RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423693.5

HDLBP-210, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-210ENST00000423693 BRMS1LQ5PSV4 323 aa13.45□□□□□ -0.26
HDLBP-210ENST00000423693 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa13.45□□□□□ -0.26
HDLBP-210ENST00000423693 MPP7Q5T2T1 576 aa13.45□□□□□ -0.26
HDLBP-210ENST00000423693 DCUN1D2Q6PH85 259 aa13.45□□□□□ -0.26
HDLBP-210ENST00000423693 BNIPLQ7Z465 357 aa13.45□□□□□ -0.26
HDLBP-210ENST00000423693 TMEM25Q86YD3 366 aa13.45□□□□□ -0.26
HDLBP-210ENST00000423693 TC2NQ8N9U0 490 aa13.45□□□□□ -0.26
HDLBP-210ENST00000423693 FLCNQ8NFG4 579 aa13.45□□□□□ -0.26
HDLBP-210ENST00000423693 PJA1Q8NG27 643 aa13.45□□□□□ -0.26
HDLBP-210ENST00000423693 TTC8Q8TAM2 541 aa13.45□□□□□ -0.26
HDLBP-210ENST00000423693 RXFP2Q8WXD0 754 aa13.45□□□□□ -0.26
HDLBP-210ENST00000423693 CD101Q93033 1021 aa13.45□□□□□ -0.26
HDLBP-210ENST00000423693 RNF34Q969K3 372 aa13.45□□□□□ -0.26
HDLBP-210ENST00000423693 CLDN23Q96B33 292 aa13.45□□□□□ -0.26
HDLBP-210ENST00000423693 CCDC42Q96M95 316 aa13.45□□□□□ -0.26
HDLBP-210ENST00000423693 PANX2Q96RD6 677 aa13.45□□□□□ -0.26
HDLBP-210ENST00000423693 P2RY13Q9BPV8 354 aa13.45□□□□□ -0.26
HDLBP-210ENST00000423693 DEF6Q9H4E7 631 aa13.45□□□□□ -0.26
HDLBP-210ENST00000423693 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa13.45□□□□□ -0.26
HDLBP-210ENST00000423693 A0A0A0MRY4 1105 aa13.44□□□□□ -0.26
HDLBP-210ENST00000423693 FAM170BA6NMN3 283 aa13.44□□□□□ -0.26
HDLBP-210ENST00000423693 GFRA2O00451 464 aa13.44□□□□□ -0.26
HDLBP-210ENST00000423693 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
HDLBP-210ENST00000423693 AKR1B10O60218 316 aa13.44□□□□□ -0.26
HDLBP-210ENST00000423693 ADCY5O95622 1261 aa13.44□□□□□ -0.26
HDLBP-210ENST00000423693 PENKP01210 267 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
HDLBP-210ENST00000423693 GPD1P21695 349 aa13.44□□□□□ -0.26
HDLBP-210ENST00000423693 DRD1P21728 446 aa13.44□□□□□ -0.26
HDLBP-210ENST00000423693 RDXP35241 583 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
HDLBP-210ENST00000423693 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
HDLBP-210ENST00000423693 RPS9P46781 194 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
HDLBP-210ENST00000423693 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
HDLBP-210ENST00000423693 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
HDLBP-210ENST00000423693 DEUP1Q05D60 604 aa13.44□□□□□ -0.26
HDLBP-210ENST00000423693 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP13.44□□□□□ -0.26
HDLBP-210ENST00000423693 NME3Q13232 169 aa13.44□□□□□ -0.26
HDLBP-210ENST00000423693 LRRC32Q14392 662 aa13.44□□□□□ -0.26
HDLBP-210ENST00000423693 ANO4Q32M45 955 aa13.44□□□□□ -0.26
HDLBP-210ENST00000423693 MPPE1Q53F39 396 aa13.44□□□□□ -0.26
HDLBP-210ENST00000423693 TMEM196Q5HYL7 178 aa13.44□□□□□ -0.26
HDLBP-210ENST00000423693 CCDC122Q5T0U0 273 aa13.44□□□□□ -0.26
HDLBP-210ENST00000423693 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
HDLBP-210ENST00000423693 NUDT18Q6ZVK8 323 aa13.44□□□□□ -0.26
HDLBP-210ENST00000423693 STRADAQ7RTN6 431 aa13.44□□□□□ -0.26
HDLBP-210ENST00000423693 ZNF687Q8N1G0 1237 aa13.44□□□□□ -0.26
HDLBP-210ENST00000423693 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
HDLBP-210ENST00000423693 FNIP1Q8TF40 1166 aa13.44□□□□□ -0.26
HDLBP-210ENST00000423693 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
HDLBP-210ENST00000423693 CHFRQ96EP1 664 aa13.44□□□□□ -0.26
