RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568641.1

NLRP1-206, Transcript of NLR family pyrin domain containing 1, human

TSL 1 (best)

Gene NLRP1, Length 1,627 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NLRP1-206	ENST00000568641	BBOF1	Q8ND07	529 aa		27.56	■■■□□ 2
NLRP1-206	ENST00000568641	PDZD8	Q8NEN9	1154 aa		27.56	■■■□□ 2
NLRP1-206	ENST00000568641	PCDH19	Q8TAB3	1148 aa		27.56	■■■□□ 2
NLRP1-206	ENST00000568641	OVCA2	Q8WZ82	227 aa		27.56	■■■□□ 2
NLRP1-206	ENST00000568641	CSPG4P5	Q96PW8	444 aa		27.56	■■■□□ 2
NLRP1-206	ENST00000568641	CDK5RAP1	Q96SZ6	601 aa	Known RBP	27.56	■■■□□ 2
NLRP1-206	ENST00000568641	CXXC1	Q9P0U4	656 aa	Predicted RBP	27.56	■■■□□ 2
NLRP1-206	ENST00000568641	GMIP	Q9P107	970 aa		27.56	■■■□□ 2
NLRP1-206	ENST00000568641	ASIC3	Q9UHC3	531 aa		27.56	■■■□□ 2
NLRP1-206	ENST00000568641	TLL1	O43897	1013 aa		27.56	■■■□□ 2
NLRP1-206	ENST00000568641	SEC31A	O94979	1220 aa	Known RBP	27.56	■■■□□ 2
NLRP1-206	ENST00000568641	MYBL2	P10244	700 aa		27.56	■■■□□ 2
NLRP1-206	ENST00000568641	ELF1	P32519	619 aa		27.56	■■■□□ 2
NLRP1-206	ENST00000568641	NR2C2	P49116	596 aa		27.56	■■■□□ 2
NLRP1-206	ENST00000568641	HAUS1	Q96CS2	278 aa		27.56	■■■□□ 2
NLRP1-206	ENST00000568641	TRIM31	Q9BZY9	425 aa		27.56	■■■□□ 2
NLRP1-206	ENST00000568641	NMUR1	Q9HB89	426 aa		27.56	■■■□□ 2
NLRP1-206	ENST00000568641	CSH1	P0DML2	217 aa		27.55	■■■□□ 2
NLRP1-206	ENST00000568641	CSH2	P0DML3	217 aa		27.55	■■■□□ 2
NLRP1-206	ENST00000568641	CTSA	P10619	480 aa		27.55	■■■□□ 2
NLRP1-206	ENST00000568641	SLC2A3	P11169	496 aa		27.55	■■■□□ 2
NLRP1-206	ENST00000568641	CCR1	P32246	355 aa		27.55	■■■□□ 2
NLRP1-206	ENST00000568641	TNNT3	P45378	269 aa	Predicted RBP	27.55	■■■□□ 2
NLRP1-206	ENST00000568641	ALDH1A3	P47895	512 aa		27.55	■■■□□ 2
NLRP1-206	ENST00000568641	HCAR3	P49019	387 aa		27.55	■■■□□ 2
NLRP1-206	ENST00000568641	EIF3E	P60228	445 aa	Known RBP	27.55	■■■□□ 2
NLRP1-206	ENST00000568641	USP46	P62068	366 aa		27.55	■■■□□ 2
NLRP1-206	ENST00000568641	CALCOCO2	Q13137	446 aa		27.55	■■■□□ 2
NLRP1-206	ENST00000568641	PPP2R5D	Q14738	602 aa		27.55	■■■□□ 2
NLRP1-206	ENST00000568641	NOMO1	Q15155	1222 aa		27.55	■■■□□ 2
NLRP1-206	ENST00000568641	ALLC	Q8N6M5	410 aa		27.55	■■■□□ 2
NLRP1-206	ENST00000568641	PLD5	Q8N7P1	536 aa		27.55	■■■□□ 2
