RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556355.5

SRP54-AS1-203, Transcript of SRP54 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SRP54-AS1, Length 603 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54-AS1-203ENST00000556355 USP38Q8NB14 1042 aa4.96□□□□□ -1.62
SRP54-AS1-203ENST00000556355 SSH3Q8TE77 659 aa4.96□□□□□ -1.62
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SRP54-AS1-203ENST00000556355 HTRA1Q92743 480 aa4.96□□□□□ -1.62
SRP54-AS1-203ENST00000556355 FAM136AQ96C01 138 aa4.96□□□□□ -1.62
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SRP54-AS1-203ENST00000556355 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
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SRP54-AS1-203ENST00000556355 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa4.95□□□□□ -1.62
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SRP54-AS1-203ENST00000556355 CSF1RP07333 972 aa4.95□□□□□ -1.62
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SRP54-AS1-203ENST00000556355 GSTM5P46439 218 aa4.95□□□□□ -1.62
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SRP54-AS1-203ENST00000556355 BBS12Q6ZW61 710 aa4.95□□□□□ -1.62
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SRP54-AS1-203ENST00000556355 IZUMO1Q8IYV9 350 aa4.95□□□□□ -1.62
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SRP54-AS1-203ENST00000556355 TCP11L2Q8N4U5 519 aa4.95□□□□□ -1.62
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SRP54-AS1-203ENST00000556355 HMGB4Q8WW32 186 aa4.95□□□□□ -1.62
SRP54-AS1-203ENST00000556355 TMEM125Q96AQ2 219 aa4.95□□□□□ -1.62
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SRP54-AS1-203ENST00000556355 TMEM160Q9NX00 188 aa4.95□□□□□ -1.62
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SRP54-AS1-203ENST00000556355 PSMD9O00233 223 aa4.94□□□□□ -1.62
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SRP54-AS1-203ENST00000556355 CAPN3P20807 821 aa4.94□□□□□ -1.62
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SRP54-AS1-203ENST00000556355 TIRAPP58753 221 aa4.94□□□□□ -1.62
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SRP54-AS1-203ENST00000556355 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa4.94□□□□□ -1.62
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SRP54-AS1-203ENST00000556355 SAC3D1A6NKF1 404 aa4.93□□□□□ -1.62
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SRP54-AS1-203ENST00000556355 DHHO43323 396 aa4.93□□□□□ -1.62
SRP54-AS1-203ENST00000556355 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
SRP54-AS1-203ENST00000556355 WDR47O94967 919 aa4.93□□□□□ -1.62
SRP54-AS1-203ENST00000556355 CER1O95813 267 aa4.93□□□□□ -1.62
SRP54-AS1-203ENST00000556355 ATP1A3P13637 1013 aa4.93□□□□□ -1.62
SRP54-AS1-203ENST00000556355 CCR5P51681 352 aa4.93□□□□□ -1.62
SRP54-AS1-203ENST00000556355 DGKQP52824 942 aa4.93□□□□□ -1.62
SRP54-AS1-203ENST00000556355 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
SRP54-AS1-203ENST00000556355 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP4.93□□□□□ -1.62
SRP54-AS1-203ENST00000556355 ACOX1Q15067 660 aa4.93□□□□□ -1.62
SRP54-AS1-203ENST00000556355 ST3GAL2Q16842 350 aa4.93□□□□□ -1.62
SRP54-AS1-203ENST00000556355 NAA35Q5VZE5 725 aa4.93□□□□□ -1.62
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