HDLBP-210ENST00000423693 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
HDLBP-210ENST00000423693 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
HDLBP-210ENST00000423693 TBCBQ99426 244 aa13.44□□□□□ -0.26
HDLBP-210ENST00000423693 IER2Q9BTL4 223 aa13.44□□□□□ -0.26
HDLBP-210ENST00000423693 BBS2Q9BXC9 721 aa13.44□□□□□ -0.26
HDLBP-210ENST00000423693 SLC2A11Q9BYW1 496 aa13.44□□□□□ -0.26
HDLBP-210ENST00000423693 WDCPQ9H6R7 721 aa13.44□□□□□ -0.26
HDLBP-210ENST00000423693 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
HDLBP-210ENST00000423693 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
HDLBP-210ENST00000423693 NENFQ9UMX5 172 aa13.44□□□□□ -0.26
HDLBP-210ENST00000423693 MUC3AQ02505 3323 aa13.44□□□□□ -0.26
HDLBP-210ENST00000423693 F5P12259 2224 aa13.43□□□□□ -0.26
HDLBP-210ENST00000423693 FAM86C2PA6NEL3 165 aa13.43□□□□□ -0.26
HDLBP-210ENST00000423693 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa13.43□□□□□ -0.26
HDLBP-210ENST00000423693 CACNG3O60359 315 aa13.43□□□□□ -0.26
HDLBP-210ENST00000423693 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
HDLBP-210ENST00000423693 TYRP14679 529 aa13.43□□□□□ -0.26
HDLBP-210ENST00000423693 CD72P21854 359 aa13.43□□□□□ -0.26
HDLBP-210ENST00000423693 OPRD1P41143 372 aa13.43□□□□□ -0.26
HDLBP-210ENST00000423693 GALK1P51570 392 aa13.43□□□□□ -0.26
HDLBP-210ENST00000423693 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
HDLBP-210ENST00000423693 UBXN2BQ14CS0 331 aa13.43□□□□□ -0.26
HDLBP-210ENST00000423693 GAB4Q2WGN9 574 aa13.43□□□□□ -0.26
HDLBP-210ENST00000423693 CCDC14Q49A88 953 aa13.43□□□□□ -0.26
HDLBP-210ENST00000423693 FBXO43Q4G163 708 aa13.43□□□□□ -0.26
HDLBP-210ENST00000423693 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
HDLBP-210ENST00000423693 C10orf76Q5T2E6 689 aa13.43□□□□□ -0.26
HDLBP-210ENST00000423693 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
HDLBP-210ENST00000423693 TRNP1Q6NT89 227 aa13.43□□□□□ -0.26
HDLBP-210ENST00000423693 TXNDC11Q6PKC3 985 aa13.43□□□□□ -0.26
HDLBP-210ENST00000423693 TPGS1Q6ZTW0 290 aa13.43□□□□□ -0.26
HDLBP-210ENST00000423693 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa13.43□□□□□ -0.26
HDLBP-210ENST00000423693 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa13.43□□□□□ -0.26
HDLBP-210ENST00000423693 CCDC170Q8IYT3 715 aa13.43□□□□□ -0.26
HDLBP-210ENST00000423693 EMC1Q8N766 993 aa13.43□□□□□ -0.26
HDLBP-210ENST00000423693 JOSD2Q8TAC2 188 aa13.43□□□□□ -0.26
HDLBP-210ENST00000423693 ZNF653Q96CK0 615 aa13.43□□□□□ -0.26
HDLBP-210ENST00000423693 C1orf74Q96LT6 269 aa13.43□□□□□ -0.26
HDLBP-210ENST00000423693 CFAP57Q96MR6 1250 aa13.43□□□□□ -0.26
HDLBP-210ENST00000423693 MCEEQ96PE7 176 aa13.43□□□□□ -0.26
HDLBP-210ENST00000423693 PNKPQ96T60 521 aa13.43□□□□□ -0.26
HDLBP-210ENST00000423693 CHP1Q99653 195 aa13.43□□□□□ -0.26
HDLBP-210ENST00000423693 NCAPGQ9BPX3 1015 aa13.43□□□□□ -0.26
HDLBP-210ENST00000423693 CNPY3Q9BT09 278 aa13.43□□□□□ -0.26
HDLBP-210ENST00000423693 LRFN3Q9BTN0 628 aa13.43□□□□□ -0.26
HDLBP-210ENST00000423693 PIGVQ9NUD9 493 aa13.43□□□□□ -0.26
HDLBP-210ENST00000423693 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa13.43□□□□□ -0.26
HDLBP-210ENST00000423693 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa13.42□□□□□ -0.26
HDLBP-210ENST00000423693 FAM170AA1A519 330 aa13.42□□□□□ -0.26
HDLBP-210ENST00000423693 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
HDLBP-210ENST00000423693 TMEM191CA6NGB0 347 aa13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 129 ms