NLRP1-206	ENST00000568641	ZBP1	Q9H171	429 aa		27.55	■■■□□ 2
NLRP1-206	ENST00000568641	ZNF446	Q9NWS9	450 aa		27.55	■■■□□ 2
NLRP1-206	ENST00000568641	CWC15	Q9P013	229 aa	Known RBP	27.55	■■■□□ 2
NLRP1-206	ENST00000568641	GREB1	Q4ZG55	1949 aa		27.54	■■■□□ 2
NLRP1-206	ENST00000568641	SOAT2	O75908	522 aa		27.54	■■■□□ 2
NLRP1-206	ENST00000568641	TAF10	Q12962	218 aa		27.54	■■■□□ 2
NLRP1-206	ENST00000568641	VEPH1	Q14D04	833 aa		27.54	■■■□□ 2
NLRP1-206	ENST00000568641	TADA2B	Q86TJ2	420 aa		27.54	■■■□□ 2
NLRP1-206	ENST00000568641	PQLC3	Q8N755	202 aa		27.54	■■■□□ 2
NLRP1-206	ENST00000568641	EPAS1	Q99814	870 aa		27.54	■■■□□ 2
NLRP1-206	ENST00000568641	FAM118B	Q9BPY3	351 aa		27.54	■■■□□ 2
NLRP1-206	ENST00000568641	UBE2O	Q9C0C9	1292 aa	Known RBP	27.54	■■■□□ 2
NLRP1-206	ENST00000568641	TKTL2	Q9H0I9	626 aa		27.54	■■■□□ 2
NLRP1-206	ENST00000568641	CYP4F11	Q9HBI6	524 aa		27.54	■■■□□ 2
NLRP1-206	ENST00000568641	RXFP1	Q9HBX9	757 aa		27.54	■■■□□ 2
NLRP1-206	ENST00000568641	WHRN	Q9P202	907 aa		27.54	■■■□□ 2
NLRP1-206	ENST00000568641	LZTS1	Q9Y250	596 aa		27.54	■■■□□ 2
NLRP1-206	ENST00000568641	ZNF638	Q14966	1978 aa	Known RBP	27.53	■■■□□ 2
NLRP1-206	ENST00000568641	EEF2K	O00418	725 aa	Known RBP	27.53	■■■□□ 2
NLRP1-206	ENST00000568641	ZNF189	O75820	626 aa	Predicted RBP	27.53	■■■□□ 2
NLRP1-206	ENST00000568641	SYN1	P17600	705 aa		27.53	■■■□□ 2
NLRP1-206	ENST00000568641	ATF6	P18850	670 aa		27.53	■■■□□ 2
NLRP1-206	ENST00000568641	HTR7	P34969	479 aa		27.53	■■■□□ 2
NLRP1-206	ENST00000568641	CAV1	Q03135	178 aa		27.53	■■■□□ 2
NLRP1-206	ENST00000568641	MTA1	Q13330	715 aa		27.53	■■■□□ 2
NLRP1-206	ENST00000568641	EIF4EBP2	Q13542	120 aa	Predicted RBP	27.53	■■■□□ 2
NLRP1-206	ENST00000568641	GSPT2	Q8IYD1	628 aa	Known RBP	27.53	■■■□□ 2
NLRP1-206	ENST00000568641	SNF8	Q96H20	258 aa		27.53	■■■□□ 2
NLRP1-206	ENST00000568641	ACBD3	Q9H3P7	528 aa		27.53	■■■□□ 2
NLRP1-206	ENST00000568641	MTRF1L	Q9UGC7	380 aa	Known RBP	27.53	■■■□□ 2
NLRP1-206	ENST00000568641	SNX24	Q9Y343	169 aa		27.53	■■■□□ 2
NLRP1-206	ENST00000568641	CFAP69	A5D8W1	941 aa		27.52	■■■□□ 2
NLRP1-206	ENST00000568641	KRT14	P02533	472 aa		27.52	■■■□□ 2
NLRP1-206	ENST00000568641	ITIH2	P19823	946 aa		27.52	■■■□□ 2
NLRP1-206	ENST00000568641	PDZD4	Q76G19	769 aa	Predicted RBP	27.52	■■■□□ 2
