RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384139.1

RNU6-187P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 187, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-187P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-187P-201ENST00000384139 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa1.6□□□□□ -2.15
RNU6-187P-201ENST00000384139 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa1.6□□□□□ -2.15
RNU6-187P-201ENST00000384139 HAPLN4Q86UW8 402 aa1.6□□□□□ -2.15
RNU6-187P-201ENST00000384139 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP1.6□□□□□ -2.15
RNU6-187P-201ENST00000384139 ZNF248Q8NDW4 579 aa1.6□□□□□ -2.15
RNU6-187P-201ENST00000384139 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP1.6□□□□□ -2.15
RNU6-187P-201ENST00000384139 BPIFB1Q8TDL5 484 aa1.6□□□□□ -2.15
RNU6-187P-201ENST00000384139 FEM1CQ96JP0 617 aa1.6□□□□□ -2.15
RNU6-187P-201ENST00000384139 SENP7Q9BQF6 1050 aa1.6□□□□□ -2.15
RNU6-187P-201ENST00000384139 MESP1Q9BRJ9 268 aa1.6□□□□□ -2.15
RNU6-187P-201ENST00000384139 TTLL2Q9BWV7 592 aa1.6□□□□□ -2.15
RNU6-187P-201ENST00000384139 KANSL2Q9H9L4 492 aa1.6□□□□□ -2.15
RNU6-187P-201ENST00000384139 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP1.6□□□□□ -2.15
RNU6-187P-201ENST00000384139 OCIAD1Q9NX40 245 aa1.6□□□□□ -2.15
RNU6-187P-201ENST00000384139 ZSCAN32Q9NX65 697 aa1.6□□□□□ -2.15
RNU6-187P-201ENST00000384139 SEMA5BQ9P283 1151 aa1.6□□□□□ -2.15
RNU6-187P-201ENST00000384139 CPNE7Q9UBL6 633 aa1.6□□□□□ -2.15
RNU6-187P-201ENST00000384139 TMX2Q9Y320 296 aa1.6□□□□□ -2.15
RNU6-187P-201ENST00000384139 RHODO00212 210 aa1.59□□□□□ -2.15
RNU6-187P-201ENST00000384139 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP1.59□□□□□ -2.15
RNU6-187P-201ENST00000384139 CRYAAP02489 173 aa1.59□□□□□ -2.15
RNU6-187P-201ENST00000384139 ALDH4A1P30038 563 aa1.59□□□□□ -2.15
RNU6-187P-201ENST00000384139 ZP1P60852 638 aa1.59□□□□□ -2.15
RNU6-187P-201ENST00000384139 ST3GAL2Q16842 350 aa1.59□□□□□ -2.15
RNU6-187P-201ENST00000384139 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa1.59□□□□□ -2.15
RNU6-187P-201ENST00000384139 ASPHD1Q5U4P2 390 aa1.59□□□□□ -2.15
RNU6-187P-201ENST00000384139 DCAF12L2Q5VW00 463 aa1.59□□□□□ -2.15
RNU6-187P-201ENST00000384139 HMBOX1Q6NT76 420 aa1.59□□□□□ -2.15
RNU6-187P-201ENST00000384139 LRIG3Q6UXM1 1119 aa1.59□□□□□ -2.15
RNU6-187P-201ENST00000384139 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa1.59□□□□□ -2.15
RNU6-187P-201ENST00000384139 MAB21L3Q8N8X9 362 aa1.59□□□□□ -2.15
RNU6-187P-201ENST00000384139 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP1.59□□□□□ -2.15
RNU6-187P-201ENST00000384139 WDYHV1Q96HA8 205 aa1.59□□□□□ -2.15
RNU6-187P-201ENST00000384139 ZNF347Q96SE7 839 aa1.59□□□□□ -2.15
RNU6-187P-201ENST00000384139 MAP6D1Q9H9H5 199 aa1.59□□□□□ -2.15
RNU6-187P-201ENST00000384139 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP1.59□□□□□ -2.15
RNU6-187P-201ENST00000384139 ABCF2Q9UG63 623 aa1.59□□□□□ -2.15
RNU6-187P-201ENST00000384139 LAMP3Q9UQV4 416 aa1.59□□□□□ -2.15
RNU6-187P-201ENST00000384139 MEIOCA2RUB1 952 aa1.58□□□□□ -2.16
RNU6-187P-201ENST00000384139 P2RY10O00398 339 aa1.58□□□□□ -2.16
RNU6-187P-201ENST00000384139 CLGNO14967 610 aa1.58□□□□□ -2.16
RNU6-187P-201ENST00000384139 FGF17O60258 216 aa1.58□□□□□ -2.16
RNU6-187P-201ENST00000384139 AHSGP02765 367 aa1.58□□□□□ -2.16
RNU6-187P-201ENST00000384139 MCM5P33992 734 aa1.58□□□□□ -2.16
RNU6-187P-201ENST00000384139 IDUAP35475 653 aa1.58□□□□□ -2.16
RNU6-187P-201ENST00000384139 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP1.58□□□□□ -2.16
RNU6-187P-201ENST00000384139 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP1.58□□□□□ -2.16
RNU6-187P-201ENST00000384139 TRAF1Q13077 416 aa1.58□□□□□ -2.16
