RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368215.7

PTPRK-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRK, Length 4,651 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-206ENST00000368215 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 CERS2Q96G23 380 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 MAML3Q96JK9 1138 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 EGFL8Q99944 293 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 DUSP16Q9BY84 665 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 AURKCQ9UQB9 309 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 C5orf60A6NFR6 353 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP8.66□□□□□ -1.026e-7■□□□□ 9.8
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PTPRK-206ENST00000368215 XPAP23025 273 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 CD52P31358 61 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 OASLQ15646 514 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP8.66□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 SEL1L3Q68CR1 1132 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 CALML6Q8TD86 181 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 SERAC1Q96JX3 654 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 MUC3BQ9H195 1237 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 RNF39Q9H2S5 420 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 UGT1A7Q9HAW7 530 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 UGT1A10Q9HAW8 530 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 UGT1A8Q9HAW9 530 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 MAN1C1Q9NR34 630 aa8.66□□□□□ -1.02
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PTPRK-206ENST00000368215 SPTLC1O15269 473 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 ASMTLO95671 621 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 EDN1P05305 212 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 ZCCHC18P0CG32 403 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 GRIA1P42261 906 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 MPP2Q14168 576 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 MAP7Q14244 749 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 RBBP7Q16576 425 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 SLC25A52Q3SY17 297 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 GRTP1Q5TC63 336 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 SNX30Q5VWJ9 437 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 FAM35AQ86V20 835 aa8.65□□□□□ -1.02
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PTPRK-206ENST00000368215 SPATA6LQ8N4H0 392 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 WDTC1Q8N5D0 677 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 EFCAB3Q8N7B9 438 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 MYLPFQ96A32 169 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 TSPAN17Q96FV3 270 aa8.65□□□□□ -1.02
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PTPRK-206ENST00000368215 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 XYLT2Q9H1B5 865 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 CAB39LQ9H9S4 337 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 ARL8BQ9NVJ2 186 aa8.65□□□□□ -1.02
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PTPRK-206ENST00000368215 SHANK3Q9BYB0 1731 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 SUPT3HB4E1H0 165 aa8.65□□□□□ -1.02
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PTPRK-206ENST00000368215 LGR5O75473 907 aa8.65□□□□□ -1.02
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PTPRK-206ENST00000368215 ITGA2BP08514 1039 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
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PTPRK-206ENST00000368215 CNGA3Q16281 694 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 ACCSLQ4AC99 568 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 SPANXN3Q5MJ09 141 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 CERCAMQ5T4B2 595 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 MIPOL1Q8TD10 442 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 STK32AQ8WU08 396 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRK-206ENST00000368215 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
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PTPRK-206ENST00000368215 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.03
PTPRK-206ENST00000368215 MED21Q13503 144 aa8.65□□□□□ -1.03
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PTPRK-206ENST00000368215 TRIML2Q8N7C3 387 aa8.65□□□□□ -1.03
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PTPRK-206ENST00000368215 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.03
PTPRK-206ENST00000368215 TEKT4Q8WW24 435 aa8.65□□□□□ -1.03
PTPRK-206ENST00000368215 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.03
PTPRK-206ENST00000368215 SNX27Q96L92 541 aa8.65□□□□□ -1.03
PTPRK-206ENST00000368215 NMRAL1Q9HBL8 299 aa8.65□□□□□ -1.03
PTPRK-206ENST00000368215 TCF7L2Q9NQB0 619 aa8.65□□□□□ -1.03
PTPRK-206ENST00000368215 SAR1AQ9NR31 198 aa8.65□□□□□ -1.03
PTPRK-206ENST00000368215 FAM105AQ9NUU6 356 aa8.65□□□□□ -1.03
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