NLRP1-206	ENST00000568641	DDX42	Q86XP3	938 aa	Known RBP eCLIP	27.52	■■■□□ 2
NLRP1-206	ENST00000568641	ZNF276	Q8N554	614 aa		27.52	■■■□□ 2
NLRP1-206	ENST00000568641	GPR152	Q8TDT2	470 aa		27.52	■■■□□ 2
NLRP1-206	ENST00000568641	RSAD2	Q8WXG1	361 aa		27.52	■■■□□ 2
NLRP1-206	ENST00000568641	HAPLN3	Q96S86	360 aa		27.52	■■■□□ 2
NLRP1-206	ENST00000568641	OSBPL2	Q9H1P3	480 aa		27.52	■■■□□ 2
NLRP1-206	ENST00000568641	ARHGEF38	Q9NXL2	777 aa		27.52	■■■□□ 2
NLRP1-206	ENST00000568641	TLR6	Q9Y2C9	796 aa		27.52	■■■□□ 2
NLRP1-206	ENST00000568641	SGK1	O00141	431 aa		27.52	■■■□□ 2
NLRP1-206	ENST00000568641	PRRG1	O14668	218 aa		27.52	■■■□□ 2
NLRP1-206	ENST00000568641	LINC00271	P0C7V0	271 aa		27.52	■■■□□ 2
NLRP1-206	ENST00000568641	RBP3	P10745	1247 aa		27.52	■■■□□ 2
NLRP1-206	ENST00000568641	RARG	P13631	454 aa		27.52	■■■□□ 2
NLRP1-206	ENST00000568641	PECAM1	P16284	738 aa	Predicted RBP	27.52	■■■□□ 2
NLRP1-206	ENST00000568641	GOT1	P17174	413 aa		27.52	■■■□□ 2
NLRP1-206	ENST00000568641	DNAJB2	P25686	324 aa		27.52	■■■□□ 2
NLRP1-206	ENST00000568641	STIP1	P31948	543 aa	Known RBP	27.52	■■■□□ 2
NLRP1-206	ENST00000568641	RPL21	P46778	160 aa	Known RBP	27.52	■■■□□ 2
NLRP1-206	ENST00000568641	PLD1	Q13393	1074 aa		27.52	■■■□□ 2
NLRP1-206	ENST00000568641	XRCC4	Q13426	336 aa		27.52	■■■□□ 2
NLRP1-206	ENST00000568641	TAF12	Q16514	161 aa		27.52	■■■□□ 2
NLRP1-206	ENST00000568641	TCEAL8	Q8IYN2	117 aa		27.52	■■■□□ 2
NLRP1-206	ENST00000568641	KLHL23	Q8NBE8	558 aa		27.52	■■■□□ 2
NLRP1-206	ENST00000568641	GIPC2	Q8TF65	315 aa		27.52	■■■□□ 2
NLRP1-206	ENST00000568641	CASP10	Q92851	521 aa		27.52	■■■□□ 2
NLRP1-206	ENST00000568641	FUT8	Q9BYC5	575 aa		27.52	■■■□□ 2
NLRP1-206	ENST00000568641	PCDH9	Q9HC56	1237 aa		27.52	■■■□□ 2
NLRP1-206	ENST00000568641	MTPAP	Q9NVV4	582 aa	Known RBP eCLIP	27.52	■■■□□ 2
NLRP1-206	ENST00000568641	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	27.52	■■■□□ 2
NLRP1-206	ENST00000568641	NEU2	Q9Y3R4	380 aa		27.52	■■■□□ 2
NLRP1-206	ENST00000568641	LILRB3	O75022	631 aa		27.51	■■□□□ 1.99
NLRP1-206	ENST00000568641	ZDHHC11B	P0C7U3	371 aa		27.51	■■□□□ 1.99
NLRP1-206	ENST00000568641	ADCY8	P40145	1251 aa		27.51	■■□□□ 1.99

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