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SIGLEC10Q96LC7 697 aa22.42■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GBA3Q9H227 469 aa22.42■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 YIPF1Q9Y548 306 aa22.42■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RHOQP17081 205 aa22.41■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZBTB17Q13105 803 aa22.41■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZSCAN26Q16670 478 aa22.41■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NUGGCQ68CJ6 796 aa22.41■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LRRC8BQ6P9F7 803 aa22.41■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 OTOP2Q7RTS6 562 aa22.41■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CYP4X1Q8N118 509 aa22.41■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ATPAF2Q8N5M1 289 aa22.41■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa22.41■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CENPTQ96BT3 561 aa22.41■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP22.41■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ALPK3Q96L96 1907 aa22.41■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa22.4■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF840PA6NDX5 716 aa22.4■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa22.4■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LSP1P33241 339 aa22.4■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ALDH1A3P47895 512 aa22.4■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CREMQ03060 361 aa22.4■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 C16orf59Q7L2K0 433 aa22.4■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa22.4■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TEKT5Q96M29 485 aa22.4■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CYTH2Q99418 400 aa22.4■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GORASP1Q9BQQ3 440 aa22.4■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZYG11BQ9C0D3 744 aa22.4■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CYP4F11Q9HBI6 524 aa22.4■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TMEM248Q9NWD8 314 aa22.4■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DNMT3LQ9UJW3 386 aa22.4■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 VANGL2Q9ULK5 521 aa22.4■■□□□ 1.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SUN1O94901 812 aa22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 93.6 ms