RNU6-187P-201ENST00000384139 CLUL1Q15846 466 aa1.58□□□□□ -2.16
RNU6-187P-201ENST00000384139 NFE2L2Q16236 605 aa1.58□□□□□ -2.16
RNU6-187P-201ENST00000384139 TTC39AQ5SRH9 613 aa1.58□□□□□ -2.16
RNU6-187P-201ENST00000384139 LIPMQ5VYY2 423 aa1.58□□□□□ -2.16
RNU6-187P-201ENST00000384139 USP17L6PQ6QN14 398 aa1.58□□□□□ -2.16
RNU6-187P-201ENST00000384139 FAM222BQ8WU58 562 aa1.58□□□□□ -2.16
RNU6-187P-201ENST00000384139 OSBPL2Q9H1P3 480 aa1.58□□□□□ -2.16
RNU6-187P-201ENST00000384139 IL25Q9H293 177 aa1.58□□□□□ -2.16
RNU6-187P-201ENST00000384139 ERVK-5Q9HDB9 667 aa1.58□□□□□ -2.16
RNU6-187P-201ENST00000384139 VTA1Q9NP79 307 aa1.58□□□□□ -2.16
RNU6-187P-201ENST00000384139 PLAAQ9Y263 795 aa1.58□□□□□ -2.16
RNU6-187P-201ENST00000384139 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa1.58□□□□□ -2.16
RNU6-187P-201ENST00000384139 RNF215Q9Y6U7 377 aa1.58□□□□□ -2.16
RNU6-187P-201ENST00000384139 HMCN1Q96RW7 5635 aa1.58□□□□□ -2.16
RNU6-187P-201ENST00000384139 C16orf96A6NNT2 1141 aa1.57□□□□□ -2.16
RNU6-187P-201ENST00000384139 TTC34A8MYJ7 566 aa1.57□□□□□ -2.16
RNU6-187P-201ENST00000384139 PRAC2D3DTV9 90 aa1.57□□□□□ -2.16
RNU6-187P-201ENST00000384139 EXOC5O00471 708 aa1.57□□□□□ -2.16
RNU6-187P-201ENST00000384139 SLC16A6O15403 523 aa1.57□□□□□ -2.16
RNU6-187P-201ENST00000384139 SLC22A3O75751 556 aa1.57□□□□□ -2.16
RNU6-187P-201ENST00000384139 AKR1A1P14550 325 aa1.57□□□□□ -2.16
RNU6-187P-201ENST00000384139 EDNRBP24530 442 aa1.57□□□□□ -2.16
RNU6-187P-201ENST00000384139 IARSP41252 1262 aaKnown RBP1.57□□□□□ -2.16
RNU6-187P-201ENST00000384139 SOX2P48431 317 aa1.57□□□□□ -2.16
RNU6-187P-201ENST00000384139 VPS41P49754 854 aa1.57□□□□□ -2.16
RNU6-187P-201ENST00000384139 DRG2P55039 364 aaKnown RBP1.57□□□□□ -2.16
RNU6-187P-201ENST00000384139 PGM5Q15124 567 aa1.57□□□□□ -2.16
RNU6-187P-201ENST00000384139 EMC10Q5UCC4 262 aa1.57□□□□□ -2.16
RNU6-187P-201ENST00000384139 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa1.57□□□□□ -2.16
RNU6-187P-201ENST00000384139 FAM198BQ6UWH4 519 aa1.57□□□□□ -2.16
RNU6-187P-201ENST00000384139 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP1.57□□□□□ -2.16
RNU6-187P-201ENST00000384139 GAS2L3Q86XJ1 694 aa1.57□□□□□ -2.16
RNU6-187P-201ENST00000384139 EPHX4Q8IUS5 362 aa1.57□□□□□ -2.16
RNU6-187P-201ENST00000384139 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP1.57□□□□□ -2.16
RNU6-187P-201ENST00000384139 CADM4Q8NFZ8 388 aa1.57□□□□□ -2.16
RNU6-187P-201ENST00000384139 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP1.57□□□□□ -2.16
RNU6-187P-201ENST00000384139 PRR34Q9NV39 138 aa1.57□□□□□ -2.16
RNU6-187P-201ENST00000384139 OGFRQ9NZT2 677 aa1.57□□□□□ -2.16
RNU6-187P-201ENST00000384139 CLIP2Q9UDT6 1046 aa1.57□□□□□ -2.16
RNU6-187P-201ENST00000384139 TUBD1Q9UJT1 453 aa1.57□□□□□ -2.16
RNU6-187P-201ENST00000384139 ASAP1Q9ULH1 1129 aa1.57□□□□□ -2.16
RNU6-187P-201ENST00000384139 MAPRE3Q9UPY8 281 aa1.57□□□□□ -2.16
RNU6-187P-201ENST00000384139 LIASO43766 372 aa1.56□□□□□ -2.16
RNU6-187P-201ENST00000384139 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP1.56□□□□□ -2.16
RNU6-187P-201ENST00000384139 PRAMEF2O60811 474 aa1.56□□□□□ -2.16
RNU6-187P-201ENST00000384139 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP1.56□□□□□ -2.16
RNU6-187P-201ENST00000384139 ITGB8P26012 769 aa1.56□□□□□ -2.16
RNU6-187P-201ENST00000384139 KLRC1P26715 233 aa1.56□□□□□ -2.16
RNU6-187P-201ENST00000384139 UQCRC1P31930 480 aa1.56□□□□□ -2.16
RNU6-187P-201ENST00000384139 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP1.56□□□□□ -2.16
RNU6-187P-201ENST00000384139 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP1.56□□□□□ -2.16
RNU6-187P-201ENST00000384139 DEUP1Q05D60 604 aa1.56□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.5 ms