RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484581.6

VPS13A-211, Transcript of vacuolar protein sorting 13 homolog A, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VPS13A, Length 1,155 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS13A-211ENST00000484581 MMP8P22894 467 aa4.96□□□□□ -1.62
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VPS13A-211ENST00000484581 PCP4P48539 62 aa4.96□□□□□ -1.62
VPS13A-211ENST00000484581 RCAN1P53805 252 aa4.96□□□□□ -1.62
VPS13A-211ENST00000484581 RPL15P61313 204 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
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VPS13A-211ENST00000484581 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
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VPS13A-211ENST00000484581 ARMC6Q6NXE6 501 aa4.95□□□□□ -1.62
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VPS13A-211ENST00000484581 TPSD1Q9BZJ3 242 aa4.95□□□□□ -1.62
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VPS13A-211ENST00000484581 SYNCQ9H7C4 482 aa4.95□□□□□ -1.62
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VPS13A-211ENST00000484581 PDE11AQ9HCR9 933 aa4.95□□□□□ -1.62
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VPS13A-211ENST00000484581 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa4.95□□□□□ -1.62
VPS13A-211ENST00000484581 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
VPS13A-211ENST00000484581 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa4.95□□□□□ -1.62
VPS13A-211ENST00000484581 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa4.95□□□□□ -1.62
VPS13A-211ENST00000484581 NOX1Q9Y5S8 564 aa4.95□□□□□ -1.62
VPS13A-211ENST00000484581 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa4.95□□□□□ -1.62
VPS13A-211ENST00000484581 TRGV11A0A075B6L2 103 aa4.94□□□□□ -1.62
VPS13A-211ENST00000484581 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
VPS13A-211ENST00000484581 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
VPS13A-211ENST00000484581 GRXCR1A8MXD5 290 aa4.94□□□□□ -1.62
VPS13A-211ENST00000484581 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
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